14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_1315 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008261  CPF_1315  hypothetical protein  100 
 
 		 137 aa  262  1e-69  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00290766  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1131  hypothetical protein  97.81 
 
 		 137 aa  233  6e-61  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.892369  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1933  protein of unknown function DUF107  26.67 
 
 		 154 aa  60.1  0.00000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000898113 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2190  hypothetical protein  29.63 
 
 		 153 aa  53.1  0.000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00820926  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2314  protein of unknown function DUF107  29.37 
 
 		 181 aa  49.7  0.00001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3654  hypothetical protein  25.53 
 
 		 144 aa  47.8  0.00005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.642811  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1227  protein of unknown function DUF107  28.68 
 
 		 133 aa  46.6  0.0001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2309  hypothetical protein  25 
 
 		 149 aa  44.3  0.0005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01653  nodulation protein nfed, C-terminal only  24.75 
 
 		 144 aa  41.6  0.003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00439  conserved inner membrane protein  27.1 
 
 		 151 aa  41.2  0.005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00444  hypothetical protein  27.1 
 
 		 151 aa  41.2  0.005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0537  nodulation efficiency family protein  25.93 
 
 		 152 aa  40.8  0.006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01316  hypothetical protein  24.63 
 
 		 153 aa  40.8  0.007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0592  nodulation efficiency family protein  25 
 
 		 152 aa  40.4  0.009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.685146 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>