64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_21700 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_21700  membrane protein implicated in regulation of membrane protease activity  100 
 
 		 154 aa  289  9e-78  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.201609  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1428  protein of unknown function DUF107  52.63 
 
 		 152 aa  123  1e-27  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2052  protein of unknown function DUF107  54.68 
 
 		 157 aa  117  6e-26  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2314  protein of unknown function DUF107  52.21 
 
 		 181 aa  115  1.9999999999999998e-25  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18360  membrane protein implicated in regulation of membrane protease activity  48.57 
 
 		 141 aa  102  1e-21  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.54278  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2226  putative integral membrane protein  47.2 
 
 		 146 aa  90.5  8e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1351  hypothetical protein  48.25 
 
 		 144 aa  88.2  3e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.927831  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1335  hypothetical protein  42.75 
 
 		 154 aa  83.2  0.000000000000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3088  protein of unknown function DUF107  47.37 
 
 		 160 aa  83.6  0.000000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.020627 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2311  protein of unknown function DUF107  44.93 
 
 		 143 aa  81.3  0.000000000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00380708  hitchhiker  0.000930423 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1933  protein of unknown function DUF107  39.13 
 
 		 154 aa  80.9  0.000000000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000898113 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1178  protein of unknown function DUF107  48.23 
 
 		 142 aa  80.5  0.000000000000009  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.463854  hitchhiker  0.00363544 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3654  hypothetical protein  42.03 
 
 		 144 aa  79.7  0.00000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.642811  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2577  hypothetical protein  41.13 
 
 		 153 aa  79.3  0.00000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.869725  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19790  membrane protein implicated in regulation of membrane protease activity  38.24 
 
 		 143 aa  71.6  0.000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000333903 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2110  protein of unknown function DUF107  41.55 
 
 		 147 aa  71.6  0.000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3019  hypothetical protein  42.31 
 
 		 167 aa  72  0.000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.336534  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2190  hypothetical protein  41.91 
 
 		 153 aa  71.2  0.000000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00820926  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11516  hypothetical protein  44.44 
 
 		 144 aa  71.2  0.000000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.145618 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3440  protein of unknown function DUF107  43.45 
 
 		 146 aa  70.9  0.000000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.782019  normal  0.877312 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0361  hypothetical protein  33.33 
 
 		 141 aa  70.5  0.000000000007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.213386 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2309  hypothetical protein  31.29 
 
 		 149 aa  68.9  0.00000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3245  hypothetical protein  41.03 
 
 		 156 aa  68.2  0.00000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2413  protein of unknown function DUF107  42.39 
 
 		 141 aa  67.8  0.00000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3420  protein of unknown function DUF107  40.6 
 
 		 143 aa  65.5  0.0000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3263  hypothetical protein  37.86 
 
 		 143 aa  65.5  0.0000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.154765  normal  0.527503 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3138  hypothetical protein  41.3 
 
 		 144 aa  62.8  0.000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.293022  normal  0.761623 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3127  hypothetical protein  41.3 
 
 		 144 aa  62.8  0.000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3188  hypothetical protein  41.3 
 
 		 144 aa  62.8  0.000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.258766 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14650  membrane protein implicated in regulation of membrane protease activity  29.71 
 
 		 144 aa  62  0.000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000389934  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1155  hypothetical protein  36.88 
 
 		 143 aa  60.5  0.000000008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.21889  normal  0.55377 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2090  protein of unknown function DUF107  38.52 
 
 		 143 aa  58.2  0.00000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0177163  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2758  hypothetical protein  44.63 
 
 		 144 aa  56.6  0.0000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.282751 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4808  protein of unknown function DUF107  42.39 
 
 		 143 aa  55.8  0.0000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2314  protein of unknown function DUF107  38.54 
 
 		 142 aa  56.2  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0062  hypothetical protein  30.28 
 
 		 140 aa  54.7  0.0000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.351134  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0062  hypothetical protein  30.28 
 
 		 140 aa  54.3  0.0000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0560345  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2500  hypothetical protein  41.43 
 
 		 144 aa  54.3  0.0000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.492618  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2940  hypothetical protein  36.76 
 
 		 146 aa  53.5  0.000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00270236  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8849  protein of unknown function DUF107  36.23 
 
 		 144 aa  50.4  0.000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3005  protein of unknown function DUF107  28.47 
 
 		 144 aa  50.4  0.000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0728  hypothetical protein  25.85 
 
 		 152 aa  49.7  0.00001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1227  protein of unknown function DUF107  27.03 
 
 		 133 aa  49.7  0.00001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1505  hypothetical protein  28.97 
 
 		 147 aa  48.1  0.00004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.121654  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1315  hypothetical protein  20.74 
 
 		 137 aa  45.8  0.0002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00290766  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3685  protein of unknown function DUF107  39.44 
 
 		 143 aa  45.8  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.384963 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1329  hypothetical protein  24.62 
 
 		 136 aa  44.7  0.0005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.259806  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0880  hypothetical protein  36.96 
 
 		 140 aa  44.7  0.0005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0306317  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12030  membrane protein implicated in regulation of membrane protease activity  40.14 
 
 		 158 aa  44.3  0.0006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0225473  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0931  protein of unknown function DUF107  36.96 
 
 		 140 aa  42.7  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.890886  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0928  protein of unknown function DUF107  36.23 
 
 		 140 aa  42.4  0.002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4625  hypothetical protein  28.86 
 
 		 145 aa  42.7  0.002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.165584 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000357  nfed family protein  30.61 
 
 		 458 aa  42.4  0.002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3721  hypothetical protein  31.72 
 
 		 152 aa  42  0.003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0401  hypothetical protein  36.23 
 
 		 460 aa  42  0.003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.680727  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0414  hypothetical protein  30.72 
 
 		 155 aa  42.4  0.003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0427482  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1495  protein of unknown function DUF107  41.25 
 
 		 471 aa  42  0.003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1590  protein of unknown function DUF107  41.25 
 
 		 471 aa  42  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2216  hypothetical protein  28.87 
 
 		 148 aa  41.6  0.004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  decreased coverage  0.00884783  normal  0.106638 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1454  hypothetical protein  27.94 
 
 		 144 aa  41.6  0.004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.348394 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0403  hypothetical protein  29.79 
 
 		 143 aa  41.2  0.005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.168649 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1621  hypothetical protein  25.83 
 
 		 147 aa  41.6  0.005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000165212  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4711  hypothetical protein  28.08 
 
 		 145 aa  40.8  0.006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.396133 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1501  hypothetical protein  38.1 
 
 		 452 aa  40.4  0.009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0487319  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>