35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_0701 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008148  Rxyl_0701  hypothetical protein  100 
 
 		 157 aa  300  4.0000000000000003e-81  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1335  hypothetical protein  32.33 
 
 		 154 aa  67.4  0.00000000008  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18360  membrane protein implicated in regulation of membrane protease activity  35.46 
 
 		 141 aa  63.9  0.0000000009  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.54278  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2309  hypothetical protein  33.09 
 
 		 149 aa  63.2  0.000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3019  hypothetical protein  34.21 
 
 		 167 aa  62.4  0.000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.336534  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3245  hypothetical protein  36.36 
 
 		 156 aa  61.6  0.000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2577  hypothetical protein  34.53 
 
 		 153 aa  59.3  0.00000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.869725  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0062  hypothetical protein  30.71 
 
 		 140 aa  57.4  0.00000008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0560345  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2110  protein of unknown function DUF107  34.29 
 
 		 147 aa  57.4  0.00000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0062  hypothetical protein  30.71 
 
 		 140 aa  57  0.00000009  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.351134  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1351  hypothetical protein  31.76 
 
 		 144 aa  55.5  0.0000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.927831  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3263  hypothetical protein  35.92 
 
 		 143 aa  53.9  0.0000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.154765  normal  0.527503 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3440  protein of unknown function DUF107  37.24 
 
 		 146 aa  53.5  0.000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.782019  normal  0.877312 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0052  protein of unknown function DUF107  32.24 
 
 		 158 aa  53.5  0.000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2413  protein of unknown function DUF107  34.65 
 
 		 141 aa  52.4  0.000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3654  hypothetical protein  35.17 
 
 		 144 aa  51.6  0.000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.642811  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2226  putative integral membrane protein  31.58 
 
 		 146 aa  50.8  0.000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2314  protein of unknown function DUF107  40 
 
 		 142 aa  50.8  0.000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3685  protein of unknown function DUF107  37.14 
 
 		 143 aa  47.8  0.00007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.384963 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1933  protein of unknown function DUF107  32.62 
 
 		 154 aa  46.6  0.0001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000898113 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14650  membrane protein implicated in regulation of membrane protease activity  28.23 
 
 		 144 aa  46.6  0.0001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000389934  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0916  hypothetical protein  34.23 
 
 		 125 aa  45.1  0.0004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2314  protein of unknown function DUF107  30.77 
 
 		 181 aa  44.7  0.0005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2052  protein of unknown function DUF107  32.37 
 
 		 157 aa  44.3  0.0006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2190  hypothetical protein  32.33 
 
 		 153 aa  44.3  0.0007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00820926  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8849  protein of unknown function DUF107  36.3 
 
 		 144 aa  43.5  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0728  hypothetical protein  25.83 
 
 		 152 aa  42.7  0.002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0690  protein of unknown function DUF107  26.06 
 
 		 152 aa  42.7  0.002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.967214  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0934  hypothetical protein  33.33 
 
 		 139 aa  42  0.003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.31168 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0118  hypothetical protein  32.87 
 
 		 488 aa  41.6  0.004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1879  hypothetical protein  29.41 
 
 		 142 aa  41.6  0.004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2173  hypothetical protein  29.41 
 
 		 142 aa  41.2  0.005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2145  hypothetical protein  29.41 
 
 		 142 aa  41.2  0.005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1155  hypothetical protein  31.25 
 
 		 143 aa  40.8  0.006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.21889  normal  0.55377 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2767  nodulation efficiency protein NfeD  32.21 
 
 		 464 aa  40.4  0.01  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>