30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A2cp1_0931 on replicon NC_011891
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011891  A2cp1_0931  protein of unknown function DUF107  100 
 
 
140 aa  257  4e-68  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.890886  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0928  protein of unknown function DUF107  99.29 
 
 
140 aa  257  5.0000000000000005e-68  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0880  hypothetical protein  95 
 
 
140 aa  218  3e-56  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0306317  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0934  hypothetical protein  72.66 
 
 
139 aa  136  7.999999999999999e-32  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.31168 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3005  protein of unknown function DUF107  31.88 
 
 
144 aa  79.3  0.00000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1335  hypothetical protein  35.77 
 
 
154 aa  65.1  0.0000000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0062  hypothetical protein  33.33 
 
 
140 aa  58.9  0.00000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0560345  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0062  hypothetical protein  33.33 
 
 
140 aa  58.9  0.00000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.351134  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4625  hypothetical protein  30.28 
 
 
145 aa  57  0.00000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.165584 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2309  hypothetical protein  32.88 
 
 
149 aa  55.5  0.0000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1621  hypothetical protein  30.07 
 
 
147 aa  54.3  0.0000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000165212  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4889  hypothetical protein  30.28 
 
 
145 aa  54.3  0.0000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0908212  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0728  hypothetical protein  28.26 
 
 
152 aa  52.8  0.000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4833  SURF1 domain-containing protein  28.87 
 
 
143 aa  50.4  0.000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.474537  normal  0.511856 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4711  hypothetical protein  30.28 
 
 
145 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.396133 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1505  hypothetical protein  29.22 
 
 
147 aa  49.3  0.00002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.121654  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1933  protein of unknown function DUF107  33.33 
 
 
154 aa  49.3  0.00002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000898113 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0403  hypothetical protein  31.39 
 
 
143 aa  47.8  0.00005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.168649 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1329  hypothetical protein  27.48 
 
 
136 aa  45.1  0.0003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.259806  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004151  putative activity regulator of membrane protease YbbK  28.26 
 
 
153 aa  44.7  0.0004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0361  hypothetical protein  26.43 
 
 
141 aa  43.1  0.001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.213386 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01316  hypothetical protein  32.86 
 
 
153 aa  42.7  0.001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1879  hypothetical protein  23.38 
 
 
160 aa  42.7  0.002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0165803  normal  0.0358717 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0648  membrane protein implicated in regulation of membrane protease activity, NfeD-like  29.14 
 
 
150 aa  42  0.003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.24585  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0138  protein of unknown function DUF107  27.59 
 
 
151 aa  42  0.003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0462  hypothetical protein  30 
 
 
159 aa  41.2  0.004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2190  hypothetical protein  31.85 
 
 
153 aa  40.8  0.006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00820926  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18360  membrane protein implicated in regulation of membrane protease activity  35.04 
 
 
141 aa  40.4  0.007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.54278  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0261  hypothetical protein  27.59 
 
 
146 aa  40.4  0.008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14650  membrane protein implicated in regulation of membrane protease activity  28.06 
 
 
144 aa  40.4  0.009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000389934  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>