29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeh_0880 on replicon NC_007760
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007760  Adeh_0880  hypothetical protein  100 
 
 
140 aa  258  3e-68  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0306317  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0931  protein of unknown function DUF107  95 
 
 
140 aa  217  3.9999999999999997e-56  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.890886  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0928  protein of unknown function DUF107  94.29 
 
 
140 aa  217  5e-56  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0934  hypothetical protein  74.1 
 
 
139 aa  142  1e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.31168 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3005  protein of unknown function DUF107  32.61 
 
 
144 aa  81.6  0.000000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1335  hypothetical protein  33.82 
 
 
154 aa  64.7  0.0000000005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0062  hypothetical protein  32.58 
 
 
140 aa  58.9  0.00000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0560345  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0062  hypothetical protein  32.58 
 
 
140 aa  58.9  0.00000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.351134  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2309  hypothetical protein  32.88 
 
 
149 aa  57.4  0.00000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0728  hypothetical protein  28.99 
 
 
152 aa  57.4  0.00000007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1621  hypothetical protein  30.07 
 
 
147 aa  56.2  0.0000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000165212  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4625  hypothetical protein  28.47 
 
 
145 aa  53.9  0.0000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.165584 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1933  protein of unknown function DUF107  33.33 
 
 
154 aa  51.6  0.000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000898113 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0403  hypothetical protein  33.58 
 
 
143 aa  51.2  0.000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.168649 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4889  hypothetical protein  29.17 
 
 
145 aa  51.2  0.000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0908212  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4833  SURF1 domain-containing protein  29.17 
 
 
143 aa  50.8  0.000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.474537  normal  0.511856 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4711  hypothetical protein  29.86 
 
 
145 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.396133 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1505  hypothetical protein  29.93 
 
 
147 aa  49.7  0.00001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.121654  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1329  hypothetical protein  27.48 
 
 
136 aa  45.1  0.0003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.259806  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004151  putative activity regulator of membrane protease YbbK  27.54 
 
 
153 aa  44.3  0.0006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0361  hypothetical protein  24.64 
 
 
141 aa  43.1  0.001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.213386 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01316  hypothetical protein  31.91 
 
 
153 aa  43.5  0.001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0083  hypothetical protein  33.33 
 
 
145 aa  43.1  0.001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0908948  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2190  hypothetical protein  31.85 
 
 
153 aa  42.4  0.002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00820926  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18360  membrane protein implicated in regulation of membrane protease activity  35.77 
 
 
141 aa  42.4  0.002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.54278  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1571  protein of unknown function DUF107  33.88 
 
 
159 aa  41.6  0.004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.704744  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0462  hypothetical protein  30.77 
 
 
159 aa  41.2  0.005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14650  membrane protein implicated in regulation of membrane protease activity  27.34 
 
 
144 aa  41.2  0.005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000389934  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2736  hypothetical protein  33.09 
 
 
153 aa  40.8  0.006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.355478  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>