53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_1454 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007973  Rmet_1454  hypothetical protein  100 
 
 		 144 aa  281  2.0000000000000002e-75  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.348394 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1863  hypothetical protein  75.36 
 
 		 141 aa  160  5.0000000000000005e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1363  protein of unknown function DUF107  59.42 
 
 		 141 aa  147  3e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0778838  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1422  hypothetical protein  62.69 
 
 		 142 aa  136  8.999999999999999e-32  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.14104  decreased coverage  0.00104227 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1299  protein of unknown function DUF107  59.71 
 
 		 141 aa  127  6e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5311  hypothetical protein  52.17 
 
 		 144 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.03679  normal  0.249552 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1305  NfeD family protein  52.52 
 
 		 144 aa  114  6e-25  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.243451  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2034  NfeD family protein  52.52 
 
 		 144 aa  114  6e-25  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.10928  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3278  NfeD family protein  52.52 
 
 		 144 aa  114  6e-25  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.829792  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2414  NfeD family protein  52.52 
 
 		 144 aa  114  6e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.373398  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2469  NfeD family protein  52.52 
 
 		 144 aa  114  6e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1534  hypothetical protein  52.52 
 
 		 144 aa  114  6e-25  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.263847  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2560  nodulation efficiency protein D  52.52 
 
 		 144 aa  114  6e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2047  hypothetical protein  51.08 
 
 		 144 aa  113  6.9999999999999995e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0101752  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1903  hypothetical protein  52.9 
 
 		 144 aa  112  1.0000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2034  hypothetical protein  52.17 
 
 		 144 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.138969  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1320  hypothetical protein  51.05 
 
 		 150 aa  111  3e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.384464  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6076  hypothetical protein  52.17 
 
 		 144 aa  110  9e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2001  hypothetical protein  52.17 
 
 		 144 aa  110  9e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.812205  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2021  hypothetical protein  52.17 
 
 		 144 aa  110  9e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.348502  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1275  hypothetical protein  52.46 
 
 		 144 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.815122 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3258  hypothetical protein  47.55 
 
 		 147 aa  102  1e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.524127 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1700  hypothetical protein  54.29 
 
 		 155 aa  97.8  5e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.248871  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2437  protein of unknown function DUF107  54.14 
 
 		 151 aa  94  6e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0086298  normal  0.0411134 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2963  hypothetical protein  42.14 
 
 		 141 aa  94  6e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.154131  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3499  hypothetical protein  39.72 
 
 		 141 aa  90.5  8e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0413131 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2125  hypothetical protein  44.29 
 
 		 141 aa  90.1  8e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.128662  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2021  hypothetical protein  36.17 
 
 		 142 aa  81.3  0.000000000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.255505  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1885  hypothetical protein  42.66 
 
 		 143 aa  79.3  0.00000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0298787 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2763  hypothetical protein  42.65 
 
 		 143 aa  76.3  0.0000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.71581  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2414  hypothetical protein  37.59 
 
 		 142 aa  76.3  0.0000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.682077  normal  0.513903 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2253  hypothetical protein  42.65 
 
 		 143 aa  76.3  0.0000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1926  hypothetical protein  38.81 
 
 		 142 aa  74.7  0.0000000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00785571 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2737  hypothetical protein  41.67 
 
 		 141 aa  69.7  0.00000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.294707  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2220  hypothetical protein  33.1 
 
 		 153 aa  50.8  0.000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.0134246 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2105  hypothetical protein  25.87 
 
 		 142 aa  46.2  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1889  hypothetical protein  25.87 
 
 		 142 aa  46.2  0.0002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3244  hypothetical protein  28.95 
 
 		 142 aa  45.4  0.0003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00265616  normal  0.45038 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2074  hypothetical protein  25.87 
 
 		 142 aa  45.1  0.0003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1927  hypothetical protein  25.87 
 
 		 142 aa  45.1  0.0003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2063  hypothetical protein  28.95 
 
 		 142 aa  44.3  0.0005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00757659  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2500  hypothetical protein  35.17 
 
 		 144 aa  43.9  0.0007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.492618  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2173  hypothetical protein  25.52 
 
 		 142 aa  43.1  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1923  hypothetical protein  34.33 
 
 		 142 aa  43.1  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.126265  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1559  hypothetical protein  26.55 
 
 		 142 aa  43.1  0.001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.151405  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2145  hypothetical protein  25.52 
 
 		 142 aa  43.1  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2309  hypothetical protein  28.76 
 
 		 149 aa  42.7  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1879  hypothetical protein  28.07 
 
 		 142 aa  42.7  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4420  hypothetical protein  28.87 
 
 		 151 aa  41.6  0.004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2577  hypothetical protein  29.79 
 
 		 153 aa  41.2  0.005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.869725  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0728  hypothetical protein  24.82 
 
 		 152 aa  40.8  0.006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2457  protein of unknown function DUF107  30.65 
 
 		 153 aa  40.4  0.009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0338057  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2835  hypothetical protein  30.65 
 
 		 153 aa  40.4  0.009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>