37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_2125 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_2125  hypothetical protein  100 
 
 		 141 aa  276  7e-74  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.128662  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3499  hypothetical protein  55.4 
 
 		 141 aa  152  1e-36  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0413131 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3258  hypothetical protein  56.94 
 
 		 147 aa  150  5.9999999999999996e-36  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.524127 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2963  hypothetical protein  53.9 
 
 		 141 aa  150  8e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.154131  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2414  hypothetical protein  54.93 
 
 		 142 aa  145  2.0000000000000003e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.682077  normal  0.513903 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2737  hypothetical protein  60 
 
 		 141 aa  129  1.0000000000000001e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.294707  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2021  hypothetical protein  51.41 
 
 		 142 aa  127  6e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.255505  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2253  hypothetical protein  50 
 
 		 143 aa  115  9.999999999999999e-26  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2763  hypothetical protein  50 
 
 		 143 aa  115  9.999999999999999e-26  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.71581  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1926  hypothetical protein  50.36 
 
 		 142 aa  114  3e-25  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00785571 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1454  hypothetical protein  44.29 
 
 		 144 aa  109  1.0000000000000001e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.348394 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1363  protein of unknown function DUF107  46.38 
 
 		 141 aa  105  2e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0778838  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1885  hypothetical protein  48.61 
 
 		 143 aa  94.7  4e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0298787 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1422  hypothetical protein  44.2 
 
 		 142 aa  91.7  3e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.14104  decreased coverage  0.00104227 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1299  protein of unknown function DUF107  45.65 
 
 		 141 aa  89  2e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1320  hypothetical protein  41.48 
 
 		 150 aa  86.3  1e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.384464  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2047  hypothetical protein  41.35 
 
 		 144 aa  82.8  0.000000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0101752  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1700  hypothetical protein  45.86 
 
 		 155 aa  81.6  0.000000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.248871  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1305  NfeD family protein  41.35 
 
 		 144 aa  81.3  0.000000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.243451  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2469  NfeD family protein  41.35 
 
 		 144 aa  81.3  0.000000000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2034  NfeD family protein  41.35 
 
 		 144 aa  81.3  0.000000000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.10928  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2414  NfeD family protein  41.35 
 
 		 144 aa  81.3  0.000000000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.373398  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3278  NfeD family protein  41.35 
 
 		 144 aa  81.3  0.000000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.829792  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2560  nodulation efficiency protein D  41.35 
 
 		 144 aa  81.3  0.000000000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1534  hypothetical protein  41.35 
 
 		 144 aa  81.3  0.000000000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.263847  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5311  hypothetical protein  37.68 
 
 		 144 aa  80.5  0.000000000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.03679  normal  0.249552 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2437  protein of unknown function DUF107  47.37 
 
 		 151 aa  80.1  0.00000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0086298  normal  0.0411134 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1863  hypothetical protein  42.03 
 
 		 141 aa  79.7  0.00000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2034  hypothetical protein  39.34 
 
 		 144 aa  71.6  0.000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.138969  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1903  hypothetical protein  38.52 
 
 		 144 aa  71.2  0.000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2001  hypothetical protein  37.7 
 
 		 144 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.812205  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1275  hypothetical protein  39.34 
 
 		 144 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.815122 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2021  hypothetical protein  37.7 
 
 		 144 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.348502  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6076  hypothetical protein  37.7 
 
 		 144 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1351  hypothetical protein  34.19 
 
 		 144 aa  45.1  0.0004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.927831  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2220  hypothetical protein  32.62 
 
 		 153 aa  43.9  0.0007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.0134246 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0062  hypothetical protein  28.38 
 
 		 140 aa  40  0.01  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0560345  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>