40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_3258 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008752  Aave_3258  hypothetical protein  100 
 
 
147 aa  287  4e-77  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.524127 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2963  hypothetical protein  61.81 
 
 
141 aa  166  1e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.154131  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3499  hypothetical protein  55.86 
 
 
141 aa  154  3e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0413131 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2125  hypothetical protein  56.94 
 
 
141 aa  145  2.0000000000000003e-34  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.128662  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2414  hypothetical protein  56.94 
 
 
142 aa  141  3e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.682077  normal  0.513903 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2021  hypothetical protein  54.17 
 
 
142 aa  132  1.9999999999999998e-30  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.255505  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2737  hypothetical protein  60.42 
 
 
141 aa  126  1.0000000000000001e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.294707  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2763  hypothetical protein  60 
 
 
143 aa  124  3e-28  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.71581  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2253  hypothetical protein  60 
 
 
143 aa  124  3e-28  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1454  hypothetical protein  47.55 
 
 
144 aa  112  1.0000000000000001e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.348394 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1363  protein of unknown function DUF107  50.35 
 
 
141 aa  112  2.0000000000000002e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0778838  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1926  hypothetical protein  50.71 
 
 
142 aa  103  8e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00785571 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1422  hypothetical protein  50.35 
 
 
142 aa  95.1  3e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.14104  decreased coverage  0.00104227 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5311  hypothetical protein  44.14 
 
 
144 aa  90.9  5e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.03679  normal  0.249552 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1320  hypothetical protein  43.92 
 
 
150 aa  90.1  8e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.384464  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1885  hypothetical protein  48.61 
 
 
143 aa  87.4  6e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0298787 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1299  protein of unknown function DUF107  48.95 
 
 
141 aa  85.5  2e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2034  hypothetical protein  48.06 
 
 
144 aa  83.6  9e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.138969  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1903  hypothetical protein  47.29 
 
 
144 aa  83.2  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1863  hypothetical protein  47.55 
 
 
141 aa  83.2  0.000000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2414  NfeD family protein  45.71 
 
 
144 aa  82.4  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.373398  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1305  NfeD family protein  45.71 
 
 
144 aa  82.4  0.000000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.243451  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2469  NfeD family protein  45.71 
 
 
144 aa  82.4  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3278  NfeD family protein  45.71 
 
 
144 aa  82.4  0.000000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.829792  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1534  hypothetical protein  45.71 
 
 
144 aa  82.4  0.000000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.263847  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2034  NfeD family protein  45.71 
 
 
144 aa  82.4  0.000000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.10928  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2560  nodulation efficiency protein D  45.71 
 
 
144 aa  82.4  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2047  hypothetical protein  45 
 
 
144 aa  82.4  0.000000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0101752  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1275  hypothetical protein  48.06 
 
 
144 aa  80.5  0.000000000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.815122 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6076  hypothetical protein  44.96 
 
 
144 aa  79.3  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2021  hypothetical protein  44.96 
 
 
144 aa  79.3  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.348502  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2001  hypothetical protein  44.96 
 
 
144 aa  79.3  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.812205  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1700  hypothetical protein  42.55 
 
 
155 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.248871  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2437  protein of unknown function DUF107  43.97 
 
 
151 aa  70.9  0.000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0086298  normal  0.0411134 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1927  hypothetical protein  28.57 
 
 
142 aa  41.6  0.004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2074  hypothetical protein  28.57 
 
 
142 aa  41.6  0.004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3005  protein of unknown function DUF107  28.8 
 
 
144 aa  41.2  0.005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2105  hypothetical protein  28.57 
 
 
142 aa  40.8  0.006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1889  hypothetical protein  28.57 
 
 
142 aa  40.8  0.006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2220  hypothetical protein  31.15 
 
 
153 aa  40.4  0.007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.0134246 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>