35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_2737 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_2737  hypothetical protein  100 
 
 		 141 aa  273  8e-73  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.294707  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2963  hypothetical protein  58.57 
 
 		 141 aa  160  8.000000000000001e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.154131  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3499  hypothetical protein  56.83 
 
 		 141 aa  157  3e-38  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0413131 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3258  hypothetical protein  60.42 
 
 		 147 aa  149  1e-35  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.524127 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2125  hypothetical protein  60 
 
 		 141 aa  147  4e-35  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.128662  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2414  hypothetical protein  53.9 
 
 		 142 aa  142  1e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.682077  normal  0.513903 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2763  hypothetical protein  57.35 
 
 		 143 aa  137  6e-32  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.71581  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2253  hypothetical protein  57.35 
 
 		 143 aa  137  6e-32  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2021  hypothetical protein  47.55 
 
 		 142 aa  121  3e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.255505  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1926  hypothetical protein  51.11 
 
 		 142 aa  108  3e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00785571 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1454  hypothetical protein  43.75 
 
 		 144 aa  97.1  8e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.348394 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1363  protein of unknown function DUF107  43.88 
 
 		 141 aa  87.4  6e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0778838  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1885  hypothetical protein  42.66 
 
 		 143 aa  87  9e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0298787 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1422  hypothetical protein  44.2 
 
 		 142 aa  82.4  0.000000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.14104  decreased coverage  0.00104227 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1320  hypothetical protein  43.7 
 
 		 150 aa  77  0.00000000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.384464  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5311  hypothetical protein  39.86 
 
 		 144 aa  73.9  0.0000000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.03679  normal  0.249552 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1299  protein of unknown function DUF107  43.88 
 
 		 141 aa  73.2  0.000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2034  hypothetical protein  42.15 
 
 		 144 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.138969  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1903  hypothetical protein  41.32 
 
 		 144 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1863  hypothetical protein  39.13 
 
 		 141 aa  67.4  0.00000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1700  hypothetical protein  44.36 
 
 		 155 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.248871  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2047  hypothetical protein  37.68 
 
 		 144 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0101752  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2437  protein of unknown function DUF107  44.36 
 
 		 151 aa  63.9  0.0000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0086298  normal  0.0411134 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1275  hypothetical protein  39.67 
 
 		 144 aa  63.5  0.0000000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.815122 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2021  hypothetical protein  40.5 
 
 		 144 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.348502  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2034  NfeD family protein  37.68 
 
 		 144 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.10928  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1305  NfeD family protein  37.68 
 
 		 144 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.243451  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2469  NfeD family protein  37.68 
 
 		 144 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2414  NfeD family protein  37.68 
 
 		 144 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.373398  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3278  NfeD family protein  37.68 
 
 		 144 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.829792  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2001  hypothetical protein  40.5 
 
 		 144 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.812205  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6076  hypothetical protein  40.5 
 
 		 144 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2560  nodulation efficiency protein D  37.68 
 
 		 144 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1534  hypothetical protein  37.68 
 
 		 144 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.263847  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2220  hypothetical protein  32.09 
 
 		 153 aa  46.6  0.0001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.0134246 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>