46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_1885 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_1885  hypothetical protein  100 
 
 		 143 aa  286  8e-77  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0298787 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1926  hypothetical protein  58.7 
 
 		 142 aa  129  2.0000000000000002e-29  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00785571 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2414  hypothetical protein  48.95 
 
 		 142 aa  124  3e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.682077  normal  0.513903 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2021  hypothetical protein  51.05 
 
 		 142 aa  122  2e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.255505  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3499  hypothetical protein  43.66 
 
 		 141 aa  116  9e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0413131 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2125  hypothetical protein  48.25 
 
 		 141 aa  112  2.0000000000000002e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.128662  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2963  hypothetical protein  45.45 
 
 		 141 aa  109  1.0000000000000001e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.154131  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3258  hypothetical protein  49.31 
 
 		 147 aa  107  5e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.524127 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1454  hypothetical protein  42.66 
 
 		 144 aa  103  6e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.348394 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2253  hypothetical protein  51.09 
 
 		 143 aa  100  5e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2763  hypothetical protein  51.09 
 
 		 143 aa  100  5e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.71581  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5311  hypothetical protein  44.76 
 
 		 144 aa  94.4  5e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.03679  normal  0.249552 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3278  NfeD family protein  44.06 
 
 		 144 aa  89.4  2e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.829792  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2414  NfeD family protein  44.06 
 
 		 144 aa  89.4  2e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.373398  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2560  nodulation efficiency protein D  44.06 
 
 		 144 aa  89.4  2e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2469  NfeD family protein  44.06 
 
 		 144 aa  89.4  2e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2034  NfeD family protein  44.06 
 
 		 144 aa  89.4  2e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.10928  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1534  hypothetical protein  44.06 
 
 		 144 aa  89.4  2e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.263847  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1305  NfeD family protein  44.06 
 
 		 144 aa  89.4  2e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.243451  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1363  protein of unknown function DUF107  40.43 
 
 		 141 aa  86.7  1e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0778838  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2737  hypothetical protein  42.66 
 
 		 141 aa  85.1  3e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.294707  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1320  hypothetical protein  41.01 
 
 		 150 aa  84.7  4e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.384464  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2047  hypothetical protein  41.26 
 
 		 144 aa  80.9  0.000000000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0101752  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1863  hypothetical protein  45.59 
 
 		 141 aa  79.3  0.00000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2001  hypothetical protein  44.88 
 
 		 144 aa  77.4  0.00000000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.812205  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6076  hypothetical protein  44.88 
 
 		 144 aa  77.4  0.00000000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2021  hypothetical protein  44.88 
 
 		 144 aa  77.4  0.00000000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.348502  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1903  hypothetical protein  42.4 
 
 		 144 aa  77  0.00000000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2034  hypothetical protein  42.4 
 
 		 144 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.138969  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1275  hypothetical protein  41.13 
 
 		 144 aa  74.3  0.0000000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.815122 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1422  hypothetical protein  39.04 
 
 		 142 aa  73.6  0.0000000000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.14104  decreased coverage  0.00104227 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1299  protein of unknown function DUF107  39.86 
 
 		 141 aa  67  0.00000000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1700  hypothetical protein  37.96 
 
 		 155 aa  63.9  0.0000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.248871  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2437  protein of unknown function DUF107  38.69 
 
 		 151 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0086298  normal  0.0411134 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1351  hypothetical protein  29.86 
 
 		 144 aa  48.5  0.00003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.927831  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2309  hypothetical protein  36.61 
 
 		 149 aa  46.2  0.0001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2220  hypothetical protein  31.16 
 
 		 153 aa  45.1  0.0003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.0134246 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2074  hypothetical protein  24.83 
 
 		 142 aa  43.9  0.0007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1927  hypothetical protein  24.83 
 
 		 142 aa  43.9  0.0007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1889  hypothetical protein  24.83 
 
 		 142 aa  43.5  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2105  hypothetical protein  24.83 
 
 		 142 aa  43.5  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1879  hypothetical protein  27.64 
 
 		 142 aa  41.6  0.004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2577  hypothetical protein  37.17 
 
 		 153 aa  41.2  0.004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.869725  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2173  hypothetical protein  27.64 
 
 		 142 aa  41.2  0.005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2063  hypothetical protein  28.91 
 
 		 142 aa  41.2  0.005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00757659  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2145  hypothetical protein  27.64 
 
 		 142 aa  41.2  0.005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>