36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_A1863 on replicon NC_007347
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007347  Reut_A1863  hypothetical protein  100 
 
 		 141 aa  270  4.0000000000000004e-72  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1454  hypothetical protein  75.36 
 
 		 144 aa  207  4e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.348394 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1363  protein of unknown function DUF107  61.7 
 
 		 141 aa  145  2.0000000000000003e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0778838  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1422  hypothetical protein  60.71 
 
 		 142 aa  129  2.0000000000000002e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.14104  decreased coverage  0.00104227 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1299  protein of unknown function DUF107  62.41 
 
 		 141 aa  120  8e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5311  hypothetical protein  49.65 
 
 		 144 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.03679  normal  0.249552 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1320  hypothetical protein  49.26 
 
 		 150 aa  107  5e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.384464  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1534  hypothetical protein  49.63 
 
 		 144 aa  105  2e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.263847  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1305  NfeD family protein  49.63 
 
 		 144 aa  105  2e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.243451  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2469  NfeD family protein  49.63 
 
 		 144 aa  105  2e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2414  NfeD family protein  49.63 
 
 		 144 aa  105  2e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.373398  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3278  NfeD family protein  49.63 
 
 		 144 aa  105  2e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.829792  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2034  NfeD family protein  49.63 
 
 		 144 aa  105  2e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.10928  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2560  nodulation efficiency protein D  49.63 
 
 		 144 aa  105  2e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2047  hypothetical protein  48.15 
 
 		 144 aa  104  3e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0101752  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1903  hypothetical protein  48.23 
 
 		 144 aa  104  4e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2034  hypothetical protein  47.52 
 
 		 144 aa  103  6e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.138969  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2001  hypothetical protein  48.94 
 
 		 144 aa  101  4e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.812205  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2021  hypothetical protein  48.94 
 
 		 144 aa  101  4e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.348502  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6076  hypothetical protein  48.94 
 
 		 144 aa  101  4e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1275  hypothetical protein  47.2 
 
 		 144 aa  100  7e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.815122 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3258  hypothetical protein  47.55 
 
 		 147 aa  97.1  7e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.524127 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3499  hypothetical protein  39.86 
 
 		 141 aa  85.9  2e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0413131 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1700  hypothetical protein  52.24 
 
 		 155 aa  85.1  3e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.248871  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2437  protein of unknown function DUF107  52.24 
 
 		 151 aa  83.6  8e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0086298  normal  0.0411134 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2963  hypothetical protein  41.84 
 
 		 141 aa  83.2  0.000000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.154131  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2763  hypothetical protein  50 
 
 		 143 aa  82.8  0.000000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.71581  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2253  hypothetical protein  50 
 
 		 143 aa  82.8  0.000000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2125  hypothetical protein  42.03 
 
 		 141 aa  82.4  0.000000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.128662  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2021  hypothetical protein  36.57 
 
 		 142 aa  77  0.00000000000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.255505  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2414  hypothetical protein  36.69 
 
 		 142 aa  76.6  0.0000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.682077  normal  0.513903 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1885  hypothetical protein  44.68 
 
 		 143 aa  76.3  0.0000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0298787 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1926  hypothetical protein  42.86 
 
 		 142 aa  74.7  0.0000000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00785571 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2737  hypothetical protein  39.13 
 
 		 141 aa  58.2  0.00000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.294707  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2220  hypothetical protein  31.91 
 
 		 153 aa  42.4  0.002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.0134246 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3244  hypothetical protein  27.27 
 
 		 142 aa  40.4  0.008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00265616  normal  0.45038 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>