39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_2437 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010681  Bphyt_2437  protein of unknown function DUF107  100 
 
 
151 aa  296  5e-80  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0086298  normal  0.0411134 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1700  hypothetical protein  92.72 
 
 
155 aa  213  9e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.248871  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1320  hypothetical protein  68.67 
 
 
150 aa  186  1e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.384464  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2047  hypothetical protein  66.43 
 
 
144 aa  169  7.999999999999999e-42  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0101752  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1534  hypothetical protein  65 
 
 
144 aa  162  2.0000000000000002e-39  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.263847  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1305  NfeD family protein  65 
 
 
144 aa  162  2.0000000000000002e-39  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.243451  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2469  NfeD family protein  65 
 
 
144 aa  162  2.0000000000000002e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2414  NfeD family protein  65 
 
 
144 aa  162  2.0000000000000002e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.373398  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3278  NfeD family protein  65 
 
 
144 aa  162  2.0000000000000002e-39  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.829792  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2034  NfeD family protein  65 
 
 
144 aa  162  2.0000000000000002e-39  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.10928  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2560  nodulation efficiency protein D  65 
 
 
144 aa  162  2.0000000000000002e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5311  hypothetical protein  60 
 
 
144 aa  160  6e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.03679  normal  0.249552 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1275  hypothetical protein  61.48 
 
 
144 aa  140  5e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.815122 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2034  hypothetical protein  61.43 
 
 
144 aa  139  9.999999999999999e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.138969  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2001  hypothetical protein  60 
 
 
144 aa  139  9.999999999999999e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.812205  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2021  hypothetical protein  60 
 
 
144 aa  139  9.999999999999999e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.348502  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6076  hypothetical protein  60 
 
 
144 aa  139  9.999999999999999e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1903  hypothetical protein  60.71 
 
 
144 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1454  hypothetical protein  54.14 
 
 
144 aa  135  2e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.348394 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1363  protein of unknown function DUF107  55.3 
 
 
141 aa  122  2e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0778838  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1422  hypothetical protein  51.08 
 
 
142 aa  107  5e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.14104  decreased coverage  0.00104227 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1299  protein of unknown function DUF107  54.55 
 
 
141 aa  102  1e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2125  hypothetical protein  47.37 
 
 
141 aa  92.4  2e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.128662  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1863  hypothetical protein  52.24 
 
 
141 aa  90.1  9e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3258  hypothetical protein  44.68 
 
 
147 aa  89  2e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.524127 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2963  hypothetical protein  41.35 
 
 
141 aa  84.3  6e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.154131  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3499  hypothetical protein  39.85 
 
 
141 aa  80.9  0.000000000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0413131 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2414  hypothetical protein  36.57 
 
 
142 aa  69.3  0.00000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.682077  normal  0.513903 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2021  hypothetical protein  38.97 
 
 
142 aa  70.1  0.00000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.255505  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1926  hypothetical protein  41.79 
 
 
142 aa  65.9  0.0000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00785571 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2763  hypothetical protein  39.85 
 
 
143 aa  65.9  0.0000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.71581  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2253  hypothetical protein  39.85 
 
 
143 aa  65.9  0.0000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1885  hypothetical protein  38.69 
 
 
143 aa  62.4  0.000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0298787 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2737  hypothetical protein  44.36 
 
 
141 aa  59.7  0.00000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.294707  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1187  protein of unknown function DUF107  26.87 
 
 
151 aa  43.1  0.001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1923  hypothetical protein  33.33 
 
 
142 aa  41.6  0.004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.126265  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2063  hypothetical protein  31.4 
 
 
142 aa  40.4  0.008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00757659  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3244  hypothetical protein  31.4 
 
 
142 aa  40.4  0.008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00265616  normal  0.45038 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0728  hypothetical protein  25 
 
 
152 aa  40  0.01  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>