127 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hore_09390 on replicon NC_011899
Organism: Halothermothrix orenii H 168



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011899  Hore_09390  Orotidine-5'-phosphate decarboxylase  100 
 
 
311 aa  634    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00166281  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0951  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  52.85 
 
 
314 aa  314  9.999999999999999e-85  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0614  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  49.52 
 
 
312 aa  311  1e-83  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0882  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  48.57 
 
 
309 aa  280  2e-74  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000000414792  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1816  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  46.3 
 
 
307 aa  280  2e-74  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00211539  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0531  Orotidine-5'-phosphate decarboxylase  46.39 
 
 
317 aa  267  2e-70  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0925  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  43.65 
 
 
347 aa  248  8e-65  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1377  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  42.45 
 
 
305 aa  243  1.9999999999999999e-63  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2904  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  44.18 
 
 
320 aa  242  5e-63  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1199  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  40.33 
 
 
287 aa  213  2.9999999999999995e-54  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0530325  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1384  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  40 
 
 
287 aa  211  2e-53  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.675621  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0923  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  42.67 
 
 
284 aa  211  2e-53  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.318929  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0197  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  40.06 
 
 
283 aa  205  1e-51  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2203  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  40.73 
 
 
266 aa  204  2e-51  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0659  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  40.58 
 
 
289 aa  202  8e-51  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.102908  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1586  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  43.84 
 
 
276 aa  198  7.999999999999999e-50  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  hitchhiker  0.00897859 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0953  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  39.69 
 
 
359 aa  197  1.0000000000000001e-49  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0377509  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1801  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  39.87 
 
 
273 aa  193  3e-48  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.293438 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0783  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  39.19 
 
 
287 aa  186  4e-46  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1444  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  38.38 
 
 
267 aa  186  4e-46  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00000534867  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13603  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  37.09 
 
 
274 aa  181  1e-44  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0190  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  36.01 
 
 
272 aa  177  3e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000350723  hitchhiker  0.00632845 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4349  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  37.82 
 
 
272 aa  172  5e-42  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0751763  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3069  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  36.54 
 
 
276 aa  170  2e-41  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.201112  hitchhiker  0.00274028 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2851  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  36.81 
 
 
302 aa  169  5e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2698  orotidine 5' phosphate decarboxylase  37.27 
 
 
274 aa  169  7e-41  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0183887  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3404  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  37.01 
 
 
271 aa  167  2e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0610032  normal  0.088058 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1970  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  34.97 
 
 
272 aa  167  2e-40  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0476362  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3050  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  36.16 
 
 
272 aa  166  5e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2481  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  36.27 
 
 
275 aa  166  5.9999999999999996e-40  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0575744  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3478  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  36.27 
 
 
275 aa  166  5.9999999999999996e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0401  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  36.27 
 
 
275 aa  166  5.9999999999999996e-40  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.46828  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1261  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  36.27 
 
 
275 aa  166  5.9999999999999996e-40  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3443  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  36.27 
 
 
275 aa  166  5.9999999999999996e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3481  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  36.27 
 
 
275 aa  166  5.9999999999999996e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.959289  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3304  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  36.27 
 
 
275 aa  166  5.9999999999999996e-40  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0552  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  36.69 
 
 
271 aa  165  6.9999999999999995e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.655653 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2609  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  36.77 
 
 
271 aa  165  8e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.104969 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3450  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  36.07 
 
 
270 aa  164  1.0000000000000001e-39  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.799758  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0073  orotidine 5'-monophosphate decarboxylase  34.23 
 
 
276 aa  164  3e-39  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2322  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  34.11 
 
 
273 aa  163  3e-39  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_12  orotidine 5-prime-phosphate decarboxylase  36.72 
 
 
270 aa  163  4.0000000000000004e-39  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0012  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  37.05 
 
 
270 aa  161  1e-38  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.50788  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3018  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  34.64 
 
 
271 aa  161  1e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.397504 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2759  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  37.59 
 
 
275 aa  160  2e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.499942 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0825  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  34.63 
 
 
274 aa  160  3e-38  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0013  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  36.39 
 
 
270 aa  160  4e-38  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1184  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  36.69 
 
 
275 aa  159  5e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2773  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  34.43 
 
 
288 aa  159  7e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.350308 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0594  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  37.41 
 
 
275 aa  158  9e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.165873 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4616  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  34.42 
 
 
285 aa  157  1e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2608  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  34.31 
 
 
283 aa  157  2e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.23667  normal  0.693787 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3708  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  37.05 
 
 
275 aa  156  4e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0899629  normal  0.412867 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0143  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  37.05 
 
 
275 aa  156  5.0000000000000005e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0626  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  37.05 
 
 
275 aa  156  5.0000000000000005e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.260961  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0124  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  33.88 
 
 
274 aa  156  5.0000000000000005e-37  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0527  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  37.05 
 
 
275 aa  155  6e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0551  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  37.05 
 
 
275 aa  155  6e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.771334  normal  0.817763 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2071  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  36.67 
 
 
258 aa  154  1e-36  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5082  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  36.22 
 
 
274 aa  155  1e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2966  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  35.69 
 
 
274 aa  154  2e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2230  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  33.33 
 
 
274 aa  154  2.9999999999999998e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.332513 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4696  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  37.23 
 
 
274 aa  152  8.999999999999999e-36  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3843  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  35.39 
 
 
282 aa  152  1e-35  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.181506  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3625  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  35.24 
 
 
278 aa  151  1e-35  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.313315  normal  0.3554 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_56623  predicted protein  37 
 
 
513 aa  151  1e-35  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.329951  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4058  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  36.23 
 
 
306 aa  150  2e-35  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.186048  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2713  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  42.64 
 
 
259 aa  150  2e-35  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.790129 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0006  orotidine 5'-phosphate decarboxylase subfamily protein  33.55 
 
 
280 aa  150  3e-35  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3403  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  36.23 
 
 
288 aa  150  3e-35  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.57419  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0101  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  33.7 
 
 
274 aa  149  5e-35  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1975  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  35.27 
 
 
272 aa  149  5e-35  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.568621  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3776  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  34.17 
 
 
287 aa  149  6e-35  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1404  orotidine 5'-phosphate decarboxylase subfamily protein  35.37 
 
 
273 aa  146  3e-34  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0347031  normal  0.651323 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0824  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  33.95 
 
 
275 aa  145  8.000000000000001e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1293  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  35.07 
 
 
264 aa  144  2e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0082  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  32.84 
 
 
274 aa  143  3e-33  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0435  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  34.94 
 
 
279 aa  144  3e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.514449  normal  0.571146 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0219  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  34.6 
 
 
281 aa  142  6e-33  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0088  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  33.71 
 
 
279 aa  142  8e-33  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0240  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  33.01 
 
 
281 aa  142  9e-33  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2677  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  34.6 
 
 
274 aa  142  9.999999999999999e-33  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4108  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  33.65 
 
 
284 aa  139  4.999999999999999e-32  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000980823 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1859  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  35.8 
 
 
278 aa  133  3e-30  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11414  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  36.55 
 
 
274 aa  134  3e-30  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000186652  normal  0.109947 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1075  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  34.91 
 
 
274 aa  131  1.0000000000000001e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1801  orotidine 5-phosphate decarboxylase protein  41.03 
 
 
299 aa  130  3e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.291497  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1852  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  33.93 
 
 
278 aa  129  4.0000000000000003e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.98903  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3000  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  31.99 
 
 
286 aa  129  7.000000000000001e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.137742 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2261  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  33.94 
 
 
288 aa  128  1.0000000000000001e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.691248  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0079  orotidine 5'-phosphate decarboxylase subfamily protein  32.04 
 
 
274 aa  127  2.0000000000000002e-28  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  decreased coverage  0.000192992  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1223  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  30.98 
 
 
264 aa  127  3e-28  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.665288  normal  0.0822909 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2300  orotidine 5'-phosphate decarboxylase subfamily protein  38.83 
 
 
280 aa  125  1e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.501998  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18010  orotidine 5'-phosphate decarboxylase, subfamily 2  30.04 
 
 
308 aa  123  5e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0200906  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2665  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  34.66 
 
 
277 aa  122  5e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.907231  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15600  orotidine 5'-phosphate decarboxylase, subfamily 2  35.13 
 
 
283 aa  122  7e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.321475  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1713  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  33.72 
 
 
286 aa  121  9.999999999999999e-27  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0351669  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1320  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  30.32 
 
 
296 aa  121  9.999999999999999e-27  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.382709  normal  0.267798 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12700  orotidine 5'-phosphate decarboxylase, subfamily 2  32.71 
 
 
286 aa  121  9.999999999999999e-27  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0173626  normal  0.0283065 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3155  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  31.08 
 
 
303 aa  121  9.999999999999999e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.411945  hitchhiker  0.000202795 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>