139 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_2300 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008148  Rxyl_2300  orotidine 5'-phosphate decarboxylase subfamily protein  100 
 
 
280 aa  535  1e-151  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.501998  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1377  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  34 
 
 
305 aa  191  1e-47  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1816  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  36.7 
 
 
307 aa  180  2e-44  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00211539  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0925  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  35.53 
 
 
347 aa  179  5.999999999999999e-44  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0882  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  35.83 
 
 
309 aa  177  3e-43  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000000414792  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09390  Orotidine-5'-phosphate decarboxylase  37.25 
 
 
311 aa  171  1e-41  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00166281  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0531  Orotidine-5'-phosphate decarboxylase  38.12 
 
 
317 aa  169  7e-41  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3404  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  43.17 
 
 
271 aa  165  5.9999999999999996e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0610032  normal  0.088058 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0951  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  36.13 
 
 
314 aa  165  1.0000000000000001e-39  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2609  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  41.2 
 
 
271 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.104969 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2904  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  39.03 
 
 
320 aa  161  1e-38  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0552  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  42.09 
 
 
271 aa  160  2e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.655653 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0143  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  41.43 
 
 
275 aa  159  5e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0626  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  41.43 
 
 
275 aa  159  5e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.260961  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0594  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  41.43 
 
 
275 aa  159  5e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.165873 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0527  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  41.07 
 
 
275 aa  158  1e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0551  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  41.07 
 
 
275 aa  158  1e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.771334  normal  0.817763 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3708  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  41.07 
 
 
275 aa  156  3e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0899629  normal  0.412867 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2713  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  42.13 
 
 
259 aa  156  4e-37  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.790129 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2759  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  41.79 
 
 
275 aa  156  5.0000000000000005e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.499942 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0614  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  34.41 
 
 
312 aa  155  7e-37  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2481  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  40.36 
 
 
275 aa  154  1e-36  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0575744  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3478  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  40.36 
 
 
275 aa  154  1e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0401  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  40.36 
 
 
275 aa  154  1e-36  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.46828  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1261  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  40.36 
 
 
275 aa  154  1e-36  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3443  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  40.36 
 
 
275 aa  154  1e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3481  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  40.36 
 
 
275 aa  154  1e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.959289  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3304  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  40.36 
 
 
275 aa  154  1e-36  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0240  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  40.07 
 
 
281 aa  153  2.9999999999999998e-36  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2071  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  41.89 
 
 
258 aa  152  5e-36  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0953  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  41.74 
 
 
359 aa  149  6e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0377509  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0190  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  39.84 
 
 
272 aa  148  9e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000350723  hitchhiker  0.00632845 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2773  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  37.55 
 
 
288 aa  147  2.0000000000000003e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.350308 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4349  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  39.61 
 
 
272 aa  147  2.0000000000000003e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0751763  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0219  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  37.76 
 
 
281 aa  146  4.0000000000000006e-34  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2851  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  37.55 
 
 
302 aa  145  8.000000000000001e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1199  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  34.98 
 
 
287 aa  142  4e-33  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0530325  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1184  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  39.29 
 
 
275 aa  142  6e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2698  orotidine 5' phosphate decarboxylase  35.94 
 
 
274 aa  142  7e-33  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0183887  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1384  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  34.98 
 
 
287 aa  142  8e-33  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.675621  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3018  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  37.55 
 
 
271 aa  142  9e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.397504 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2608  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  36.82 
 
 
283 aa  141  9.999999999999999e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.23667  normal  0.693787 
 
 
-
 
NC_002936  DET0013  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  34.91 
 
 
270 aa  140  3e-32  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0012  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  35.41 
 
 
270 aa  140  3e-32  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.50788  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0825  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  38.6 
 
 
274 aa  139  6e-32  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1801  orotidine 5-phosphate decarboxylase protein  36.96 
 
 
299 aa  138  8.999999999999999e-32  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.291497  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4616  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  38.35 
 
 
285 aa  137  1e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3450  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  37.41 
 
 
270 aa  137  2e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.799758  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0783  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  33.46 
 
 
287 aa  137  2e-31  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2230  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  34.16 
 
 
274 aa  136  3.0000000000000003e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.332513 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0659  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  34.47 
 
 
289 aa  137  3.0000000000000003e-31  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.102908  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5082  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  38.16 
 
 
274 aa  136  4e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1970  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  32.85 
 
 
272 aa  135  5e-31  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0476362  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3403  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  38.7 
 
 
288 aa  136  5e-31  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.57419  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3050  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  36.1 
 
 
272 aa  135  9.999999999999999e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_12  orotidine 5-prime-phosphate decarboxylase  34.91 
 
 
270 aa  135  9.999999999999999e-31  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2203  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  38.91 
 
 
266 aa  134  9.999999999999999e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1293  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  35.71 
 
 
264 aa  135  9.999999999999999e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4058  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  38.31 
 
 
306 aa  134  1.9999999999999998e-30  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.186048  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3069  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  34.6 
 
 
276 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.201112  hitchhiker  0.00274028 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0824  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  36.78 
 
 
275 aa  134  1.9999999999999998e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3776  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  37.98 
 
 
287 aa  133  3e-30  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13603  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  31.56 
 
 
274 aa  133  3e-30  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3843  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  38.41 
 
 
282 aa  133  3e-30  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.181506  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0197  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  38.29 
 
 
283 aa  130  2.0000000000000002e-29  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2322  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  33.7 
 
 
273 aa  130  3e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0923  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  41.28 
 
 
284 aa  129  4.0000000000000003e-29  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.318929  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0073  orotidine 5'-monophosphate decarboxylase  32.95 
 
 
276 aa  129  5.0000000000000004e-29  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4696  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  40.88 
 
 
274 aa  129  6e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1444  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  34.5 
 
 
267 aa  129  7.000000000000001e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00000534867  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1586  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  37.89 
 
 
276 aa  129  8.000000000000001e-29  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  hitchhiker  0.00897859 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4108  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  37.32 
 
 
284 aa  127  2.0000000000000002e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000980823 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0124  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  36.29 
 
 
274 aa  126  3e-28  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1801  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  38.58 
 
 
273 aa  125  6e-28  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.293438 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1223  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  37.5 
 
 
264 aa  124  1e-27  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.665288  normal  0.0822909 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0101  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  34.57 
 
 
274 aa  124  1e-27  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2966  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  31.1 
 
 
274 aa  122  6e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0435  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  38.61 
 
 
279 aa  122  7e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.514449  normal  0.571146 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1404  orotidine 5'-phosphate decarboxylase subfamily protein  41.67 
 
 
273 aa  121  9.999999999999999e-27  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0347031  normal  0.651323 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_56623  predicted protein  37.55 
 
 
513 aa  118  9e-26  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.329951  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1975  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  40.44 
 
 
272 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.568621  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3625  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  36.71 
 
 
278 aa  117  3e-25  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.313315  normal  0.3554 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1075  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  37.25 
 
 
274 aa  112  6e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1859  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  37.55 
 
 
278 aa  112  6e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0088  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  32.85 
 
 
279 aa  112  6e-24  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0082  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  31.37 
 
 
274 aa  112  9e-24  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2261  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  39.53 
 
 
288 aa  110  2.0000000000000002e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.691248  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2677  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  34.15 
 
 
274 aa  109  4.0000000000000004e-23  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1852  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  36.73 
 
 
278 aa  108  7.000000000000001e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.98903  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3000  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  38.15 
 
 
286 aa  108  1e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.137742 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2433  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  36.59 
 
 
273 aa  106  4e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.716353  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0006  orotidine 5'-phosphate decarboxylase subfamily protein  32.79 
 
 
280 aa  106  5e-22  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0079  orotidine 5'-phosphate decarboxylase subfamily protein  35.69 
 
 
274 aa  105  9e-22  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  decreased coverage  0.000192992  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14780  orotidine 5'-phosphate decarboxylase, subfamily 2  37.14 
 
 
279 aa  105  1e-21  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4272  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  35.21 
 
 
279 aa  105  1e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.279827  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1998  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  37.8 
 
 
290 aa  104  2e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000649069 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2580  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  39.6 
 
 
270 aa  102  8e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0154092  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2039  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  36.84 
 
 
282 aa  100  2e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.579938  normal  0.0142296 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0957  bifunctional orotidine 5'-phosphate decarboxylase/orotate phosphoribosyltransferase protein  29.39 
 
 
477 aa  100  3e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.434428  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2110  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  29.1 
 
 
300 aa  97.8  2e-19  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>