136 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Coch_1970 on replicon NC_013162
Organism: Capnocytophaga ochracea DSM 7271



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013162  Coch_1970  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  100 
 
 
272 aa  566  1e-160  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0476362  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2322  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  72.79 
 
 
273 aa  421  1e-117  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13603  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  71.96 
 
 
274 aa  410  1e-113  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2966  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  59.85 
 
 
274 aa  340  2e-92  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0073  orotidine 5'-monophosphate decarboxylase  58.24 
 
 
276 aa  331  9e-90  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2698  orotidine 5' phosphate decarboxylase  59.78 
 
 
274 aa  328  4e-89  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0183887  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2230  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  58.87 
 
 
274 aa  325  6e-88  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.332513 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3069  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  57.51 
 
 
276 aa  314  8e-85  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.201112  hitchhiker  0.00274028 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0435  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  57.71 
 
 
279 aa  306  2.0000000000000002e-82  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.514449  normal  0.571146 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0006  orotidine 5'-phosphate decarboxylase subfamily protein  49.45 
 
 
280 aa  252  6e-66  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0082  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  48.51 
 
 
274 aa  244  9.999999999999999e-64  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0088  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  50.19 
 
 
279 aa  241  7.999999999999999e-63  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0124  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  47.17 
 
 
274 aa  239  2.9999999999999997e-62  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0101  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  47.53 
 
 
274 aa  235  6e-61  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2203  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  45.66 
 
 
266 aa  224  1e-57  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0923  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  43.66 
 
 
284 aa  223  2e-57  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.318929  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0079  orotidine 5'-phosphate decarboxylase subfamily protein  47.04 
 
 
274 aa  220  1.9999999999999999e-56  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  decreased coverage  0.000192992  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2677  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  47.17 
 
 
274 aa  219  3.9999999999999997e-56  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_12  orotidine 5-prime-phosphate decarboxylase  44.57 
 
 
270 aa  213  2.9999999999999995e-54  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0197  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  41.84 
 
 
283 aa  212  4.9999999999999996e-54  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0013  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  44.7 
 
 
270 aa  211  7.999999999999999e-54  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1586  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  43.48 
 
 
276 aa  209  3e-53  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  hitchhiker  0.00897859 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3450  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  43.77 
 
 
270 aa  208  8e-53  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.799758  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1801  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  43.43 
 
 
273 aa  206  3e-52  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.293438 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0012  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  45.24 
 
 
270 aa  205  5e-52  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.50788  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1444  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  44 
 
 
267 aa  202  4e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00000534867  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2481  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  41.57 
 
 
275 aa  201  7e-51  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0575744  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3478  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  41.57 
 
 
275 aa  201  7e-51  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0401  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  41.57 
 
 
275 aa  201  7e-51  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.46828  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1261  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  41.57 
 
 
275 aa  201  7e-51  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3443  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  41.57 
 
 
275 aa  201  7e-51  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3481  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  41.57 
 
 
275 aa  201  7e-51  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.959289  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3304  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  41.57 
 
 
275 aa  201  7e-51  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0825  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  41.31 
 
 
274 aa  202  7e-51  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2608  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  40.98 
 
 
283 aa  202  7e-51  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.23667  normal  0.693787 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1975  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  44.62 
 
 
272 aa  200  1.9999999999999998e-50  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.568621  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3018  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  40.37 
 
 
271 aa  199  6e-50  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.397504 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2773  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  39.63 
 
 
288 aa  198  1.0000000000000001e-49  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.350308 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1184  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  41.18 
 
 
275 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2609  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  40.47 
 
 
271 aa  195  8.000000000000001e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.104969 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3050  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  38.75 
 
 
272 aa  194  1e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0527  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  43.51 
 
 
275 aa  192  5e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0551  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  43.51 
 
 
275 aa  192  5e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.771334  normal  0.817763 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2851  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  38.89 
 
 
302 aa  192  6e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0143  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  43.1 
 
 
275 aa  191  7e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0626  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  43.1 
 
 
275 aa  191  7e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.260961  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3708  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  43.1 
 
 
275 aa  191  1e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0899629  normal  0.412867 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1293  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  44.44 
 
 
264 aa  191  1e-47  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0594  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  42.68 
 
 
275 aa  189  2.9999999999999997e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.165873 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4349  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  39.85 
 
 
272 aa  188  7e-47  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0751763  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3404  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  42.02 
 
 
271 aa  187  1e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0610032  normal  0.088058 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0190  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  39.76 
 
 
272 aa  187  2e-46  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000350723  hitchhiker  0.00632845 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4108  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  39.08 
 
 
284 aa  186  3e-46  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000980823 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2759  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  41.42 
 
 
275 aa  185  8e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.499942 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4616  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  39.36 
 
 
285 aa  184  1.0000000000000001e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0552  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  41.6 
 
 
271 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.655653 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4058  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  40.34 
 
 
306 aa  184  1.0000000000000001e-45  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.186048  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3403  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  40.34 
 
 
288 aa  184  2.0000000000000003e-45  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.57419  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5082  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  38.91 
 
 
274 aa  181  1e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3843  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  38.8 
 
 
282 aa  181  2e-44  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.181506  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0824  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  37.89 
 
 
275 aa  178  5.999999999999999e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4696  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  37.89 
 
 
274 aa  177  2e-43  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3625  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  38.98 
 
 
278 aa  176  3e-43  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.313315  normal  0.3554 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0240  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  37.68 
 
 
281 aa  176  3e-43  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3776  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  36.73 
 
 
287 aa  174  9.999999999999999e-43  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0219  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  37.5 
 
 
281 aa  171  1e-41  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0882  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  38.55 
 
 
309 aa  169  6e-41  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000000414792  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09390  Orotidine-5'-phosphate decarboxylase  34.97 
 
 
311 aa  167  2e-40  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00166281  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1816  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  38.2 
 
 
307 aa  161  1e-38  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00211539  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0659  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  41.83 
 
 
289 aa  160  2e-38  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.102908  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1223  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  37.87 
 
 
264 aa  159  5e-38  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.665288  normal  0.0822909 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1199  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  37.06 
 
 
287 aa  159  7e-38  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0530325  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1384  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  37.06 
 
 
287 aa  155  7e-37  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.675621  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1075  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  38.03 
 
 
274 aa  152  5.9999999999999996e-36  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0957  bifunctional orotidine 5'-phosphate decarboxylase/orotate phosphoribosyltransferase protein  37.71 
 
 
477 aa  150  3e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.434428  normal 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_56623  predicted protein  37.85 
 
 
513 aa  143  4e-33  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.329951  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0783  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  35.51 
 
 
287 aa  142  5e-33  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1377  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  31.12 
 
 
305 aa  141  9.999999999999999e-33  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0925  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  33.97 
 
 
347 aa  137  2e-31  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2347  bifunctional orotidine 5'-phosphate decarboxylase/orotate phosphoribosyltransferase protein  34.73 
 
 
479 aa  133  3e-30  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.159703  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2296  bifunctional orotidine 5'-phosphate decarboxylase/orotate phosphoribosyltransferase protein  34.73 
 
 
479 aa  133  3e-30  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2904  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  35.44 
 
 
320 aa  129  4.0000000000000003e-29  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1671  bifunctional orotidine 5'-phosphate decarboxylase/orotate phosphoribosyltransferase protein  32.73 
 
 
482 aa  127  3e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0951  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  31.06 
 
 
314 aa  126  4.0000000000000003e-28  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0531  Orotidine-5'-phosphate decarboxylase  33.09 
 
 
317 aa  126  4.0000000000000003e-28  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0953  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  32.79 
 
 
359 aa  126  4.0000000000000003e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0377509  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2713  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  34.5 
 
 
259 aa  113  4.0000000000000004e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.790129 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2110  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  33.73 
 
 
300 aa  109  4.0000000000000004e-23  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0614  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  29.02 
 
 
312 aa  109  4.0000000000000004e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2261  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  31.73 
 
 
288 aa  106  4e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.691248  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11414  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  31.23 
 
 
274 aa  106  5e-22  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000186652  normal  0.109947 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3000  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  30.92 
 
 
286 aa  106  5e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.137742 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2071  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  32.58 
 
 
258 aa  105  1e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1713  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  32.1 
 
 
286 aa  103  4e-21  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0351669  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1998  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  32.65 
 
 
290 aa  102  6e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000649069 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2368  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  30.19 
 
 
272 aa  101  1e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0259026  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2415  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  30.19 
 
 
272 aa  101  1e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.390803 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2409  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  30.19 
 
 
272 aa  102  1e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4272  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  29.46 
 
 
279 aa  100  3e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.279827  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3742  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  30.74 
 
 
272 aa  99  7e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0768721 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>