135 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_2966 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013037  Dfer_2966  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  100 
 
 
274 aa  571  1.0000000000000001e-162  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0435  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  67.99 
 
 
279 aa  378  1e-104  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.514449  normal  0.571146 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3069  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  64.29 
 
 
276 aa  368  1e-101  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.201112  hitchhiker  0.00274028 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2698  orotidine 5' phosphate decarboxylase  65.58 
 
 
274 aa  367  1e-100  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0183887  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2322  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  63.87 
 
 
273 aa  359  2e-98  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2230  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  63.7 
 
 
274 aa  357  9e-98  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.332513 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1970  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  59.85 
 
 
272 aa  340  2e-92  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0476362  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13603  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  58.48 
 
 
274 aa  333  3e-90  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0073  orotidine 5'-monophosphate decarboxylase  60.95 
 
 
276 aa  329  3e-89  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0006  orotidine 5'-phosphate decarboxylase subfamily protein  45.42 
 
 
280 aa  232  5e-60  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2677  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  49.79 
 
 
274 aa  228  1e-58  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0124  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  45.49 
 
 
274 aa  228  1e-58  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0101  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  45.28 
 
 
274 aa  226  3e-58  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0082  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  45.9 
 
 
274 aa  217  2e-55  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0012  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  45.53 
 
 
270 aa  215  5.9999999999999996e-55  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.50788  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0079  orotidine 5'-phosphate decarboxylase subfamily protein  48.12 
 
 
274 aa  214  9e-55  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  decreased coverage  0.000192992  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0013  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  43.27 
 
 
270 aa  213  1.9999999999999998e-54  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_12  orotidine 5-prime-phosphate decarboxylase  42.65 
 
 
270 aa  211  1e-53  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0088  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  47.95 
 
 
279 aa  209  3e-53  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3450  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  45 
 
 
270 aa  208  9e-53  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.799758  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2203  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  43.96 
 
 
266 aa  207  1e-52  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1444  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  42.21 
 
 
267 aa  207  1e-52  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00000534867  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0197  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  41.72 
 
 
283 aa  202  3e-51  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0923  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  45.42 
 
 
284 aa  201  9.999999999999999e-51  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.318929  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2609  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  41.18 
 
 
271 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.104969 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1293  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  43.5 
 
 
264 aa  200  1.9999999999999998e-50  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0825  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  42.48 
 
 
274 aa  198  7.999999999999999e-50  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2481  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  41.83 
 
 
275 aa  189  5e-47  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0575744  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3478  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  41.83 
 
 
275 aa  189  5e-47  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0401  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  41.83 
 
 
275 aa  189  5e-47  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.46828  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1261  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  41.83 
 
 
275 aa  189  5e-47  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3443  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  41.83 
 
 
275 aa  189  5e-47  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3481  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  41.83 
 
 
275 aa  189  5e-47  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.959289  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3304  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  41.83 
 
 
275 aa  189  5e-47  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3050  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  40.77 
 
 
272 aa  188  8e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1801  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  41.28 
 
 
273 aa  187  2e-46  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.293438 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2608  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  40.08 
 
 
283 aa  186  3e-46  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.23667  normal  0.693787 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0190  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  39.22 
 
 
272 aa  186  4e-46  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000350723  hitchhiker  0.00632845 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2851  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  40.4 
 
 
302 aa  186  5e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3018  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  39.69 
 
 
271 aa  185  8e-46  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.397504 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1975  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  40.88 
 
 
272 aa  184  9e-46  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.568621  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4616  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  40.24 
 
 
285 aa  183  2.0000000000000003e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3404  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  41.32 
 
 
271 aa  183  2.0000000000000003e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0610032  normal  0.088058 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1586  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  42.23 
 
 
276 aa  184  2.0000000000000003e-45  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  hitchhiker  0.00897859 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1184  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  41.56 
 
 
275 aa  181  1e-44  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2773  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  37.69 
 
 
288 aa  181  2e-44  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.350308 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2759  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  41.15 
 
 
275 aa  177  2e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.499942 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0527  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  41.15 
 
 
275 aa  176  3e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0551  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  41.15 
 
 
275 aa  176  3e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.771334  normal  0.817763 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0552  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  40.5 
 
 
271 aa  176  4e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.655653 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3708  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  40.74 
 
 
275 aa  176  5e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0899629  normal  0.412867 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0219  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  36.73 
 
 
281 aa  175  6e-43  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4349  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  39.7 
 
 
272 aa  175  7e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0751763  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0143  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  40.74 
 
 
275 aa  175  8e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0626  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  40.74 
 
 
275 aa  175  8e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.260961  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3843  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  37.59 
 
 
282 aa  175  8e-43  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.181506  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0594  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  40.74 
 
 
275 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.165873 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5082  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  38.02 
 
 
274 aa  174  1.9999999999999998e-42  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0240  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  37.45 
 
 
281 aa  173  2.9999999999999996e-42  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3776  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  35.59 
 
 
287 aa  171  1e-41  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4108  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  39.85 
 
 
284 aa  170  3e-41  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000980823 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0824  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  37.21 
 
 
275 aa  168  9e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1223  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  39.34 
 
 
264 aa  166  5e-40  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.665288  normal  0.0822909 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4058  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  36.58 
 
 
306 aa  165  8e-40  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.186048  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3403  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  36.58 
 
 
288 aa  164  1.0000000000000001e-39  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.57419  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4696  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  37.01 
 
 
274 aa  164  2.0000000000000002e-39  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3625  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  38.11 
 
 
278 aa  163  2.0000000000000002e-39  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.313315  normal  0.3554 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1199  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  36.46 
 
 
287 aa  160  2e-38  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0530325  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1384  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  36.46 
 
 
287 aa  159  6e-38  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.675621  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0659  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  35.76 
 
 
289 aa  158  9e-38  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.102908  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1377  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  37.41 
 
 
305 aa  158  9e-38  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0957  bifunctional orotidine 5'-phosphate decarboxylase/orotate phosphoribosyltransferase protein  36.18 
 
 
477 aa  155  8e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.434428  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0882  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  36.67 
 
 
309 aa  153  2e-36  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000000414792  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09390  Orotidine-5'-phosphate decarboxylase  35.69 
 
 
311 aa  154  2e-36  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00166281  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0925  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  35.55 
 
 
347 aa  148  8e-35  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0531  Orotidine-5'-phosphate decarboxylase  39.46 
 
 
317 aa  144  1e-33  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0783  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  35.16 
 
 
287 aa  143  2e-33  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_56623  predicted protein  37.09 
 
 
513 aa  142  5e-33  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.329951  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1075  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  35.86 
 
 
274 aa  142  8e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1671  bifunctional orotidine 5'-phosphate decarboxylase/orotate phosphoribosyltransferase protein  31.73 
 
 
482 aa  142  8e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1816  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  34.57 
 
 
307 aa  141  9.999999999999999e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00211539  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2904  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  34.18 
 
 
320 aa  137  2e-31  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2347  bifunctional orotidine 5'-phosphate decarboxylase/orotate phosphoribosyltransferase protein  30.29 
 
 
479 aa  134  1.9999999999999998e-30  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.159703  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2296  bifunctional orotidine 5'-phosphate decarboxylase/orotate phosphoribosyltransferase protein  30.29 
 
 
479 aa  134  1.9999999999999998e-30  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0951  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  32.47 
 
 
314 aa  129  4.0000000000000003e-29  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0953  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  33.6 
 
 
359 aa  124  2e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0377509  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0614  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  28.85 
 
 
312 aa  122  8e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2713  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  33.33 
 
 
259 aa  119  4.9999999999999996e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.790129 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2110  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  32.5 
 
 
300 aa  110  3e-23  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2071  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  32.82 
 
 
258 aa  107  2e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1859  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  31.27 
 
 
278 aa  106  3e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11414  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  32.71 
 
 
274 aa  106  4e-22  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000186652  normal  0.109947 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3000  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  34.36 
 
 
286 aa  105  6e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.137742 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3742  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  33.07 
 
 
272 aa  105  8e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0768721 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2261  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  34.25 
 
 
288 aa  104  1e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.691248  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2409  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  31.85 
 
 
272 aa  104  1e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2368  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  31.37 
 
 
272 aa  102  7e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0259026  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2415  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  31.37 
 
 
272 aa  102  7e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.390803 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1852  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  30.89 
 
 
278 aa  102  7e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.98903  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1713  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  33.06 
 
 
286 aa  99.4  6e-20  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0351669  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>