56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hmuk_1803 on replicon NC_013202
Organism: Halomicrobium mukohataei DSM 12286



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013202  Hmuk_1803  Pyrrolo-quinoline quinone  100 
 
 
402 aa  813    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.325377 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0210  Pyrrolo-quinoline quinone  25.09 
 
 
397 aa  69.3  0.0000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4041  serine/threonine protein kinase  23.94 
 
 
774 aa  63.9  0.000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.224391  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0677  Pyrrolo-quinoline quinone  21.84 
 
 
431 aa  63.5  0.000000007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.350335  normal  0.177219 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3290  serine/threonine protein kinase  22.71 
 
 
963 aa  57.4  0.0000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.0556916 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5726  WD40-like repeat-domain-containing protein  23.44 
 
 
901 aa  55.8  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3730  serine/threonine protein kinase  22.14 
 
 
687 aa  55.1  0.000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00433941 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1729  Pyrrolo-quinoline quinone  26.35 
 
 
372 aa  53.5  0.000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1499  hypothetical protein  22.25 
 
 
384 aa  53.1  0.000008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4167  Pyrrolo-quinoline quinone  29.71 
 
 
432 aa  53.1  0.000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.275915 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0262  Pyrrolo-quinoline quinone  23.77 
 
 
407 aa  53.1  0.000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1484  hypothetical protein  21.99 
 
 
384 aa  52.8  0.00001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2056  Pyrrolo-quinoline quinone  22.85 
 
 
705 aa  51.2  0.00003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.9756  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0513  Pyrrolo-quinoline quinone  22.27 
 
 
422 aa  51.2  0.00003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3898  Pyrrolo-quinoline quinone  26.8 
 
 
423 aa  50.1  0.00008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.122997  normal  0.375271 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1144  Pyrrolo-quinoline quinone beta-propeller repeat protein  25.49 
 
 
391 aa  48.5  0.0002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1171  Pyrrolo-quinoline quinone  23.41 
 
 
399 aa  48.5  0.0002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0406546  normal  0.22444 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2189  Pyrrolo-quinoline quinone  28.21 
 
 
484 aa  48.5  0.0002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.718843 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1455  Pyrrolo-quinoline quinone  24.29 
 
 
1454 aa  48.5  0.0002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3412  Pyrrolo-quinoline quinone  28.37 
 
 
402 aa  48.1  0.0003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1593  metallophosphoesterase  23.47 
 
 
611 aa  47.4  0.0004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.245606 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2894  Pyrrolo-quinoline quinone  23.53 
 
 
406 aa  47.4  0.0005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0786698  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1130  Pyrrolo-quinoline quinone  26.06 
 
 
389 aa  47  0.0006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3493  Pyrrolo-quinoline quinone  30.91 
 
 
461 aa  47  0.0006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.546086 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2161  Pyrrolo-quinoline quinone  25.99 
 
 
454 aa  46.6  0.0008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.905715  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1656  PQQ repeat-containing protein  24.57 
 
 
363 aa  46.6  0.0008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2290  Pyrrolo-quinoline quinone  25 
 
 
363 aa  45.8  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_911  PQQ enzyme repeat domain protein  22.54 
 
 
371 aa  45.8  0.001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00179441  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0877  Pyrrolo-quinoline quinone  22.67 
 
 
797 aa  45.8  0.001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2857  Pyrrolo-quinoline quinone  22.59 
 
 
387 aa  46.2  0.001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.725617  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2694  Pyrrolo-quinoline quinone  33.33 
 
 
450 aa  45.1  0.002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  hitchhiker  0.00958514  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3300  serine/threonine protein kinase  23.05 
 
 
795 aa  45.1  0.002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0697  Pyrrolo-quinoline quinone  24.8 
 
 
415 aa  45.4  0.002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2202  Pyrrolo-quinoline quinone  25 
 
 
363 aa  45.4  0.002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2237  putative lipoprotein  27.24 
 
 
381 aa  45.1  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1231  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  29.41 
 
 
395 aa  44.7  0.003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1302  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  29.41 
 
 
395 aa  44.3  0.003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1232  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  29.41 
 
 
395 aa  44.7  0.003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2698  putative quinoprotein  25.66 
 
 
448 aa  44.7  0.003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.578773  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0751  Pyrrolo-quinoline quinone  21.82 
 
 
453 aa  44.7  0.003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.7044  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0624  Pyrrolo-quinoline quinone  23.76 
 
 
417 aa  44.7  0.003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3125  Pyrrolo-quinoline quinone  20.17 
 
 
444 aa  44.7  0.003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.687826 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1465  protein kinase  23.29 
 
 
653 aa  44.7  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.355835  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2164  serine/threonine protein kinase  21.36 
 
 
652 aa  44.3  0.004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.563698  hitchhiker  0.00000786383 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1800  hypothetical protein  31.82 
 
 
2272 aa  44.3  0.004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.999068 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3214  Pyrrolo-quinoline quinone  21.19 
 
 
349 aa  43.5  0.006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000613548  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1355  Pyrrolo-quinoline quinone  25.66 
 
 
454 aa  43.9  0.006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.464809  normal  0.026391 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02978  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  25.95 
 
 
402 aa  43.5  0.006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.373211  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1875  Pyrrolo-quinoline quinone  23.66 
 
 
381 aa  43.5  0.007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.210661  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4249  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  28.04 
 
 
414 aa  43.5  0.007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.548158  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2362  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  23.53 
 
 
395 aa  43.1  0.008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.034876  normal  0.596671 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6658  metallophosphoesterase  26.4 
 
 
616 aa  43.1  0.009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.492609 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1165  pyrrolo-quinoline quinone  26.03 
 
 
450 aa  43.1  0.009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0116757  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0609  Pyrrolo-quinoline quinone  22.61 
 
 
352 aa  43.1  0.009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.471438  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1643  Pyrrolo-quinoline quinone  23.08 
 
 
457 aa  43.1  0.01  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1991  cell surface protein  24.47 
 
 
1311 aa  42.7  0.01  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.995987 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>