162 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_0733 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012029  Hlac_0733  protein of unknown function Met10  100 
 
 
329 aa  644    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.213021 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2749  protein of unknown function Met10  67.68 
 
 
326 aa  436  1e-121  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0242  methyltransferase  65.55 
 
 
326 aa  422  1e-117  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.406205  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1954  methyltransferase  63.58 
 
 
333 aa  403  1e-111  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0895  protein of unknown function Met10  58.29 
 
 
366 aa  399  9.999999999999999e-111  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.249454  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1392  methyltransferase  41 
 
 
336 aa  247  2e-64  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0961  methyltransferase  39.29 
 
 
331 aa  235  9e-61  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000000822635  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0021  protein of unknown function Met10  42.86 
 
 
328 aa  214  9.999999999999999e-55  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1334  protein of unknown function Met10  30.29 
 
 
344 aa  168  1e-40  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.985336  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2646  protein of unknown function Met10  34.98 
 
 
315 aa  166  4e-40  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0927799  normal  0.180049 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3003  protein of unknown function Met10  33.64 
 
 
305 aa  165  1.0000000000000001e-39  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.7615  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1351  methyltransferase  28.69 
 
 
342 aa  160  3e-38  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1325  protein of unknown function Met10  29.86 
 
 
342 aa  159  4e-38  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.428653  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0121  protein of unknown function Met10  38.78 
 
 
311 aa  159  4e-38  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0628  protein of unknown function Met10  27.84 
 
 
342 aa  155  9e-37  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0809  protein of unknown function Met10  40.95 
 
 
283 aa  153  2.9999999999999998e-36  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0275  protein of unknown function Met10  27.68 
 
 
355 aa  152  1e-35  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  hitchhiker  0.000958711  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0138  protein of unknown function Met10  35.08 
 
 
303 aa  147  2.0000000000000003e-34  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2364  protein of unknown function Met10  39.27 
 
 
304 aa  143  4e-33  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1658  methyltransferase  31.19 
 
 
308 aa  141  1.9999999999999998e-32  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  hitchhiker  0.00000328527 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0294  hypothetical protein  32.16 
 
 
275 aa  140  3.9999999999999997e-32  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00604747 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1011  methyltransferase  34.33 
 
 
365 aa  132  9e-30  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0011  protein of unknown function Met10  30.45 
 
 
346 aa  128  2.0000000000000002e-28  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1200  methyltransferase  35.29 
 
 
360 aa  127  4.0000000000000003e-28  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.55061  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2406  methyltransferase  28.91 
 
 
343 aa  126  6e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0438473  normal  0.327054 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3196  protein of unknown function Met10  32.42 
 
 
265 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2309  protein of unknown function Met10  34.51 
 
 
273 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  hitchhiker  0.00822645 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1952  protein of unknown function Met10  31.67 
 
 
273 aa  114  3e-24  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.830439  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1579  protein of unknown function Met10  28.97 
 
 
253 aa  112  7.000000000000001e-24  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.891505  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0245  protein of unknown function Met10  31.75 
 
 
259 aa  112  9e-24  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_38572  predicted protein  32.86 
 
 
410 aa  111  2.0000000000000002e-23  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  hitchhiker  0.00890076 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0343  protein of unknown function Met10  27.95 
 
 
288 aa  110  3e-23  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0636  protein of unknown function Met10  29.3 
 
 
272 aa  109  6e-23  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1047  methyltransferase  31.07 
 
 
253 aa  108  2e-22  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2032  protein of unknown function Met10  34.44 
 
 
409 aa  107  3e-22  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1237  protein of unknown function Met10  32.26 
 
 
289 aa  104  2e-21  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.220421  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1437  protein of unknown function Met10  28.02 
 
 
256 aa  104  3e-21  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.228358  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0714  protein of unknown function Met10  31.72 
 
 
273 aa  103  4e-21  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.307474 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2080  methyltransferase  30.42 
 
 
277 aa  100  2e-20  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0333  protein of unknown function Met10  30.77 
 
 
253 aa  101  2e-20  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0655  methyltransferase  27.41 
 
 
337 aa  100  4e-20  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0202  protein of unknown function Met10  46.09 
 
 
416 aa  92  1e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0736  protein of unknown function Met10  28.19 
 
 
341 aa  90.9  2e-17  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0923  hypothetical protein  30.12 
 
 
289 aa  90.9  3e-17  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_45914  predicted protein  35.97 
 
 
459 aa  88.2  2e-16  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0829  protein of unknown function Met10  27.76 
 
 
288 aa  86.3  7e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0995371 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0603  methyltransferase  28.74 
 
 
256 aa  84.7  0.000000000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.372647  normal  0.441209 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1668  protein of unknown function Met10  32.69 
 
 
292 aa  84  0.000000000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.384842  normal  0.847936 
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_47967  predicted protein  36.57 
 
 
587 aa  84  0.000000000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1885  protein of unknown function Met10  29.43 
 
 
288 aa  83.6  0.000000000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0169921  normal 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_10361  tRNA (guanine) methyltransferase Trm5 (AFU_orthologue; AFUA_3G08030)  31.43 
 
 
478 aa  78.2  0.0000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.142458  normal 
 
 
-
 
NC_006694  CNI01900  tRNA (guanine) methyltransferase, putative  34.56 
 
 
543 aa  78.6  0.0000000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44373  predicted protein  32.93 
 
 
436 aa  76.6  0.0000000000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_34943  predicted protein  31.77 
 
 
278 aa  75.5  0.000000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0396356  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0744  methyltransferase  26.87 
 
 
288 aa  74.7  0.000000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.274994  normal  0.183253 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_46848  predicted protein  27.43 
 
 
577 aa  74.3  0.000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0655849  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0041  protein of unknown function Met10  26.67 
 
 
272 aa  57.4  0.0000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4122  RNA methyltransferase, TrmA family  30.34 
 
 
461 aa  55.5  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.840048 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4083  RNA methyltransferase, TrmA family  30.34 
 
 
461 aa  55.5  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0072  SAM-dependent methyltransferase  30.77 
 
 
439 aa  54.3  0.000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4297  ribosomal protein L11 methyltransferase  37.5 
 
 
312 aa  54.3  0.000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000247915  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1340  23S rRNA (uracil-5-)-methyltransferase RumA  39.19 
 
 
465 aa  53.5  0.000005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.308627 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2505  Methyltransferase type 11  30.36 
 
 
267 aa  51.2  0.00002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.618552  normal  0.420988 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1252  RNA methyltransferase  25.96 
 
 
440 aa  50.8  0.00003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0113803  normal  0.599775 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1919  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  31.58 
 
 
498 aa  50.1  0.00005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.149056 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1354  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  38.37 
 
 
445 aa  49.7  0.00007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.961347  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1134  23S rRNA methyltransferase/RumA  30 
 
 
469 aa  48.9  0.0001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2871  HemK family modification methylase  41.38 
 
 
234 aa  48.9  0.0001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37070  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  48 
 
 
454 aa  48.9  0.0001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.584008  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1286  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  32.95 
 
 
442 aa  48.9  0.0001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0270354  unclonable  0.00000000011365 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1216  RNA methyltransferase  35 
 
 
452 aa  48.9  0.0001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4553  methyltransferase  31.68 
 
 
261 aa  48.1  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.749759  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0744  Methyltransferase type 11  29.09 
 
 
248 aa  48.1  0.0002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0330334  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2239  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  31.25 
 
 
449 aa  48.5  0.0002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1254  methyltransferase small  37.38 
 
 
210 aa  48.1  0.0002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2745  putative RNA methylase  40.62 
 
 
426 aa  48.1  0.0002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3004  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  40 
 
 
441 aa  48.1  0.0002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.202299  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0660  RNA methyltransferase, TrmA family  27.27 
 
 
475 aa  48.1  0.0002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.107668  normal  0.988536 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1176  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  31.03 
 
 
463 aa  47.4  0.0003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0393959  normal  0.0809579 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1235  RNA methyltransferase, TrmA family  31.76 
 
 
462 aa  47.8  0.0003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0273  16S RNA G1207 methylase RsmC  42.03 
 
 
211 aa  47.8  0.0003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1110  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  30.77 
 
 
449 aa  47.4  0.0003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0268238  normal  0.546108 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2971  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  46.94 
 
 
444 aa  47.8  0.0003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.422086  hitchhiker  0.0000745246 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0558  Methyltransferase type 11  26.06 
 
 
188 aa  47  0.0004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0166016  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2924  Fmu (Sun) domain-containing protein  32.97 
 
 
433 aa  47.4  0.0004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2903  RNA methyltransferase, TrmA family  29.41 
 
 
438 aa  47.4  0.0004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1110  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  31.03 
 
 
463 aa  46.6  0.0005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0371274  normal  0.891306 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1032  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  27.41 
 
 
443 aa  47  0.0005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0127983  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14811  SAM-dependent methyltransferase  27.17 
 
 
465 aa  46.6  0.0005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0686712 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07230  methylase of polypeptide chain release factors  40.54 
 
 
227 aa  46.6  0.0005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.242391  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2216  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  30.67 
 
 
439 aa  46.6  0.0006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.00316265  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2576  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  42.59 
 
 
490 aa  46.6  0.0006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0817224  hitchhiker  0.000552894 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1295  RNA methyltransferase  27.66 
 
 
476 aa  46.2  0.0007  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000293917  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3373  modification methylase, HemK family  30.2 
 
 
285 aa  46.2  0.0007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.359412  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1049  hypothetical protein  28.57 
 
 
399 aa  46.2  0.0008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.157301  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0848  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  32.95 
 
 
442 aa  46.2  0.0008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.000210259  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23080  16S rRNA m(2)G 1207 methyltransferase  34.45 
 
 
217 aa  46.2  0.0008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0618095 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3549  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  36.54 
 
 
449 aa  46.2  0.0009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.029326  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3456  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  29.49 
 
 
449 aa  45.4  0.001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1224  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  35.59 
 
 
450 aa  45.4  0.001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00249304  hitchhiker  0.000020369 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>