134 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Huta_1011 on replicon NC_013158
Organism: Halorhabdus utahensis DSM 12940



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013158  Huta_1011  methyltransferase  100 
 
 
365 aa  721    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1200  methyltransferase  65.54 
 
 
360 aa  427  1e-118  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.55061  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2032  protein of unknown function Met10  53.15 
 
 
409 aa  334  1e-90  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0202  protein of unknown function Met10  50.5 
 
 
416 aa  319  6e-86  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2406  methyltransferase  41.21 
 
 
343 aa  220  1.9999999999999999e-56  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0438473  normal  0.327054 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0655  methyltransferase  36.18 
 
 
337 aa  191  2e-47  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0736  protein of unknown function Met10  37.79 
 
 
341 aa  184  3e-45  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0011  protein of unknown function Met10  39.15 
 
 
346 aa  175  9.999999999999999e-43  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1579  protein of unknown function Met10  41.35 
 
 
253 aa  162  7e-39  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.891505  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1437  protein of unknown function Met10  39.81 
 
 
256 aa  158  1e-37  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.228358  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1392  methyltransferase  35.18 
 
 
336 aa  153  5e-36  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1047  methyltransferase  41.26 
 
 
253 aa  150  4e-35  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0333  protein of unknown function Met10  41.75 
 
 
253 aa  150  5e-35  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0961  methyltransferase  34.8 
 
 
331 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000000822635  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0829  protein of unknown function Met10  41.67 
 
 
288 aa  142  9e-33  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0995371 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0636  protein of unknown function Met10  32.08 
 
 
272 aa  141  1.9999999999999998e-32  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0809  protein of unknown function Met10  36.43 
 
 
283 aa  136  7.000000000000001e-31  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0242  methyltransferase  36.79 
 
 
326 aa  136  7.000000000000001e-31  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.406205  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1885  protein of unknown function Met10  37.18 
 
 
288 aa  135  8e-31  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0169921  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0895  protein of unknown function Met10  36.23 
 
 
366 aa  133  3.9999999999999996e-30  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.249454  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1237  protein of unknown function Met10  38.11 
 
 
289 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.220421  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0923  hypothetical protein  42.08 
 
 
289 aa  130  3e-29  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2749  protein of unknown function Met10  35.53 
 
 
326 aa  129  7.000000000000001e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0733  protein of unknown function Met10  34.33 
 
 
329 aa  122  8e-27  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.213021 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0121  protein of unknown function Met10  32.08 
 
 
311 aa  119  9e-26  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0021  protein of unknown function Met10  33.02 
 
 
328 aa  119  9.999999999999999e-26  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1954  methyltransferase  36.47 
 
 
333 aa  117  3.9999999999999997e-25  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_34943  predicted protein  33.71 
 
 
278 aa  115  1.0000000000000001e-24  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0396356  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1351  methyltransferase  24.14 
 
 
342 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0628  protein of unknown function Met10  28.41 
 
 
342 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2309  protein of unknown function Met10  31.15 
 
 
273 aa  110  3e-23  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  hitchhiker  0.00822645 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1952  protein of unknown function Met10  33.33 
 
 
273 aa  110  3e-23  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.830439  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0714  protein of unknown function Met10  34.27 
 
 
273 aa  107  3e-22  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.307474 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1668  protein of unknown function Met10  38.27 
 
 
292 aa  107  3e-22  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.384842  normal  0.847936 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1325  protein of unknown function Met10  26.44 
 
 
342 aa  104  2e-21  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.428653  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1334  protein of unknown function Met10  24.62 
 
 
344 aa  102  8e-21  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.985336  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0275  protein of unknown function Met10  25.73 
 
 
355 aa  100  5e-20  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  hitchhiker  0.000958711  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0138  protein of unknown function Met10  31.82 
 
 
303 aa  97.1  4e-19  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2080  methyltransferase  31.15 
 
 
277 aa  92.8  8e-18  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2646  protein of unknown function Met10  30.22 
 
 
315 aa  90.9  3e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0927799  normal  0.180049 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0343  protein of unknown function Met10  28.79 
 
 
288 aa  90.9  3e-17  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_45914  predicted protein  30.36 
 
 
459 aa  90.5  4e-17  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0294  hypothetical protein  27.09 
 
 
275 aa  89.4  1e-16  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00604747 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2364  protein of unknown function Met10  34.2 
 
 
304 aa  85.9  0.000000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0245  protein of unknown function Met10  27.78 
 
 
259 aa  85.1  0.000000000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3003  protein of unknown function Met10  30.73 
 
 
305 aa  84.7  0.000000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.7615  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1658  methyltransferase  31.1 
 
 
308 aa  81.3  0.00000000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  hitchhiker  0.00000328527 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3196  protein of unknown function Met10  29.3 
 
 
265 aa  80.1  0.00000000000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0603  methyltransferase  30.84 
 
 
256 aa  76.3  0.0000000000009  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.372647  normal  0.441209 
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_47967  predicted protein  29.17 
 
 
587 aa  74.7  0.000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_38572  predicted protein  28.14 
 
 
410 aa  72.8  0.000000000008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  hitchhiker  0.00890076 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0744  methyltransferase  28.72 
 
 
288 aa  66.2  0.0000000007  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.274994  normal  0.183253 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_10361  tRNA (guanine) methyltransferase Trm5 (AFU_orthologue; AFUA_3G08030)  24.12 
 
 
478 aa  61.2  0.00000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.142458  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1032  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  26.97 
 
 
443 aa  58.2  0.0000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0127983  normal 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44373  predicted protein  27.16 
 
 
436 aa  58.5  0.0000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_46848  predicted protein  30.82 
 
 
577 aa  55.8  0.000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0655849  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0041  protein of unknown function Met10  26 
 
 
272 aa  51.6  0.00002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1286  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  37.8 
 
 
442 aa  52  0.00002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0270354  unclonable  0.00000000011365 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_4035  PUA domain containing protein  26.89 
 
 
389 aa  50.8  0.00004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.362966  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2348  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  34.67 
 
 
472 aa  50.4  0.00004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.776247  normal  0.0482024 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1761  oxidoreductase  30.62 
 
 
389 aa  50.4  0.00004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1839  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  34.67 
 
 
472 aa  50.4  0.00004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0012393  normal  0.235598 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3354  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  34.45 
 
 
443 aa  50.4  0.00004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0093271  hitchhiker  0.000473524 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1828  hypothetical protein  30.62 
 
 
389 aa  50.4  0.00004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.929329  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0965  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  34.67 
 
 
473 aa  49.7  0.00008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5118  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  35.9 
 
 
465 aa  48.9  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.124268  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6262  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  35.9 
 
 
465 aa  48.9  0.0001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1755  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  35.9 
 
 
484 aa  48.9  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1817  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  35.9 
 
 
465 aa  48.9  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.17151  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1456  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  35.9 
 
 
487 aa  49.3  0.0001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.598645 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1841  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  35.9 
 
 
465 aa  49.3  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.874713  normal  0.190141 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1728  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  35.9 
 
 
484 aa  48.5  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.171324  normal  0.164124 
 
 
-
 
NC_006694  CNI01900  tRNA (guanine) methyltransferase, putative  22.15 
 
 
543 aa  47.8  0.0003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0223  SAM-dependent methyltransferase  28.34 
 
 
397 aa  47.8  0.0003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2239  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  47.92 
 
 
449 aa  47.8  0.0003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3851  protein of unknown function Met10  29.03 
 
 
388 aa  47.8  0.0003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.848902  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0660  RNA methyltransferase, TrmA family  26.71 
 
 
475 aa  47.8  0.0003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.107668  normal  0.988536 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0846  SAM-dependent methyltransferase  29.89 
 
 
391 aa  47.4  0.0004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1181  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  28.67 
 
 
445 aa  47.4  0.0004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0405802  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1412  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  37.88 
 
 
444 aa  47  0.0005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1350  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  34.67 
 
 
465 aa  46.6  0.0006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0719078  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2360  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  34.67 
 
 
465 aa  46.6  0.0006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.410673  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1840  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  34.67 
 
 
485 aa  47  0.0006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0057  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  34.67 
 
 
465 aa  46.6  0.0006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.536536  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2195  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  34.67 
 
 
485 aa  47  0.0006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2233  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  34.67 
 
 
465 aa  47  0.0006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.206864  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1112  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  34.67 
 
 
465 aa  46.6  0.0006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.191948  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2030  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  40 
 
 
440 aa  47  0.0006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000223089  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3088  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  42.31 
 
 
433 aa  45.4  0.001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000282752  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3456  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  32.22 
 
 
449 aa  46.2  0.001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1572  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  37.88 
 
 
444 aa  46.2  0.001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03498  oxidoreductase  26.32 
 
 
364 aa  45.4  0.001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.906105  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4083  RNA methyltransferase, TrmA family  43.48 
 
 
461 aa  45.8  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1048  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  28.57 
 
 
455 aa  45.8  0.001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.00366869  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4122  RNA methyltransferase, TrmA family  43.48 
 
 
461 aa  45.8  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.840048 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2766  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  25 
 
 
450 aa  45.8  0.001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000280871  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02630  23S rRNA (uracil-5-)-methyltransferase  42.31 
 
 
433 aa  45.4  0.002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00985329  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0903  RNA methyltransferase, TrmA family  42.31 
 
 
433 aa  45.4  0.002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000019395  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2971  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  42.37 
 
 
444 aa  45.1  0.002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.422086  hitchhiker  0.0000745246 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1201  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  34.38 
 
 
444 aa  44.7  0.002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0455461  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>