225 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_2749 on replicon NC_013743
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013743  Htur_2749  protein of unknown function Met10  100 
 
 
326 aa  649    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0895  protein of unknown function Met10  70.25 
 
 
366 aa  503  1e-141  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.249454  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1954  methyltransferase  72.37 
 
 
333 aa  468  1.0000000000000001e-131  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0242  methyltransferase  71.78 
 
 
326 aa  468  1.0000000000000001e-131  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.406205  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0733  protein of unknown function Met10  67.68 
 
 
329 aa  421  1e-117  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.213021 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1392  methyltransferase  41.37 
 
 
336 aa  262  6.999999999999999e-69  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0961  methyltransferase  40.06 
 
 
331 aa  244  9.999999999999999e-64  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000000822635  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0021  protein of unknown function Met10  39.38 
 
 
328 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1334  protein of unknown function Met10  32.37 
 
 
344 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.985336  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0121  protein of unknown function Met10  33.54 
 
 
311 aa  165  1.0000000000000001e-39  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1325  protein of unknown function Met10  31.43 
 
 
342 aa  163  3e-39  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.428653  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2646  protein of unknown function Met10  33.33 
 
 
315 aa  157  2e-37  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0927799  normal  0.180049 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0628  protein of unknown function Met10  30.86 
 
 
342 aa  156  4e-37  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1351  methyltransferase  30.29 
 
 
342 aa  153  4e-36  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0809  protein of unknown function Met10  40.09 
 
 
283 aa  150  3e-35  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3003  protein of unknown function Met10  33.54 
 
 
305 aa  149  5e-35  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.7615  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0275  protein of unknown function Met10  27.68 
 
 
355 aa  148  1.0000000000000001e-34  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  hitchhiker  0.000958711  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0138  protein of unknown function Met10  35.69 
 
 
303 aa  146  5e-34  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2364  protein of unknown function Met10  37.05 
 
 
304 aa  141  1.9999999999999998e-32  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1658  methyltransferase  31.6 
 
 
308 aa  138  2e-31  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  hitchhiker  0.00000328527 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1011  methyltransferase  35.53 
 
 
365 aa  129  6e-29  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2406  methyltransferase  28.74 
 
 
343 aa  128  1.0000000000000001e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0438473  normal  0.327054 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1952  protein of unknown function Met10  33.09 
 
 
273 aa  126  5e-28  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.830439  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0294  hypothetical protein  33.94 
 
 
275 aa  125  1e-27  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00604747 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2309  protein of unknown function Met10  31.99 
 
 
273 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  hitchhiker  0.00822645 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_38572  predicted protein  35.6 
 
 
410 aa  118  1.9999999999999998e-25  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  hitchhiker  0.00890076 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0343  protein of unknown function Met10  28.78 
 
 
288 aa  117  3.9999999999999997e-25  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1200  methyltransferase  33.62 
 
 
360 aa  116  6e-25  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.55061  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2080  methyltransferase  33.82 
 
 
277 aa  116  6e-25  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0714  protein of unknown function Met10  32.35 
 
 
273 aa  113  5e-24  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.307474 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3196  protein of unknown function Met10  30.22 
 
 
265 aa  109  5e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0011  protein of unknown function Met10  26.73 
 
 
346 aa  109  6e-23  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1237  protein of unknown function Met10  32.37 
 
 
289 aa  107  4e-22  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.220421  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0202  protein of unknown function Met10  35.78 
 
 
416 aa  103  3e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1579  protein of unknown function Met10  25.98 
 
 
253 aa  103  4e-21  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.891505  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2032  protein of unknown function Met10  37.61 
 
 
409 aa  101  2e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1437  protein of unknown function Met10  25.69 
 
 
256 aa  100  3e-20  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.228358  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0333  protein of unknown function Met10  27.95 
 
 
253 aa  100  5e-20  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0829  protein of unknown function Met10  30.35 
 
 
288 aa  99.8  6e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0995371 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_45914  predicted protein  35.88 
 
 
459 aa  99.4  8e-20  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0245  protein of unknown function Met10  31.74 
 
 
259 aa  99  1e-19  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1047  methyltransferase  27.71 
 
 
253 aa  98.2  2e-19  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0655  methyltransferase  25.97 
 
 
337 aa  97.1  4e-19  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0736  protein of unknown function Met10  32.71 
 
 
341 aa  92  1e-17  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_47967  predicted protein  36.36 
 
 
587 aa  91.7  2e-17  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006694  CNI01900  tRNA (guanine) methyltransferase, putative  36.8 
 
 
543 aa  90.1  4e-17  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0923  hypothetical protein  31.45 
 
 
289 aa  88.6  1e-16  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1668  protein of unknown function Met10  33.65 
 
 
292 aa  88.6  1e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.384842  normal  0.847936 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_10361  tRNA (guanine) methyltransferase Trm5 (AFU_orthologue; AFUA_3G08030)  30.62 
 
 
478 aa  85.9  9e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.142458  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1885  protein of unknown function Met10  27.54 
 
 
288 aa  85.1  0.000000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0169921  normal 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44373  predicted protein  32.42 
 
 
436 aa  84.3  0.000000000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0636  protein of unknown function Met10  25.63 
 
 
272 aa  84  0.000000000000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0603  methyltransferase  27.54 
 
 
256 aa  81.6  0.00000000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.372647  normal  0.441209 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_34943  predicted protein  32 
 
 
278 aa  79.3  0.00000000000008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0396356  normal 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_46848  predicted protein  25.65 
 
 
577 aa  75.9  0.0000000000009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0655849  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0744  methyltransferase  27.4 
 
 
288 aa  67  0.0000000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.274994  normal  0.183253 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1032  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  32.59 
 
 
443 aa  60.5  0.00000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0127983  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0072  SAM-dependent methyltransferase  36.7 
 
 
439 aa  60.1  0.00000006  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4122  RNA methyltransferase, TrmA family  32.97 
 
 
461 aa  58.2  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.840048 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4083  RNA methyltransferase, TrmA family  32.97 
 
 
461 aa  58.2  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0041  protein of unknown function Met10  27.91 
 
 
272 aa  56.2  0.0000008  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3116  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  39.74 
 
 
431 aa  55.5  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0559824  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22980  SAM-dependent methyltransferase  35.4 
 
 
416 aa  55.8  0.000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000733541  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3354  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  48.08 
 
 
443 aa  54.7  0.000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0093271  hitchhiker  0.000473524 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1286  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  46.15 
 
 
442 aa  53.9  0.000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0270354  unclonable  0.00000000011365 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2157  RNA methyltransferase, TrmA family  26.28 
 
 
471 aa  53.5  0.000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.615925  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3179  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  38.46 
 
 
431 aa  53.5  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0330224  normal  0.448815 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3163  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  37.18 
 
 
431 aa  53.1  0.000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0558904  normal  0.0471726 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3277  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  37.18 
 
 
431 aa  53.1  0.000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0400124  normal  0.0635589 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3098  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  37.18 
 
 
431 aa  53.1  0.000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000185167  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1176  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  45.83 
 
 
463 aa  52.4  0.000009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0393959  normal  0.0809579 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1110  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  45.83 
 
 
449 aa  52.8  0.000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0268238  normal  0.546108 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2971  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  36.14 
 
 
444 aa  52  0.00001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.422086  hitchhiker  0.0000745246 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0028  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  30.66 
 
 
434 aa  51.6  0.00002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1110  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  43.75 
 
 
463 aa  50.8  0.00003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0371274  normal  0.891306 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1340  23S rRNA (uracil-5-)-methyltransferase RumA  28.33 
 
 
465 aa  50.4  0.00004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.308627 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2903  RNA methyltransferase, TrmA family  39.39 
 
 
438 aa  50.4  0.00004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0098  methyltransferase type 11  25 
 
 
262 aa  50.4  0.00004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.972554  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1095  RNA methyltransferase  30.08 
 
 
465 aa  50.1  0.00005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.31205 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1354  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  34.12 
 
 
445 aa  50.4  0.00005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.961347  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3456  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  33.8 
 
 
449 aa  50.1  0.00006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1919  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  29.47 
 
 
498 aa  50.1  0.00006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.149056 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0814  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  39.47 
 
 
444 aa  49.7  0.00007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.034918  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2519  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  27.27 
 
 
438 aa  49.7  0.00007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.163711  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3549  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  34.62 
 
 
449 aa  49.3  0.00008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.029326  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1527  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  34.57 
 
 
443 aa  49.3  0.00008  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.334033  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3390  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  32.18 
 
 
449 aa  49.3  0.00008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.02988  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1342  protein of unknown function Met10  33.33 
 
 
390 aa  48.5  0.0001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.425757  hitchhiker  0.0000000474621 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4832  RNA methyltransferase, TrmA family  33.65 
 
 
459 aa  48.9  0.0001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000374128  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1470  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  34.57 
 
 
468 aa  48.9  0.0001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.00598904  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1637  RNA methyltransferase  34.12 
 
 
475 aa  48.5  0.0001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1343  putative RNA methylase  29.63 
 
 
400 aa  48.9  0.0001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.417493  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2030  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  30.49 
 
 
440 aa  48.5  0.0001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000223089  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02630  23S rRNA (uracil-5-)-methyltransferase  33.33 
 
 
433 aa  48.5  0.0002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00985329  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0927  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  33.33 
 
 
433 aa  48.1  0.0002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000132702  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2929  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  33.33 
 
 
433 aa  48.1  0.0002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000010107  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3089  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  33.33 
 
 
433 aa  48.1  0.0002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000243199  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3088  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  33.33 
 
 
433 aa  48.5  0.0002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000282752  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2309  RNA methyltransferase  32.08 
 
 
493 aa  48.1  0.0002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.12141  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02592  hypothetical protein  33.33 
 
 
433 aa  48.5  0.0002  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00971306  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>