40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATR_46848 on replicon NC_011679
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011679  PHATR_46848  predicted protein  100 
 
 
577 aa  1200    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0655849  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1392  methyltransferase  28.03 
 
 
336 aa  92.8  2e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0021  protein of unknown function Met10  28.67 
 
 
328 aa  90.5  8e-17  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0242  methyltransferase  27.46 
 
 
326 aa  87  8e-16  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.406205  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0961  methyltransferase  27.74 
 
 
331 aa  85.9  0.000000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000000822635  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1954  methyltransferase  27.72 
 
 
333 aa  82  0.00000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0294  hypothetical protein  24.23 
 
 
275 aa  82.4  0.00000000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00604747 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0809  protein of unknown function Met10  27.8 
 
 
283 aa  81.6  0.00000000000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0121  protein of unknown function Met10  35.29 
 
 
311 aa  77  0.0000000000009  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3196  protein of unknown function Met10  29.44 
 
 
265 aa  77  0.0000000000009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2749  protein of unknown function Met10  25.65 
 
 
326 aa  75.9  0.000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1351  methyltransferase  24.71 
 
 
342 aa  75.5  0.000000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1334  protein of unknown function Met10  28.84 
 
 
344 aa  71.2  0.00000000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.985336  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1325  protein of unknown function Met10  26.64 
 
 
342 aa  71.6  0.00000000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.428653  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0628  protein of unknown function Met10  25.09 
 
 
342 aa  70.5  0.00000000007  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0895  protein of unknown function Met10  26.37 
 
 
366 aa  69.7  0.0000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.249454  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2080  methyltransferase  31.68 
 
 
277 aa  68.9  0.0000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0733  protein of unknown function Met10  27.07 
 
 
329 aa  66.2  0.000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.213021 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0714  protein of unknown function Met10  29.41 
 
 
273 aa  66.2  0.000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.307474 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1952  protein of unknown function Met10  30.1 
 
 
273 aa  65.1  0.000000004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.830439  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3003  protein of unknown function Met10  30.5 
 
 
305 aa  63.9  0.000000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.7615  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2309  protein of unknown function Met10  27.04 
 
 
273 aa  63.9  0.000000008  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  hitchhiker  0.00822645 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0245  protein of unknown function Met10  25.98 
 
 
259 aa  62.4  0.00000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0603  methyltransferase  30.82 
 
 
256 aa  62  0.00000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.372647  normal  0.441209 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2364  protein of unknown function Met10  25.8 
 
 
304 aa  57  0.0000009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0343  protein of unknown function Met10  24.25 
 
 
288 aa  56.6  0.000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0275  protein of unknown function Met10  24.33 
 
 
355 aa  55.8  0.000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  hitchhiker  0.000958711  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1011  methyltransferase  25 
 
 
365 aa  55.5  0.000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1658  methyltransferase  30.4 
 
 
308 aa  55.5  0.000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  hitchhiker  0.00000328527 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_56695  predicted protein  27.07 
 
 
285 aa  55.5  0.000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.077918  normal  0.102052 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2646  protein of unknown function Met10  41.1 
 
 
315 aa  55.5  0.000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0927799  normal  0.180049 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0138  protein of unknown function Met10  28.25 
 
 
303 aa  53.1  0.00001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2406  methyltransferase  22.18 
 
 
343 aa  52.4  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0438473  normal  0.327054 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0011  protein of unknown function Met10  30.14 
 
 
346 aa  49.3  0.0002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0744  methyltransferase  30.99 
 
 
288 aa  47.4  0.0008  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.274994  normal  0.183253 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_34943  predicted protein  30.77 
 
 
278 aa  46.6  0.001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0396356  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1200  methyltransferase  24.74 
 
 
360 aa  46.2  0.002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.55061  normal 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44373  predicted protein  28.03 
 
 
436 aa  45.4  0.002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1321  hypothetical protein  35.38 
 
 
194 aa  46.2  0.002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2032  protein of unknown function Met10  27.15 
 
 
409 aa  43.9  0.008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>