131 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_2646 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011832  Mpal_2646  protein of unknown function Met10  100 
 
 
315 aa  640    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0927799  normal  0.180049 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2364  protein of unknown function Met10  60.54 
 
 
304 aa  319  3.9999999999999996e-86  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3003  protein of unknown function Met10  51.99 
 
 
305 aa  308  8e-83  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.7615  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0138  protein of unknown function Met10  53.31 
 
 
303 aa  298  7e-80  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1658  methyltransferase  51.96 
 
 
308 aa  297  1e-79  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  hitchhiker  0.00000328527 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1392  methyltransferase  34.95 
 
 
336 aa  187  1e-46  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0021  protein of unknown function Met10  33.44 
 
 
328 aa  161  1e-38  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0733  protein of unknown function Met10  34.77 
 
 
329 aa  158  1e-37  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.213021 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2749  protein of unknown function Met10  33.33 
 
 
326 aa  157  2e-37  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0961  methyltransferase  29.79 
 
 
331 aa  151  1e-35  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000000822635  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0242  methyltransferase  30.58 
 
 
326 aa  142  5e-33  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.406205  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1351  methyltransferase  29.94 
 
 
342 aa  140  3e-32  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1334  protein of unknown function Met10  28.91 
 
 
344 aa  140  3.9999999999999997e-32  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.985336  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0628  protein of unknown function Met10  28.95 
 
 
342 aa  139  4.999999999999999e-32  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0895  protein of unknown function Met10  34.82 
 
 
366 aa  137  3.0000000000000003e-31  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.249454  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0121  protein of unknown function Met10  28.33 
 
 
311 aa  132  6.999999999999999e-30  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1325  protein of unknown function Met10  29.33 
 
 
342 aa  132  9e-30  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.428653  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0275  protein of unknown function Met10  35.51 
 
 
355 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  hitchhiker  0.000958711  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1954  methyltransferase  30.28 
 
 
333 aa  127  2.0000000000000002e-28  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0294  hypothetical protein  33.49 
 
 
275 aa  122  7e-27  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00604747 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0011  protein of unknown function Met10  27.46 
 
 
346 aa  121  1.9999999999999998e-26  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0809  protein of unknown function Met10  36.97 
 
 
283 aa  117  1.9999999999999998e-25  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0245  protein of unknown function Met10  31.91 
 
 
259 aa  115  8.999999999999998e-25  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2406  methyltransferase  28.49 
 
 
343 aa  107  2e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0438473  normal  0.327054 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3196  protein of unknown function Met10  35.84 
 
 
265 aa  105  1e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2309  protein of unknown function Met10  32.64 
 
 
273 aa  104  2e-21  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  hitchhiker  0.00822645 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2080  methyltransferase  33.33 
 
 
277 aa  103  4e-21  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1952  protein of unknown function Met10  31.33 
 
 
273 aa  102  1e-20  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.830439  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0714  protein of unknown function Met10  31.84 
 
 
273 aa  100  2e-20  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.307474 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1579  protein of unknown function Met10  27.2 
 
 
253 aa  101  2e-20  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.891505  normal 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_38572  predicted protein  27.65 
 
 
410 aa  100  3e-20  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  hitchhiker  0.00890076 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1437  protein of unknown function Met10  27.42 
 
 
256 aa  99.8  5e-20  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.228358  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1047  methyltransferase  27.64 
 
 
253 aa  97.8  2e-19  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0603  methyltransferase  28.34 
 
 
256 aa  98.2  2e-19  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.372647  normal  0.441209 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0636  protein of unknown function Met10  23.47 
 
 
272 aa  93.6  4e-18  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0333  protein of unknown function Met10  28 
 
 
253 aa  93.2  5e-18  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_47967  predicted protein  34.1 
 
 
587 aa  92.8  8e-18  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1011  methyltransferase  30.22 
 
 
365 aa  90.9  2e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_45914  predicted protein  33.11 
 
 
459 aa  89.7  6e-17  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_10361  tRNA (guanine) methyltransferase Trm5 (AFU_orthologue; AFUA_3G08030)  37.24 
 
 
478 aa  89  1e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.142458  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0041  protein of unknown function Met10  30.94 
 
 
272 aa  87.8  2e-16  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0343  protein of unknown function Met10  26.69 
 
 
288 aa  87.4  3e-16  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006694  CNI01900  tRNA (guanine) methyltransferase, putative  36.89 
 
 
543 aa  84.3  0.000000000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0744  methyltransferase  31.67 
 
 
288 aa  83.6  0.000000000000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.274994  normal  0.183253 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0655  methyltransferase  28.57 
 
 
337 aa  82.4  0.00000000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1237  protein of unknown function Met10  32.32 
 
 
289 aa  81.6  0.00000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.220421  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44373  predicted protein  32.35 
 
 
436 aa  81.6  0.00000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0736  protein of unknown function Met10  29.96 
 
 
341 aa  80.9  0.00000000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0923  hypothetical protein  26.96 
 
 
289 aa  80.1  0.00000000000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1200  methyltransferase  28.09 
 
 
360 aa  78.6  0.0000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.55061  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0829  protein of unknown function Met10  27.5 
 
 
288 aa  77.4  0.0000000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0995371 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1668  protein of unknown function Met10  27.4 
 
 
292 aa  71.2  0.00000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.384842  normal  0.847936 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0202  protein of unknown function Met10  28.27 
 
 
416 aa  69.3  0.00000000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2032  protein of unknown function Met10  27.92 
 
 
409 aa  67  0.0000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1885  protein of unknown function Met10  29.38 
 
 
288 aa  61.2  0.00000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0169921  normal 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_34943  predicted protein  28.27 
 
 
278 aa  57.8  0.0000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0396356  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_4035  PUA domain containing protein  29.63 
 
 
389 aa  55.5  0.000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.362966  normal 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_46848  predicted protein  41.1 
 
 
577 aa  55.5  0.000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0655849  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03498  oxidoreductase  24.51 
 
 
364 aa  53.9  0.000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.906105  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1452  RNA methyltransferase  33.1 
 
 
495 aa  50.8  0.00003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1649  RNA methyltransferase  26.79 
 
 
439 aa  50.4  0.00004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf754  tRNA (uracil-5-)-methyltransferase related enzyme  33.33 
 
 
449 aa  49.3  0.00008  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1544  RNA methyltransferase  26.67 
 
 
435 aa  48.9  0.0001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.144945  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1722  RNA methyltransferase  27.75 
 
 
439 aa  48.9  0.0001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2571  oxidoreductase  34.41 
 
 
413 aa  48.9  0.0001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.207896  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1868  RNA methyltransferase, TrmA family  43.08 
 
 
485 aa  48.9  0.0001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1332  RNA methyltransferase, TrmA family  33.94 
 
 
447 aa  48.1  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000710273 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2801  RNA methyltransferase  32.29 
 
 
470 aa  48.1  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3851  protein of unknown function Met10  31.43 
 
 
388 aa  47.8  0.0002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.848902  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2893  RNA methyltransferase, TrmA family  33.94 
 
 
572 aa  48.1  0.0002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1096  hypothetical protein  29.55 
 
 
393 aa  47  0.0004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000000465883  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22980  SAM-dependent methyltransferase  34 
 
 
416 aa  47  0.0005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000733541  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0756  hypothetical protein  31.45 
 
 
393 aa  46.2  0.0008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1828  hypothetical protein  26.79 
 
 
389 aa  45.8  0.0009  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.929329  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1086  methyltransferase small  30.56 
 
 
388 aa  45.8  0.0009  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2239  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  37.5 
 
 
449 aa  45.4  0.001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0340  RNA methyltransferase  27.59 
 
 
446 aa  45.1  0.001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0121257  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1761  oxidoreductase  26.79 
 
 
389 aa  45.8  0.001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4393  ribosomal protein L11 methyltransferase  34.52 
 
 
312 aa  44.7  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000946748  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4122  RNA methyltransferase, TrmA family  38.78 
 
 
461 aa  44.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.840048 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1226  hypothetical protein  31.06 
 
 
393 aa  44.7  0.002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.622889 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0892  hypothetical protein  33.55 
 
 
407 aa  44.7  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0805  ribosomal protein L11 methyltransferase  37.66 
 
 
312 aa  44.7  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000461178  decreased coverage  1.14716e-22 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4083  RNA methyltransferase, TrmA family  38.78 
 
 
461 aa  44.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4178  putative methyltransferase  32.77 
 
 
200 aa  44.7  0.002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2378  methyltransferase small  38.96 
 
 
341 aa  44.7  0.002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1541  hypothetical protein  29.66 
 
 
393 aa  44.7  0.002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.155369  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1014  methyltransferase small  33.55 
 
 
407 aa  44.7  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.955984  hitchhiker  0.00000000107776 
 
 
-
 
NC_002950  PG1095  RNA methyltransferase  27.81 
 
 
465 aa  44.3  0.003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.31205 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5164  methyltransferase  28.81 
 
 
200 aa  43.9  0.003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3679  methyltransferase small  29.93 
 
 
202 aa  43.9  0.003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0110795  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1145  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  28.79 
 
 
496 aa  43.5  0.004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.297742  normal  0.611309 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1048  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  32.56 
 
 
455 aa  43.9  0.004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.00366869  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0451  tRNA (uracil-5-)-methyltransferase related enzyme  31.67 
 
 
463 aa  43.9  0.004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.450901  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1143  hypothetical protein  26.76 
 
 
321 aa  43.9  0.004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1032  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  34.52 
 
 
443 aa  43.1  0.005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0127983  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1585  RNA methyltransferase  28.09 
 
 
471 aa  43.1  0.005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.953972  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4553  methyltransferase  30.25 
 
 
261 aa  43.1  0.006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.749759  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4297  ribosomal protein L11 methyltransferase  35.16 
 
 
312 aa  43.1  0.006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000247915  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3577  SAM-dependent methyltransferase-like protein  34.02 
 
 
308 aa  43.1  0.006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.586441 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>