103 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hmuk_1200 on replicon NC_013202
Organism: Halomicrobium mukohataei DSM 12286



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013202  Hmuk_1200  methyltransferase  100 
 
 
360 aa  707    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.55061  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1011  methyltransferase  65.54 
 
 
365 aa  447  1.0000000000000001e-124  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2032  protein of unknown function Met10  49.1 
 
 
409 aa  306  3e-82  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0202  protein of unknown function Met10  47.29 
 
 
416 aa  300  2e-80  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2406  methyltransferase  35.86 
 
 
343 aa  204  2e-51  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0438473  normal  0.327054 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0655  methyltransferase  34.81 
 
 
337 aa  194  3e-48  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0736  protein of unknown function Met10  35.36 
 
 
341 aa  174  2.9999999999999996e-42  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0011  protein of unknown function Met10  32.74 
 
 
346 aa  156  5.0000000000000005e-37  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1579  protein of unknown function Met10  36.21 
 
 
253 aa  152  1e-35  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.891505  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1437  protein of unknown function Met10  35.78 
 
 
256 aa  150  3e-35  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.228358  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1392  methyltransferase  28.89 
 
 
336 aa  143  4e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1047  methyltransferase  36.09 
 
 
253 aa  140  3e-32  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0333  protein of unknown function Met10  36.21 
 
 
253 aa  139  6e-32  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0961  methyltransferase  32.47 
 
 
331 aa  135  8e-31  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000000822635  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1237  protein of unknown function Met10  37.55 
 
 
289 aa  134  3e-30  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.220421  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0636  protein of unknown function Met10  29.05 
 
 
272 aa  133  5e-30  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0242  methyltransferase  33.24 
 
 
326 aa  131  2.0000000000000002e-29  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.406205  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1885  protein of unknown function Met10  34.88 
 
 
288 aa  130  3e-29  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0169921  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0733  protein of unknown function Met10  35.29 
 
 
329 aa  128  2.0000000000000002e-28  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.213021 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2749  protein of unknown function Met10  33.62 
 
 
326 aa  124  2e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0895  protein of unknown function Met10  35.19 
 
 
366 aa  124  2e-27  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.249454  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0923  hypothetical protein  35.09 
 
 
289 aa  123  5e-27  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0829  protein of unknown function Met10  33.06 
 
 
288 aa  119  9e-26  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0995371 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1954  methyltransferase  34.12 
 
 
333 aa  115  8.999999999999998e-25  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0809  protein of unknown function Met10  31.69 
 
 
283 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1668  protein of unknown function Met10  33.46 
 
 
292 aa  111  2.0000000000000002e-23  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.384842  normal  0.847936 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0021  protein of unknown function Met10  29.53 
 
 
328 aa  106  6e-22  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_34943  predicted protein  31.94 
 
 
278 aa  98.2  2e-19  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0396356  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1334  protein of unknown function Met10  24.04 
 
 
344 aa  96.7  6e-19  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.985336  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0121  protein of unknown function Met10  27.8 
 
 
311 aa  96.3  8e-19  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3003  protein of unknown function Met10  28.76 
 
 
305 aa  92.4  1e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.7615  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1351  methyltransferase  24.11 
 
 
342 aa  91.7  2e-17  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1952  protein of unknown function Met10  30.28 
 
 
273 aa  91.7  2e-17  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.830439  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2309  protein of unknown function Met10  28.01 
 
 
273 aa  90.5  4e-17  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  hitchhiker  0.00822645 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0628  protein of unknown function Met10  25.17 
 
 
342 aa  89.4  1e-16  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2364  protein of unknown function Met10  32.73 
 
 
304 aa  87.4  4e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0714  protein of unknown function Met10  28.17 
 
 
273 aa  85.5  0.000000000000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.307474 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2080  methyltransferase  29.96 
 
 
277 aa  85.1  0.000000000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1325  protein of unknown function Met10  25.17 
 
 
342 aa  84.3  0.000000000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.428653  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0294  hypothetical protein  24.55 
 
 
275 aa  84.3  0.000000000000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00604747 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0275  protein of unknown function Met10  25.79 
 
 
355 aa  82.8  0.000000000000009  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  hitchhiker  0.000958711  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0138  protein of unknown function Met10  28.79 
 
 
303 aa  79.7  0.00000000000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0343  protein of unknown function Met10  26.22 
 
 
288 aa  79  0.0000000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2646  protein of unknown function Met10  28.09 
 
 
315 aa  78.6  0.0000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0927799  normal  0.180049 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0603  methyltransferase  28.76 
 
 
256 aa  74.3  0.000000000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.372647  normal  0.441209 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0245  protein of unknown function Met10  27.74 
 
 
259 aa  73.2  0.000000000007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1658  methyltransferase  27.37 
 
 
308 aa  71.2  0.00000000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  hitchhiker  0.00000328527 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_45914  predicted protein  25.25 
 
 
459 aa  68.9  0.0000000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3196  protein of unknown function Met10  24.4 
 
 
265 aa  64.3  0.000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_38572  predicted protein  24.65 
 
 
410 aa  64.3  0.000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  hitchhiker  0.00890076 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1032  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  29.31 
 
 
443 aa  62.4  0.00000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0127983  normal 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44373  predicted protein  24.74 
 
 
436 aa  58.2  0.0000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1286  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  28.67 
 
 
442 aa  54.3  0.000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0270354  unclonable  0.00000000011365 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3456  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  31.96 
 
 
449 aa  53.1  0.000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_46848  predicted protein  25.41 
 
 
577 aa  53.1  0.000008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0655849  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1181  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  31.9 
 
 
445 aa  52.8  0.000009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0405802  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3851  protein of unknown function Met10  33.97 
 
 
388 aa  52  0.00001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.848902  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1201  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  32.99 
 
 
444 aa  52  0.00002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0455461  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1295  RNA methyltransferase  41.79 
 
 
476 aa  50.8  0.00004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000293917  n/a   
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_47967  predicted protein  23.12 
 
 
587 aa  50.4  0.00005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1851  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  40.62 
 
 
445 aa  50.1  0.00006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1176  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  30.93 
 
 
463 aa  49.7  0.00007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0393959  normal  0.0809579 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1110  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  30.93 
 
 
449 aa  49.7  0.00007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0268238  normal  0.546108 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0028  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  41.03 
 
 
434 aa  49.7  0.00008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3354  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  29.9 
 
 
443 aa  49.7  0.00009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0093271  hitchhiker  0.000473524 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1110  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  30.93 
 
 
463 aa  49.3  0.0001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0371274  normal  0.891306 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1048  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  28.68 
 
 
455 aa  49.3  0.0001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.00366869  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0851  23S rRNA (uracil-5-)-methyltransferase  44.26 
 
 
432 aa  48.9  0.0002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0954916  hitchhiker  0.000117621 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2766  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  25.52 
 
 
450 aa  48.1  0.0002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000280871  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2823  O-methyltransferase family 3  28.93 
 
 
227 aa  48.5  0.0002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2938  methyltransferase small  33.33 
 
 
222 aa  48.9  0.0002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0167058  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3147  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  27.84 
 
 
450 aa  47.8  0.0003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0637752  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3145  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  27.84 
 
 
450 aa  47.8  0.0003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000412374  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3290  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  27.84 
 
 
450 aa  47.8  0.0003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0140033  hitchhiker  0.000775175 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1224  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  27.84 
 
 
450 aa  47.8  0.0003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00249304  hitchhiker  0.000020369 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2239  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  38.04 
 
 
449 aa  47.4  0.0004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0905  tRNA methyltransferase complex GCD14 subunit  31.93 
 
 
296 aa  47.4  0.0004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.56455  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3779  protein of unknown function Met10  31.1 
 
 
389 aa  46.6  0.0007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.318732  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3862  protein of unknown function Met10  31.1 
 
 
389 aa  46.6  0.0007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3722  SAM-dependent methyltransferase  31.71 
 
 
389 aa  46.2  0.0008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2751  methyltransferase small  36.79 
 
 
309 aa  46.2  0.0008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0801  23S rRNA methyltransferase/RumA  66.67 
 
 
447 aa  44.7  0.002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2348  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  38.46 
 
 
472 aa  44.7  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.776247  normal  0.0482024 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2360  methyltransferase type 12  30.82 
 
 
319 aa  45.1  0.002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.328542  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1839  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  34.94 
 
 
472 aa  45.1  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0012393  normal  0.235598 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0627  Fmu (Sun) domain protein  39.19 
 
 
438 aa  44.7  0.002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.114528 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3184  methyltransferase small  26.79 
 
 
244 aa  45.1  0.002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.241453  normal  0.13403 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002503  23S rRNA (Uracil-5-)-methyltransferase rumA  24.7 
 
 
439 aa  44.7  0.002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.088353  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2112  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  36.67 
 
 
491 aa  44.3  0.003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0203471  normal  0.384395 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0846  SAM-dependent methyltransferase  28.65 
 
 
391 aa  44.3  0.003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0660  RNA methyltransferase, TrmA family  35.82 
 
 
475 aa  44.7  0.003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.107668  normal  0.988536 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_10361  tRNA (guanine) methyltransferase Trm5 (AFU_orthologue; AFUA_3G08030)  21.2 
 
 
478 aa  43.9  0.004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.142458  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2030  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  36.51 
 
 
440 aa  43.9  0.004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000223089  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4383  homocysteine S-methyltransferase  29.57 
 
 
578 aa  44.3  0.004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1637  RNA methyltransferase  36.49 
 
 
475 aa  43.9  0.005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4083  RNA methyltransferase, TrmA family  35.29 
 
 
461 aa  43.5  0.006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4297  ribosomal protein L11 methyltransferase  35.59 
 
 
312 aa  43.5  0.006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000247915  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4122  RNA methyltransferase, TrmA family  35.29 
 
 
461 aa  43.5  0.006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.840048 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4230  O-methyltransferase family protein  25.33 
 
 
213 aa  43.1  0.008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0620204  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0800  tRNA methyltransferase complex GCD14 subunit  26.97 
 
 
270 aa  42.7  0.009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>