107 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_1237 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009051  Memar_1237  protein of unknown function Met10  100 
 
 		 289 aa  586  1e-166  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.220421  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1668  protein of unknown function Met10  58.9 
 
 		 292 aa  341  1e-92  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.384842  normal  0.847936 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0923  hypothetical protein  51.74 
 
 		 289 aa  316  2e-85  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1885  protein of unknown function Met10  53.47 
 
 		 288 aa  313  9.999999999999999e-85  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0169921  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0829  protein of unknown function Met10  46.71 
 
 		 288 aa  283  2.0000000000000002e-75  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0995371 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0655  methyltransferase  35.14 
 
 		 337 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1579  protein of unknown function Met10  31.47 
 
 		 253 aa  133  3.9999999999999996e-30  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.891505  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1200  methyltransferase  38.28 
 
 		 360 aa  132  5e-30  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.55061  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1011  methyltransferase  38.11 
 
 		 365 aa  132  9e-30  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2406  methyltransferase  36.22 
 
 		 343 aa  128  1.0000000000000001e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0438473  normal  0.327054 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0333  protein of unknown function Met10  33.07 
 
 		 253 aa  128  1.0000000000000001e-28  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1047  methyltransferase  36.68 
 
 		 253 aa  127  3e-28  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0736  protein of unknown function Met10  35.98 
 
 		 341 aa  125  6e-28  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2032  protein of unknown function Met10  52.42 
 
 		 409 aa  124  2e-27  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0011  protein of unknown function Met10  34.7 
 
 		 346 aa  123  4e-27  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0636  protein of unknown function Met10  28.84 
 
 		 272 aa  121  9.999999999999999e-27  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0202  protein of unknown function Met10  55.96 
 
 		 416 aa  117  1.9999999999999998e-25  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1437  protein of unknown function Met10  30.99 
 
 		 256 aa  116  3.9999999999999997e-25  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.228358  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0242  methyltransferase  35.66 
 
 		 326 aa  112  6e-24  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.406205  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0895  protein of unknown function Met10  34.89 
 
 		 366 aa  110  4.0000000000000004e-23  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.249454  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2749  protein of unknown function Met10  32.37 
 
 		 326 aa  107  3e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_34943  predicted protein  35.52 
 
 		 278 aa  103  5e-21  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0396356  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0733  protein of unknown function Met10  35.82 
 
 		 329 aa  103  5e-21  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.213021 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0121  protein of unknown function Met10  29.8 
 
 		 311 aa  95.9  7e-19  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1658  methyltransferase  31.79 
 
 		 308 aa  94.7  1e-18  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00000328527 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1954  methyltransferase  32.97 
 
 		 333 aa  93.2  5e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0021  protein of unknown function Met10  30.71 
 
 		 328 aa  88.6  1e-16  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1392  methyltransferase  29.84 
 
 		 336 aa  87.4  2e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0809  protein of unknown function Met10  32.41 
 
 		 283 aa  86.7  4e-16  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1334  protein of unknown function Met10  27.57 
 
 		 344 aa  84.3  0.000000000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.985336  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0275  protein of unknown function Met10  30.96 
 
 		 355 aa  82.8  0.000000000000007  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  hitchhiker  0.000958711  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0294  hypothetical protein  31.07 
 
 		 275 aa  82.4  0.000000000000007  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00604747 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1351  methyltransferase  30.77 
 
 		 342 aa  82.4  0.000000000000009  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0628  protein of unknown function Met10  30.26 
 
 		 342 aa  82  0.00000000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2646  protein of unknown function Met10  32.32 
 
 		 315 aa  81.6  0.00000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0927799  normal  0.180049 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1325  protein of unknown function Met10  30.77 
 
 		 342 aa  81.3  0.00000000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.428653  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2364  protein of unknown function Met10  32.97 
 
 		 304 aa  80.5  0.00000000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0961  methyltransferase  26.51 
 
 		 331 aa  79.7  0.00000000000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000000822635  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2080  methyltransferase  34.42 
 
 		 277 aa  79.7  0.00000000000006  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1952  protein of unknown function Met10  29.59 
 
 		 273 aa  76.6  0.0000000000004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.830439  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3003  protein of unknown function Met10  30.93 
 
 		 305 aa  74.7  0.000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.7615  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3196  protein of unknown function Met10  29.23 
 
 		 265 aa  75.1  0.000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0714  protein of unknown function Met10  29.29 
 
 		 273 aa  74.3  0.000000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.307474 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0138  protein of unknown function Met10  32.95 
 
 		 303 aa  72.8  0.000000000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0343  protein of unknown function Met10  27.67 
 
 		 288 aa  72  0.00000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2309  protein of unknown function Met10  29.05 
 
 		 273 aa  71.2  0.00000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00822645 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0603  methyltransferase  29.62 
 
 		 256 aa  70.5  0.00000000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.372647  normal  0.441209 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0245  protein of unknown function Met10  29.1 
 
 		 259 aa  69.3  0.00000000007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_38572  predicted protein  31.72 
 
 		 410 aa  65.9  0.0000000007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.00890076 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_45914  predicted protein  34.69 
 
 		 459 aa  62.4  0.00000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_10361  tRNA (guanine) methyltransferase Trm5 (AFU_orthologue; AFUA_3G08030)  34.26 
 
 		 478 aa  58.2  0.0000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.142458  normal  1 
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_47967  predicted protein  33.33 
 
 		 587 aa  53.9  0.000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4297  ribosomal protein L11 methyltransferase  36.99 
 
 		 312 aa  53.9  0.000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000247915  n/a   
 
 
-
 
NC_006694  CNI01900  tRNA (guanine) methyltransferase, putative  31.58 
 
 		 543 aa  53.5  0.000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1340  23S rRNA (uracil-5-)-methyltransferase RumA  25.96 
 
 		 465 aa  53.5  0.000004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.308627 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0299  precorrin-6Y C5,15-methyltransferase (decarboxylating), CbiT subunit  38.83 
 
 		 189 aa  52.8  0.000006  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.56429  normal  1 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44373  predicted protein  31.01 
 
 		 436 aa  51.2  0.00002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0851  23S rRNA (uracil-5-)-methyltransferase  37.5 
 
 		 432 aa  50.1  0.00004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0954916  hitchhiker  0.000117621 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1711  Cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  31.62 
 
 		 447 aa  50.1  0.00005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0226099  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1851  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  27.23 
 
 		 445 aa  49.3  0.00007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3088  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  30.56 
 
 		 433 aa  48.9  0.00009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000282752  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0573  50S ribosomal protein L11P methyltransferase  38.04 
 
 		 318 aa  48.5  0.0001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1201  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  33.75 
 
 		 444 aa  48.1  0.0001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0455461  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1994  ribosomal protein L11 methyltransferase  40.91 
 
 		 316 aa  48.9  0.0001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.467353  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02630  23S rRNA (uracil-5-)-methyltransferase  30.56 
 
 		 433 aa  47.8  0.0002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00985329  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0903  RNA methyltransferase, TrmA family  30.56 
 
 		 433 aa  47.8  0.0002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000019395  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2929  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  30.56 
 
 		 433 aa  47.8  0.0002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000010107  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3089  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  30.56 
 
 		 433 aa  47.8  0.0002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000243199  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0927  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  30.56 
 
 		 433 aa  47.8  0.0002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000132702  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2923  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  29.25 
 
 		 433 aa  47.8  0.0002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00164007  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03402  RNA methyltransferase, TrmA family protein  42.47 
 
 		 482 aa  48.1  0.0002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0345173  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02592  hypothetical protein  30.56 
 
 		 433 aa  47.8  0.0002  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00971306  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4199  SAM-dependent methyltransferase  27.67 
 
 		 399 aa  47  0.0003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0913  methyltransferase small  32.14 
 
 		 260 aa  47.4  0.0003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4045  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  30.56 
 
 		 433 aa  47.4  0.0003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000364507  normal  0.378409 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3178  methyltransferase type 11  39.78 
 
 		 239 aa  46.6  0.0005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.184817 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1015  ribosomal protein L11 methyltransferase  35.71 
 
 		 312 aa  46.6  0.0005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1401  methyltransferase type 11  33.33 
 
 		 270 aa  45.4  0.001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.30255  hitchhiker  0.000533063 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2676  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  30.22 
 
 		 485 aa  45.8  0.001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.877077 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_40540  predicted protein  34.25 
 
 		 421 aa  45.1  0.001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2360  methyltransferase type 12  28.93 
 
 		 319 aa  45.1  0.001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.328542  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00130  conserved hypothetical protein  31.82 
 
 		 439 aa  45.1  0.002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3144  hypothetical protein  29.45 
 
 		 402 aa  45.1  0.002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1209  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  32.14 
 
 		 450 aa  44.3  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0028  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  37.84 
 
 		 434 aa  44.7  0.002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1069  methyltransferase small  30.77 
 
 		 260 aa  44.3  0.002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0704702  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07230  methylase of polypeptide chain release factors  37.5 
 
 		 227 aa  44.7  0.002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.242391  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0412  hypothetical protein  28.31 
 
 		 398 aa  43.9  0.003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4764  hypothetical protein  28.31 
 
 		 398 aa  43.9  0.003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.095661 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0333  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  30.77 
 
 		 445 aa  43.9  0.003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.953487 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1286  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  33.33 
 
 		 442 aa  44.3  0.003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0270354  unclonable  0.00000000011365 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0801  23S rRNA methyltransferase/RumA  47.27 
 
 		 447 aa  43.5  0.004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3719  HemK family modification methylase  31.17 
 
 		 338 aa  43.5  0.004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.836815 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0970  23S rRNA (uracil-5-)-methyltransferase RumA  39.76 
 
 		 432 aa  43.1  0.005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1032  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  28.36 
 
 		 443 aa  43.1  0.005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0127983  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3067  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  32.19 
 
 		 486 aa  43.1  0.005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0799904  normal  0.0471962 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2435  ribosomal protein L11 methyltransferase  32.14 
 
 		 315 aa  43.1  0.005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0183971  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04640  hypothetical protein  30.67 
 
 		 398 aa  43.1  0.006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1977  hypothetical protein  30.12 
 
 		 297 aa  42.7  0.006  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.257048  hitchhiker  0.000740302 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0325  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  39.71 
 
 		 287 aa  42.7  0.006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.109217 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>