178 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hmuk_1954 on replicon NC_013202
Organism: Halomicrobium mukohataei DSM 12286



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013202  Hmuk_1954  methyltransferase  100 
 
 
333 aa  654    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2749  protein of unknown function Met10  72.37 
 
 
326 aa  468  1.0000000000000001e-131  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0242  methyltransferase  71.77 
 
 
326 aa  467  9.999999999999999e-131  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.406205  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0895  protein of unknown function Met10  60.43 
 
 
366 aa  417  9.999999999999999e-116  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.249454  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0733  protein of unknown function Met10  63.58 
 
 
329 aa  385  1e-106  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.213021 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1392  methyltransferase  38.6 
 
 
336 aa  238  1e-61  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0961  methyltransferase  38.24 
 
 
331 aa  233  4.0000000000000004e-60  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000000822635  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0021  protein of unknown function Met10  40.06 
 
 
328 aa  198  9e-50  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1325  protein of unknown function Met10  29.69 
 
 
342 aa  152  5.9999999999999996e-36  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.428653  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1351  methyltransferase  28.33 
 
 
342 aa  150  2e-35  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1334  protein of unknown function Met10  29.26 
 
 
344 aa  148  1.0000000000000001e-34  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.985336  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0628  protein of unknown function Met10  29.69 
 
 
342 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0294  hypothetical protein  30.18 
 
 
275 aa  144  2e-33  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00604747 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0121  protein of unknown function Met10  32.65 
 
 
311 aa  143  4e-33  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3003  protein of unknown function Met10  32.62 
 
 
305 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.7615  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0275  protein of unknown function Met10  25.76 
 
 
355 aa  139  6e-32  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  hitchhiker  0.000958711  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2364  protein of unknown function Met10  35.14 
 
 
304 aa  135  9.999999999999999e-31  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0809  protein of unknown function Met10  34.31 
 
 
283 aa  133  5e-30  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1658  methyltransferase  30.61 
 
 
308 aa  128  1.0000000000000001e-28  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  hitchhiker  0.00000328527 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2646  protein of unknown function Met10  30.28 
 
 
315 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0927799  normal  0.180049 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0138  protein of unknown function Met10  36.58 
 
 
303 aa  125  7e-28  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2309  protein of unknown function Met10  33.33 
 
 
273 aa  122  8e-27  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  hitchhiker  0.00822645 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1952  protein of unknown function Met10  33.33 
 
 
273 aa  122  9.999999999999999e-27  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.830439  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1011  methyltransferase  36.47 
 
 
365 aa  117  3.9999999999999997e-25  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_38572  predicted protein  33.62 
 
 
410 aa  116  5e-25  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  hitchhiker  0.00890076 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2406  methyltransferase  31.82 
 
 
343 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0438473  normal  0.327054 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0714  protein of unknown function Met10  32.97 
 
 
273 aa  112  8.000000000000001e-24  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.307474 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2080  methyltransferase  33.7 
 
 
277 aa  110  3e-23  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1200  methyltransferase  36.84 
 
 
360 aa  105  8e-22  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.55061  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0343  protein of unknown function Met10  27.5 
 
 
288 aa  101  2e-20  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0245  protein of unknown function Met10  29.81 
 
 
259 aa  100  4e-20  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0011  protein of unknown function Met10  23.5 
 
 
346 aa  97.4  3e-19  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1579  protein of unknown function Met10  25.19 
 
 
253 aa  97.1  4e-19  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.891505  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2032  protein of unknown function Met10  36.75 
 
 
409 aa  97.1  4e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1047  methyltransferase  27.73 
 
 
253 aa  95.5  1e-18  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0202  protein of unknown function Met10  46.43 
 
 
416 aa  94.4  2e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1437  protein of unknown function Met10  25.76 
 
 
256 aa  94  3e-18  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.228358  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3196  protein of unknown function Met10  24.57 
 
 
265 aa  93.6  4e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1237  protein of unknown function Met10  32.97 
 
 
289 aa  93.2  6e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.220421  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_45914  predicted protein  28.46 
 
 
459 aa  90.1  5e-17  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0333  protein of unknown function Met10  26.05 
 
 
253 aa  88.6  1e-16  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0655  methyltransferase  27.74 
 
 
337 aa  87  4e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_47967  predicted protein  30.57 
 
 
587 aa  84.7  0.000000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1885  protein of unknown function Met10  29.02 
 
 
288 aa  83.6  0.000000000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0169921  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1668  protein of unknown function Met10  32.5 
 
 
292 aa  82.8  0.000000000000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.384842  normal  0.847936 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0829  protein of unknown function Met10  28.81 
 
 
288 aa  82.4  0.000000000000009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0995371 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_46848  predicted protein  27.72 
 
 
577 aa  82  0.00000000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0655849  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0736  protein of unknown function Met10  31.44 
 
 
341 aa  80.1  0.00000000000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006694  CNI01900  tRNA (guanine) methyltransferase, putative  30.38 
 
 
543 aa  79.3  0.00000000000007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44373  predicted protein  30.6 
 
 
436 aa  79.3  0.00000000000009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_34943  predicted protein  28.62 
 
 
278 aa  79.3  0.00000000000009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0396356  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0636  protein of unknown function Met10  23.59 
 
 
272 aa  79.3  0.00000000000009  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0923  hypothetical protein  28.91 
 
 
289 aa  77.4  0.0000000000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_10361  tRNA (guanine) methyltransferase Trm5 (AFU_orthologue; AFUA_3G08030)  27.84 
 
 
478 aa  75.5  0.000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.142458  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0603  methyltransferase  27.2 
 
 
256 aa  73.9  0.000000000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.372647  normal  0.441209 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0744  methyltransferase  26.34 
 
 
288 aa  69.7  0.00000000007  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.274994  normal  0.183253 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0041  protein of unknown function Met10  25.82 
 
 
272 aa  60.8  0.00000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0072  SAM-dependent methyltransferase  31.65 
 
 
439 aa  58.5  0.0000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4083  RNA methyltransferase, TrmA family  31.46 
 
 
461 aa  57  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4122  RNA methyltransferase, TrmA family  31.46 
 
 
461 aa  57  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.840048 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1295  RNA methyltransferase  31.3 
 
 
476 aa  56.2  0.0000008  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000293917  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3116  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  41.03 
 
 
431 aa  55.8  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0559824  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4383  homocysteine S-methyltransferase  47.14 
 
 
578 aa  54.7  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3098  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  38.46 
 
 
431 aa  53.9  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000185167  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3179  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  39.74 
 
 
431 aa  53.9  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0330224  normal  0.448815 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3163  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  38.46 
 
 
431 aa  53.5  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0558904  normal  0.0471726 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3277  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  38.46 
 
 
431 aa  53.5  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0400124  normal  0.0635589 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1637  RNA methyltransferase  36.78 
 
 
475 aa  53.1  0.000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3390  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  36.78 
 
 
449 aa  53.1  0.000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.02988  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3354  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  42.86 
 
 
443 aa  52.8  0.000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0093271  hitchhiker  0.000473524 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1110  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  42.37 
 
 
463 aa  52  0.00001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0371274  normal  0.891306 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1176  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  42.37 
 
 
463 aa  52.4  0.00001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0393959  normal  0.0809579 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1110  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  42.37 
 
 
449 aa  52  0.00001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0268238  normal  0.546108 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3456  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  42.37 
 
 
449 aa  51.2  0.00002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2519  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  29.27 
 
 
438 aa  51.6  0.00002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.163711  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1354  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  38.1 
 
 
445 aa  51.2  0.00002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.961347  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1888  methyltransferase type 11  27.04 
 
 
209 aa  51.2  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2971  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  36.47 
 
 
444 aa  51.2  0.00002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.422086  hitchhiker  0.0000745246 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1527  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  37.65 
 
 
443 aa  51.2  0.00002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.334033  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1286  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  37.08 
 
 
442 aa  51.6  0.00002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0270354  unclonable  0.00000000011365 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3549  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  44.23 
 
 
449 aa  51.2  0.00002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.029326  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0028  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  33.73 
 
 
434 aa  50.8  0.00003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1470  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  37.65 
 
 
468 aa  51.2  0.00003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.00598904  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2239  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  32.43 
 
 
449 aa  49.7  0.00006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3147  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  40 
 
 
450 aa  49.7  0.00007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0637752  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2216  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  36.84 
 
 
439 aa  49.3  0.00009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.00316265  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4661  putative RNA methylase  33.33 
 
 
224 aa  49.3  0.00009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0852329  normal  0.0763822 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2766  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  40 
 
 
450 aa  49.3  0.00009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000280871  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02630  23S rRNA (uracil-5-)-methyltransferase  40.82 
 
 
433 aa  48.9  0.0001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00985329  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0851  23S rRNA (uracil-5-)-methyltransferase  45.1 
 
 
432 aa  48.9  0.0001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0954916  hitchhiker  0.000117621 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1224  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  40 
 
 
450 aa  48.9  0.0001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00249304  hitchhiker  0.000020369 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3237  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  34.29 
 
 
431 aa  49.3  0.0001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0193521  normal  0.0341148 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3605  methyltransferase type 11  40.32 
 
 
262 aa  48.9  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.92675 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2929  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  40.82 
 
 
433 aa  48.9  0.0001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000010107  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3089  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  40.82 
 
 
433 aa  48.9  0.0001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000243199  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1181  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  39.34 
 
 
445 aa  48.5  0.0001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0405802  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3464  methyltransferase type 11  39.33 
 
 
249 aa  48.9  0.0001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0475337  hitchhiker  0.00905238 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3290  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  40 
 
 
450 aa  48.9  0.0001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0140033  hitchhiker  0.000775175 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3088  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  40.82 
 
 
433 aa  48.9  0.0001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000282752  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0927  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  40.82 
 
 
433 aa  48.9  0.0001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000132702  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>