91 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_2448 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010814  Glov_2448  SirA family protein  100 
 
 		 196 aa  393  1e-108  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000888888  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1085  hypothetical protein  55.84 
 
 		 196 aa  223  1e-57  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  5.60528e-18  hitchhiker  0.0000092747 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3765  SirA family protein  57.36 
 
 		 193 aa  221  4.9999999999999996e-57  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000718423  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2521  hypothetical protein  55.84 
 
 		 195 aa  211  7e-54  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.104075  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3433  SirA family protein  52.55 
 
 		 195 aa  208  4e-53  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000787487  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3495  SirA family protein  51.76 
 
 		 195 aa  206  2e-52  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  1.70288e-33 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1242  SirA family protein  46.46 
 
 		 196 aa  162  4.0000000000000004e-39  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3077  SirA family protein  37.88 
 
 		 199 aa  155  4e-37  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000237941 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0124  SirA-like  41.21 
 
 		 193 aa  151  5.9999999999999996e-36  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0144261  normal  0.614717 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2206  hypothetical protein  37.06 
 
 		 190 aa  148  5e-35  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2500  hypothetical protein  37.06 
 
 		 190 aa  147  7e-35  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0303  redox protein, regulator of disulfide bond formation  42.42 
 
 		 199 aa  146  2.0000000000000003e-34  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000562968  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1887  SirA-like protein  39.7 
 
 		 195 aa  138  7e-32  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0367  SirA family protein  34.34 
 
 		 199 aa  130  1.0000000000000001e-29  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11340  predicted redox protein, regulator of disulfide bond formation  35.86 
 
 		 203 aa  128  5.0000000000000004e-29  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.544302  normal  0.497017 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1708  hypothetical protein  36.1 
 
 		 204 aa  127  1.0000000000000001e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0132248  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4588  SirA family protein  36.82 
 
 		 197 aa  125  3e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.282378  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1487  SirA family protein  32.27 
 
 		 223 aa  125  3e-28  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1959  hypothetical protein  40.39 
 
 		 208 aa  124  7e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.51951  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1060  hypothetical protein  37.93 
 
 		 206 aa  123  2e-27  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2054  selenium metabolism protein YedF  37.06 
 
 		 196 aa  120  1.9999999999999998e-26  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1688  SirA family protein  34.48 
 
 		 204 aa  119  1.9999999999999998e-26  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.733385  normal  0.789276 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0361  putative transcriptional regulator  37.76 
 
 		 192 aa  115  3e-25  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2159  SirA family protein  35 
 
 		 197 aa  114  6.9999999999999995e-25  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000102186  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25450  predicted redox protein, regulator of disulfide bond formation  34.01 
 
 		 201 aa  113  1.0000000000000001e-24  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.337434  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0630  selenium metabolism protein YedF  36.22 
 
 		 198 aa  112  2.0000000000000002e-24  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0025612  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3402  SirA family protein  34.36 
 
 		 200 aa  112  3e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0293629 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0368  hypothetical protein  35.1 
 
 		 214 aa  112  3e-24  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.162867 
 
 
-
 
NC_002950  PG1888  hypothetical protein  32.84 
 
 		 204 aa  112  4.0000000000000004e-24  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.660532 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0248  SirA family protein  33.51 
 
 		 203 aa  111  8.000000000000001e-24  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.322 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0807  selenium metabolism protein YedF  33.33 
 
 		 211 aa  109  2.0000000000000002e-23  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.45173 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1417  hypothetical protein  34.6 
 
 		 212 aa  109  2.0000000000000002e-23  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.126908  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0677  hypothetical protein  33.51 
 
 		 197 aa  107  2e-22  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0251  SirA family protein  33.67 
 
 		 202 aa  106  2e-22  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1894  SirA family protein  36.67 
 
 		 209 aa  101  6e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00825245  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0830  hypothetical protein  39.82 
 
 		 114 aa  96.7  2e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000290687 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2136  translation initiation factor IF-3  32.18 
 
 		 200 aa  96.7  2e-19  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1678  hypothetical protein  30.3 
 
 		 190 aa  90.9  1e-17  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1497  hypothetical protein  30.3 
 
 		 190 aa  90.1  2e-17  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1857  hypothetical protein  29.8 
 
 		 190 aa  90.1  2e-17  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2431  selenium metabolism protein YedF  30.46 
 
 		 189 aa  88.6  5e-17  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00446585  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1779  hypothetical protein  29.35 
 
 		 199 aa  86.3  2e-16  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2893  SirA family protein  41.82 
 
 		 118 aa  86.7  2e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.455878  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1780  hypothetical protein  29.27 
 
 		 200 aa  80.1  0.00000000000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0463262  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0573  SirA-like protein  36.94 
 
 		 119 aa  76.3  0.0000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0576  SirA-like protein  36.94 
 
 		 119 aa  76.3  0.0000000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.676233  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1581  hypothetical protein  35.78 
 
 		 117 aa  76.3  0.0000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.38625  normal  0.052602 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0339  hypothetical protein  27.57 
 
 		 199 aa  75.5  0.0000000000004  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.331374  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2433  SirA family protein  44.93 
 
 		 74 aa  67  0.0000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1439  SirA-like  43.06 
 
 		 72 aa  61.6  0.000000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000145745  normal  0.024487 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3169  SirA family protein  43.28 
 
 		 76 aa  60.1  0.00000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0027  SirA family protein  45.9 
 
 		 70 aa  58.5  0.00000006  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.111426  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3421  hypothetical protein  30.56 
 
 		 140 aa  56.6  0.0000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00083332 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2082  SirA family protein  40 
 
 		 72 aa  55.8  0.0000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2466  hypothetical protein  43.75 
 
 		 69 aa  55.8  0.0000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000315359  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2088  hypothetical protein  44.44 
 
 		 69 aa  55.8  0.0000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.35634  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0248  hypothetical protein  45.16 
 
 		 73 aa  52.8  0.000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1977  hypothetical protein  37.5 
 
 		 74 aa  52.8  0.000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.73492  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2243  hypothetical protein  37.5 
 
 		 74 aa  52.8  0.000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0904  hypothetical protein  45.16 
 
 		 71 aa  52.4  0.000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00947642  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1620  SirA family protein  39.71 
 
 		 71 aa  52.4  0.000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.591727  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2932  SirA family protein  37.7 
 
 		 77 aa  50.4  0.00002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0046  SirA family protein  34.78 
 
 		 75 aa  49.7  0.00003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0821  hypothetical protein  40.98 
 
 		 79 aa  49.3  0.00004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3940  redox protein regulator of disulfide bond formation-like protein  37.31 
 
 		 74 aa  47.4  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00180546  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0718  SirA family protein  34.78 
 
 		 76 aa  47.4  0.0001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3246  SirA family protein  39.39 
 
 		 73 aa  46.6  0.0002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1352  hypothetical protein  36.11 
 
 		 74 aa  47  0.0002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1571  hypothetical protein  36.11 
 
 		 74 aa  47.4  0.0002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000229644  normal  0.442778 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0063  SirA family protein  34.78 
 
 		 69 aa  45.8  0.0004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00550  predicted redox protein, regulator of disulfide bond formation  35.29 
 
 		 68 aa  45.4  0.0006  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2642  SirA family protein  38.71 
 
 		 201 aa  45.1  0.0006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.140879  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1548  SirA family protein  34.33 
 
 		 80 aa  44.3  0.001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.0325283 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2572  SirA family protein  34.33 
 
 		 80 aa  43.5  0.002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.410608  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2098  SirA family protein  34.33 
 
 		 80 aa  43.5  0.002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25120  hypothetical protein  32.84 
 
 		 68 aa  42.7  0.004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.518593  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0686  SirA family protein  29.13 
 
 		 194 aa  42.4  0.004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0937  rhodanese domain protein  36.07 
 
 		 186 aa  42  0.005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000726035  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2801  SirA family protein  34.43 
 
 		 77 aa  42.4  0.005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.205489 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0830  rhodanese domain protein  36.07 
 
 		 186 aa  42  0.006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00233764  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0672  hypothetical protein  36.07 
 
 		 186 aa  41.6  0.007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00074605  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0686  hypothetical protein  36.07 
 
 		 186 aa  41.6  0.007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.745505  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0870  rhodanese domain protein  36.07 
 
 		 186 aa  41.6  0.007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000347313 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1366  SirA family protein  30.3 
 
 		 70 aa  41.6  0.008  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0866  rhodanese domain-containing protein  34.43 
 
 		 186 aa  41.6  0.008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1817  ArsR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 184 aa  41.6  0.008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0130872  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1451  SirA family protein  38.1 
 
 		 75 aa  41.2  0.009  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0776  rhodanese domain-containing protein  34.48 
 
 		 186 aa  41.2  0.009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0738  rhodanese domain-containing protein  34.48 
 
 		 186 aa  41.2  0.009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0001064  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1968  SirA-like  34.72 
 
 		 82 aa  41.2  0.01  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000028775  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2894  SirA family protein  32.26 
 
 		 75 aa  41.2  0.01  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>