60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_2088 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008346  Swol_2088  hypothetical protein  100 
 
 		 69 aa  138  1.9999999999999998e-32  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.35634  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0027  SirA family protein  43.28 
 
 		 70 aa  65.5  0.0000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.111426  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1439  SirA-like  55.56 
 
 		 72 aa  60.8  0.000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000145745  normal  0.024487 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2433  SirA family protein  45.61 
 
 		 74 aa  59.7  0.00000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1620  SirA family protein  39.44 
 
 		 71 aa  56.6  0.0000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.591727  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2448  SirA family protein  44.44 
 
 		 196 aa  55.8  0.0000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000888888  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3077  SirA family protein  42.47 
 
 		 199 aa  55.1  0.0000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000237941 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0251  SirA family protein  46.3 
 
 		 202 aa  53.1  0.000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2206  hypothetical protein  46.43 
 
 		 190 aa  53.1  0.000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0630  selenium metabolism protein YedF  41.07 
 
 		 198 aa  52.4  0.000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0025612  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3169  SirA family protein  43.08 
 
 		 76 aa  52.8  0.000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2500  hypothetical protein  46.43 
 
 		 190 aa  52.8  0.000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3433  SirA family protein  39.62 
 
 		 195 aa  50.8  0.000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000787487  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0124  SirA-like  41.67 
 
 		 193 aa  49.7  0.00001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0144261  normal  0.614717 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3495  SirA family protein  39.62 
 
 		 195 aa  50.1  0.00001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  1.70288e-33 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3402  SirA family protein  41.51 
 
 		 200 aa  49.7  0.00001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0293629 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0821  hypothetical protein  40.3 
 
 		 79 aa  48.5  0.00003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0855  SirA family protein  35.71 
 
 		 70 aa  47.8  0.00005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.412959  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0565  SirA family protein  38.24 
 
 		 189 aa  47  0.00008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000944688  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2082  SirA family protein  44.44 
 
 		 72 aa  46.2  0.0002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0248  hypothetical protein  32.84 
 
 		 73 aa  45.8  0.0002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1887  SirA-like protein  44.83 
 
 		 195 aa  44.7  0.0004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1894  SirA family protein  39.22 
 
 		 209 aa  45.1  0.0004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00825245  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2898  SirA family protein  34.78 
 
 		 75 aa  44.7  0.0005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2890  SirA family protein  35.29 
 
 		 189 aa  44.3  0.0005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0904  hypothetical protein  34.85 
 
 		 71 aa  44.3  0.0005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00947642  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2384  SirA family protein  34.78 
 
 		 75 aa  44.7  0.0005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.21335  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3246  SirA family protein  47.06 
 
 		 73 aa  44.7  0.0005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2521  hypothetical protein  31.58 
 
 		 195 aa  44.3  0.0006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.104075  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1242  SirA family protein  39.29 
 
 		 196 aa  43.9  0.0007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1688  SirA family protein  40 
 
 		 204 aa  43.9  0.0008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.733385  normal  0.789276 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0063  SirA family protein  38.03 
 
 		 69 aa  43.5  0.001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00550  predicted redox protein, regulator of disulfide bond formation  37.1 
 
 		 68 aa  43.1  0.001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1959  hypothetical protein  29.23 
 
 		 208 aa  43.1  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.51951  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1085  hypothetical protein  30.88 
 
 		 196 aa  43.5  0.001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  5.60528e-18  hitchhiker  0.0000092747 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2642  SirA family protein  32.35 
 
 		 201 aa  42.4  0.002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.140879  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1028  SirA family protein  34.29 
 
 		 75 aa  42.7  0.002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.399081  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2421  SirA family protein  44 
 
 		 84 aa  42.4  0.002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1366  SirA family protein  30.43 
 
 		 70 aa  41.6  0.003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0089  SirA-like protein  27.54 
 
 		 73 aa  42  0.003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.741748  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1487  SirA family protein  40.43 
 
 		 223 aa  41.6  0.004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3614  SirA family protein  34.29 
 
 		 76 aa  41.2  0.004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000103575 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0303  redox protein, regulator of disulfide bond formation  34.85 
 
 		 199 aa  41.2  0.004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000562968  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1739  hypothetical protein  32.39 
 
 		 75 aa  41.2  0.005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.626352 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1319  SirA family protein  31.88 
 
 		 70 aa  41.2  0.005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.514232  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1989  SirA family protein  31.88 
 
 		 75 aa  41.2  0.005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000867317 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0561  SirA family protein  37.7 
 
 		 75 aa  40.8  0.006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00147914  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0939  hypothetical protein  30.88 
 
 		 75 aa  40.8  0.006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000269274  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2894  SirA family protein  38.46 
 
 		 75 aa  40.8  0.006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2054  selenium metabolism protein YedF  35.71 
 
 		 196 aa  40.8  0.006  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1548  SirA family protein  38.46 
 
 		 80 aa  40.8  0.007  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.0325283 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0811  SirA-like protein  35.19 
 
 		 75 aa  40.8  0.007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0842772 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2801  SirA family protein  35.19 
 
 		 77 aa  40.4  0.008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.205489 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0643  SirA family protein  32.86 
 
 		 70 aa  40.4  0.008  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2377  SirA-like  35.29 
 
 		 75 aa  40.4  0.008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0972982  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25120  hypothetical protein  35.48 
 
 		 68 aa  40.4  0.009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.518593  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1310  SirA family protein  30.43 
 
 		 70 aa  40.4  0.009  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0574  hypothetical protein  25.71 
 
 		 75 aa  40.4  0.009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000789219  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0046  SirA family protein  30.43 
 
 		 75 aa  40  0.01  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0807  selenium metabolism protein YedF  36.54 
 
 		 211 aa  40  0.01  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.45173 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>