205 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smon_0718 on replicon NC_013515
Organism: Streptobacillus moniliformis DSM 12112



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013515  Smon_0718  SirA family protein  100 
 
 
76 aa  153  8e-37  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0046  SirA family protein  73.24 
 
 
75 aa  120  4e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0447  SirA-like  42.25 
 
 
74 aa  76.3  0.0000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0043  hypothetical protein  46.15 
 
 
72 aa  68.2  0.00000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0510  SirA family protein  41.67 
 
 
78 aa  60.5  0.000000009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.000000000586624  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1812  SirA family protein  42.03 
 
 
79 aa  59.7  0.00000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000000207986  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1758  SirA family protein  42.03 
 
 
79 aa  59.7  0.00000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000708198  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00560  predicted redox protein, regulator of disulfide bond formation  35.21 
 
 
76 aa  59.3  0.00000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1499  hypothetical protein  39.44 
 
 
74 aa  58.2  0.00000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0868  hypothetical protein  43.33 
 
 
75 aa  57  0.00000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0674  hypothetical protein  44.23 
 
 
76 aa  56.2  0.0000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.384362  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01915  hypothetical protein  34.78 
 
 
75 aa  55.8  0.0000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2303  hypothetical protein  34.78 
 
 
75 aa  55.8  0.0000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2945  hypothetical protein  34.78 
 
 
75 aa  55.8  0.0000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.91003  hitchhiker  0.00000000000335476 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01901  hypothetical protein  34.78 
 
 
75 aa  55.8  0.0000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1628  SirA family protein  34.78 
 
 
75 aa  55.8  0.0000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.241969 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1048  hypothetical protein  34.78 
 
 
75 aa  55.8  0.0000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.609594  normal  0.0924415 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4504  hypothetical protein  43.1 
 
 
76 aa  55.8  0.0000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000117975 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2081  hypothetical protein  38.57 
 
 
74 aa  55.8  0.0000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0079924  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2118  hypothetical protein  38.57 
 
 
74 aa  55.8  0.0000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.263251  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0940  hypothetical protein  41.18 
 
 
75 aa  56.2  0.0000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000000596514  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1220  hypothetical protein  34.78 
 
 
75 aa  55.8  0.0000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.466451  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04730  predicted redox protein, regulator of disulfide bond formation  32.88 
 
 
76 aa  55.5  0.0000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2150  hypothetical protein  34.78 
 
 
75 aa  55.8  0.0000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1645  SirA family protein  34.78 
 
 
75 aa  55.1  0.0000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0939  hypothetical protein  37.84 
 
 
75 aa  55.1  0.0000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000269274  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0688  SirA family protein  36.76 
 
 
75 aa  54.7  0.0000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0832  hypothetical protein  43.33 
 
 
76 aa  54.7  0.0000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00406829  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3765  hypothetical protein  35.14 
 
 
85 aa  54.3  0.0000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0740  hypothetical protein  42.31 
 
 
76 aa  53.5  0.000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0137112  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0688  hypothetical protein  42.31 
 
 
76 aa  53.5  0.000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.301237  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0778  hypothetical protein  42.31 
 
 
75 aa  53.5  0.000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0872  hypothetical protein  42.31 
 
 
76 aa  53.5  0.000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000063042 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0330  SirA family protein  42.86 
 
 
75 aa  53.5  0.000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4588  SirA family protein  36.23 
 
 
197 aa  52.8  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.282378  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1822  redox protein, regulator of disulfide bond formation  36.23 
 
 
75 aa  52.4  0.000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0038  SirA family protein  27.54 
 
 
78 aa  52  0.000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  unclonable  0.00000000000000689982  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2894  SirA family protein  42.31 
 
 
75 aa  51.6  0.000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4184  SirA family protein  41.38 
 
 
92 aa  51.2  0.000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.842151  normal  0.584926 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1218  SirA family protein  43.1 
 
 
77 aa  51.2  0.000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1254  hypothetical protein  28.99 
 
 
77 aa  50.8  0.000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22790  predicted redox protein, regulator of disulfide bond formation  34.67 
 
 
75 aa  50.1  0.000009  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1455  SirA family protein  36.36 
 
 
74 aa  50.1  0.000009  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.316855  normal  0.421643 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4317  SirA family protein  33.8 
 
 
81 aa  50.1  0.00001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.602123  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2100  hypothetical protein  36.36 
 
 
73 aa  49.7  0.00001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1014  putative aminotransferase  37.74 
 
 
78 aa  48.9  0.00002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0541001  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4280  SirA-like  26.47 
 
 
83 aa  48.9  0.00002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.277621  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0686  SirA family protein  38.89 
 
 
194 aa  49.3  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1451  SirA family protein  33.8 
 
 
75 aa  49.3  0.00002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1366  SirA family protein  34.78 
 
 
70 aa  48.9  0.00002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0561  SirA family protein  40.38 
 
 
75 aa  48.9  0.00002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00147914  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0866  rhodanese domain-containing protein  39.62 
 
 
186 aa  48.9  0.00003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2932  SirA family protein  26.76 
 
 
77 aa  48.5  0.00003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1319  SirA family protein  27.94 
 
 
70 aa  48.9  0.00003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.514232  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0721  hypothetical protein  29.85 
 
 
70 aa  48.9  0.00003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1466  SirA family protein  33.8 
 
 
81 aa  48.1  0.00004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0643  SirA family protein  30.88 
 
 
70 aa  47.8  0.00005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0738  rhodanese domain-containing protein  39.62 
 
 
186 aa  47.8  0.00005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0001064  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0686  hypothetical protein  39.62 
 
 
186 aa  47.8  0.00005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.745505  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0672  hypothetical protein  39.62 
 
 
186 aa  47.8  0.00005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00074605  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2653  SirA-like protein  52.83 
 
 
78 aa  47.8  0.00005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00012248  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0776  rhodanese domain-containing protein  39.62 
 
 
186 aa  47.8  0.00005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0870  rhodanese domain protein  39.62 
 
 
186 aa  47.8  0.00005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000347313 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2642  SirA family protein  33.82 
 
 
201 aa  47.8  0.00005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.140879  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1310  SirA family protein  34.78 
 
 
70 aa  47.8  0.00005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1959  redox protein regulator of disulfide bond formation-like  36 
 
 
103 aa  47.4  0.00006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0000373287  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4506  rhodanese domain protein  38.89 
 
 
186 aa  47.4  0.00006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000693639 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2147  hypothetical protein  33.78 
 
 
82 aa  47.8  0.00006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.555452  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0937  rhodanese domain protein  37.74 
 
 
186 aa  47.4  0.00007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000726035  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2448  SirA family protein  34.78 
 
 
196 aa  47.4  0.00007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000888888  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0830  rhodanese domain protein  37.04 
 
 
186 aa  47  0.00008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00233764  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1694  SirA family protein  29.41 
 
 
75 aa  47  0.00008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.304124  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2206  hypothetical protein  38.24 
 
 
190 aa  47  0.00009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1860  SirA family protein  27.03 
 
 
78 aa  47  0.00009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000771633  normal  0.0684437 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3117  hypothetical protein  33.78 
 
 
76 aa  46.6  0.0001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0669  SirA family protein  35.09 
 
 
78 aa  46.2  0.0001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2715  SirA family protein  33.78 
 
 
76 aa  46.6  0.0001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000000196179 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2500  hypothetical protein  38.24 
 
 
190 aa  46.6  0.0001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2228  SirA family protein  33.78 
 
 
76 aa  46.6  0.0001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.976785 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1242  SirA family protein  35.14 
 
 
196 aa  46.6  0.0001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2600  hypothetical protein  33.78 
 
 
76 aa  46.6  0.0001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3077  SirA family protein  29.41 
 
 
199 aa  46.6  0.0001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000237941 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2572  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  36.67 
 
 
834 aa  46.2  0.0002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0240201  hitchhiker  0.00088706 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0598  SirA family protein  33.33 
 
 
75 aa  45.8  0.0002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1626  SirA-like  33.82 
 
 
75 aa  45.8  0.0002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000122761  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1670  SirA family protein  36.54 
 
 
80 aa  45.8  0.0002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2668  SirA-like protein  29.58 
 
 
89 aa  46.2  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.220469  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1287  SirA family protein  30.99 
 
 
104 aa  45.4  0.0002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.413798  normal  0.313223 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1696  SirA family protein  29.03 
 
 
77 aa  45.8  0.0002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2421  SirA family protein  38.78 
 
 
84 aa  45.8  0.0002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3088  SirA-like  27.94 
 
 
75 aa  45.1  0.0003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3151  SirA family protein  33.33 
 
 
82 aa  45.1  0.0003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0855  SirA family protein  33.33 
 
 
70 aa  45.1  0.0003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.412959  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3934  SirA family protein  39.13 
 
 
82 aa  45.4  0.0003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.125725  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3688  SirA-like  34.78 
 
 
80 aa  45.1  0.0004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1210  SirA family protein  30 
 
 
75 aa  44.7  0.0004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2890  SirA family protein  35.19 
 
 
189 aa  44.7  0.0004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1060  hypothetical protein  32.43 
 
 
77 aa  44.7  0.0004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000235779  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1739  hypothetical protein  34.25 
 
 
75 aa  44.3  0.0005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.626352 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2346  SirA family protein  27.54 
 
 
77 aa  44.7  0.0005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.416048  decreased coverage  0.000000000487815 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>