More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcal_1451 on replicon NC_009073
Organism: Pyrobaculum calidifontis JCM 11548



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009073  Pcal_1451  SirA family protein  100 
 
 
75 aa  152  1e-36  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1210  SirA family protein  77.33 
 
 
75 aa  122  1e-27  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1548  SirA family protein  60 
 
 
80 aa  95.9  1e-19  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.0325283 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2098  SirA family protein  56 
 
 
80 aa  92.8  2e-18  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2572  SirA family protein  56 
 
 
80 aa  92.8  2e-18  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.410608  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0598  SirA family protein  49.32 
 
 
75 aa  72.8  0.000000000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0962  SirA family protein  45.07 
 
 
92 aa  70.5  0.000000000008  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.3564  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3436  SirA family protein  42.47 
 
 
81 aa  69.7  0.00000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000543679  normal  0.174019 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2642  SirA family protein  45.07 
 
 
201 aa  68.9  0.00000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.140879  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1670  SirA family protein  49.3 
 
 
80 aa  68.6  0.00000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0861  SirA-like  41.1 
 
 
75 aa  67.4  0.00000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1254  hypothetical protein  42.25 
 
 
77 aa  67.4  0.00000000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0524  SirA family protein  43.84 
 
 
78 aa  65.9  0.0000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.842922 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1684  hypothetical protein  39.44 
 
 
76 aa  64.3  0.0000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.109756  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0920  hypothetical protein  39.44 
 
 
76 aa  64.3  0.0000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1839  hypothetical protein  39.44 
 
 
76 aa  64.3  0.0000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2640  hypothetical protein  39.44 
 
 
76 aa  64.3  0.0000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0863392  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1662  hypothetical protein  39.44 
 
 
76 aa  64.3  0.0000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0398143  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1453  hypothetical protein  39.44 
 
 
76 aa  64.3  0.0000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0734  hypothetical protein  39.44 
 
 
76 aa  64.3  0.0000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0429  hypothetical protein  39.44 
 
 
76 aa  64.3  0.0000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0594568  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2890  SirA family protein  42.86 
 
 
189 aa  63.9  0.0000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1959  redox protein regulator of disulfide bond formation-like  45.76 
 
 
103 aa  64.3  0.0000000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0000373287  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0811  SirA-like protein  39.73 
 
 
75 aa  64.3  0.0000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0842772 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0756  SirA family protein  38.36 
 
 
75 aa  63.9  0.0000000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0477358 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2715  SirA family protein  36.99 
 
 
76 aa  63.9  0.0000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000000196179 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2600  hypothetical protein  36.99 
 
 
76 aa  63.9  0.0000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3117  hypothetical protein  36.99 
 
 
76 aa  63.9  0.0000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2228  SirA family protein  36.99 
 
 
76 aa  63.9  0.0000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.976785 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0826  SirA family protein  38.36 
 
 
75 aa  63.9  0.0000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.24854 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2932  SirA family protein  40 
 
 
77 aa  63.9  0.0000000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0166  SirA family protein  38.67 
 
 
81 aa  63.5  0.0000000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.766434  normal  0.899413 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2324  SirA family protein  36.23 
 
 
77 aa  63.5  0.000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0434291  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0810  hypothetical protein  38.36 
 
 
75 aa  63.5  0.000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.566586 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1298  SirA family protein  32.39 
 
 
75 aa  63.2  0.000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4578  SirA-like protein  38.03 
 
 
75 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.408362  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0033  hypothetical protein  42.25 
 
 
78 aa  62.4  0.000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00000671264  normal  0.064173 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0026  SirA family protein  36.23 
 
 
78 aa  62.8  0.000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000175689  normal  0.0503522 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1779  SirA family protein  43.66 
 
 
81 aa  62.8  0.000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0952  SirA-like  38.03 
 
 
75 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.872302  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0565  SirA family protein  46.43 
 
 
189 aa  62.4  0.000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000944688  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1412  SirA family protein  38.03 
 
 
75 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.960057 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1434  SirA family protein  38.03 
 
 
75 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0794  SirA family protein  36.36 
 
 
76 aa  62  0.000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000819157  normal  0.19401 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1881  SirA family protein  38.03 
 
 
75 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.045708 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0775  SirA family protein  43.48 
 
 
80 aa  62  0.000000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1466  SirA family protein  41.1 
 
 
81 aa  61.6  0.000000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3728  SirA family protein  39.44 
 
 
81 aa  62  0.000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.288657  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3724  SirA-like  34.25 
 
 
75 aa  61.6  0.000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.893626 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2668  SirA-like protein  45.71 
 
 
89 aa  61.6  0.000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.220469  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0574  hypothetical protein  39.44 
 
 
75 aa  61.2  0.000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000789219  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0038  SirA family protein  38.1 
 
 
78 aa  61.2  0.000000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  unclonable  0.00000000000000689982  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2214  SirA family protein  35.62 
 
 
75 aa  60.8  0.000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.160562 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2653  SirA-like protein  45.71 
 
 
78 aa  61.2  0.000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00012248  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1333  hypothetical protein  36.62 
 
 
77 aa  60.8  0.000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1218  SirA family protein  44.29 
 
 
77 aa  61.2  0.000000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2801  SirA family protein  36.62 
 
 
77 aa  60.8  0.000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.205489 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4317  SirA family protein  51.06 
 
 
81 aa  60.8  0.000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.602123  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2384  SirA family protein  32.88 
 
 
75 aa  60.5  0.000000008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.21335  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1982  hypothetical protein  43.64 
 
 
79 aa  60.5  0.000000008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.948606  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2898  SirA family protein  32.88 
 
 
75 aa  60.5  0.000000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1134  hypothetical protein  35.21 
 
 
75 aa  60.1  0.000000009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00450728 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3614  SirA family protein  38.03 
 
 
76 aa  60.1  0.00000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000103575 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1353  SirA family protein  36.62 
 
 
75 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.563442  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1186  SirA family protein  39.19 
 
 
83 aa  59.7  0.00000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1989  SirA family protein  34.25 
 
 
75 aa  59.7  0.00000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000867317 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1314  SirA family protein  36.62 
 
 
75 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0485  SirA family protein  40.3 
 
 
80 aa  59.7  0.00000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  hitchhiker  0.00971722 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0125  SirA family protein  39.13 
 
 
78 aa  60.1  0.00000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2421  SirA family protein  44.44 
 
 
84 aa  60.1  0.00000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0866  rhodanese domain-containing protein  35.71 
 
 
186 aa  59.3  0.00000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0830  rhodanese domain protein  36.07 
 
 
186 aa  58.9  0.00000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00233764  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0738  rhodanese domain-containing protein  35.82 
 
 
186 aa  59.3  0.00000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0001064  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0686  hypothetical protein  35.82 
 
 
186 aa  58.9  0.00000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.745505  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0672  hypothetical protein  37.7 
 
 
186 aa  58.9  0.00000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00074605  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1151  SirA family protein  37.84 
 
 
82 aa  59.3  0.00000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000000431331  decreased coverage  0.00000025153 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3151  SirA family protein  43.55 
 
 
82 aa  58.9  0.00000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1311  SirA family protein  39.73 
 
 
200 aa  59.3  0.00000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0776  rhodanese domain-containing protein  35.82 
 
 
186 aa  59.3  0.00000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2894  SirA family protein  42.25 
 
 
75 aa  59.3  0.00000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0815  SirA family protein  39.19 
 
 
83 aa  59.3  0.00000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0870  rhodanese domain protein  35.82 
 
 
186 aa  58.9  0.00000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000347313 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1455  SirA family protein  46.38 
 
 
74 aa  58.9  0.00000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.316855  normal  0.421643 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51310  hypothetical protein  40.58 
 
 
83 aa  59.3  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000169267 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0387  SirA family protein  48.44 
 
 
101 aa  58.5  0.00000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0547141 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0940  hypothetical protein  39.44 
 
 
75 aa  58.5  0.00000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000000596514  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0937  rhodanese domain protein  32.84 
 
 
186 aa  58.5  0.00000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000726035  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1028  SirA family protein  32.88 
 
 
75 aa  58.2  0.00000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.399081  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2791  SirA family protein  32.39 
 
 
76 aa  58.9  0.00000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.281845  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0669  SirA family protein  45.16 
 
 
78 aa  58.5  0.00000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2377  SirA-like  31.51 
 
 
75 aa  58.5  0.00000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0972982  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1085  SirA family protein  43.86 
 
 
77 aa  58.5  0.00000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1593  SirA family protein  35.21 
 
 
78 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.433427  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0939  hypothetical protein  39.44 
 
 
75 aa  58.2  0.00000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000269274  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3088  SirA-like  42.03 
 
 
75 aa  58.2  0.00000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1011  SirA-like  36.62 
 
 
75 aa  58.2  0.00000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3302  SirA family protein  42.19 
 
 
76 aa  58.2  0.00000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.267105 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1287  SirA family protein  44.29 
 
 
104 aa  58.2  0.00000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.413798  normal  0.313223 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2187  SirA family protein  37.14 
 
 
76 aa  57.8  0.00000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0108315  hitchhiker  0.000000214154 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4504  hypothetical protein  35.62 
 
 
76 aa  57.8  0.00000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000117975 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>