277 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Afer_0962 on replicon NC_013124
Organism: Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013124  Afer_0962  SirA family protein  100 
 
 
92 aa  186  9e-47  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.3564  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2098  SirA family protein  52.05 
 
 
80 aa  87.4  6e-17  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2572  SirA family protein  52.05 
 
 
80 aa  87.4  6e-17  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.410608  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1548  SirA family protein  52.05 
 
 
80 aa  87.4  7e-17  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.0325283 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2642  SirA family protein  50 
 
 
201 aa  80.1  0.00000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.140879  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0810  hypothetical protein  48.53 
 
 
75 aa  76.3  0.0000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.566586 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0033  hypothetical protein  46.48 
 
 
78 aa  76.3  0.0000000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00000671264  normal  0.064173 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0756  SirA family protein  47.06 
 
 
75 aa  75.1  0.0000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0477358 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0631  SirA family protein  42.03 
 
 
76 aa  75.1  0.0000000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.161479 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0826  SirA family protein  47.06 
 
 
75 aa  75.1  0.0000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.24854 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3746  SirA family protein  44.12 
 
 
74 aa  74.7  0.0000000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00371656  unclonable  0.000000591857 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0125  SirA family protein  47.06 
 
 
78 aa  73.9  0.0000000000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0937  rhodanese domain protein  44.93 
 
 
186 aa  73.2  0.000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000726035  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1959  redox protein regulator of disulfide bond formation-like  45.83 
 
 
103 aa  73.2  0.000000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0000373287  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0119  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  49.23 
 
 
813 aa  72.8  0.000000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0830  rhodanese domain protein  44.93 
 
 
186 aa  73.2  0.000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00233764  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2324  SirA family protein  42.86 
 
 
77 aa  72.4  0.000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0434291  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0565  SirA family protein  45.07 
 
 
189 aa  72.4  0.000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000944688  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1353  SirA family protein  44.12 
 
 
75 aa  72  0.000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.563442  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1314  SirA family protein  44.12 
 
 
75 aa  72  0.000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0866  rhodanese domain-containing protein  42.03 
 
 
186 aa  71.2  0.000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1333  hypothetical protein  42.65 
 
 
77 aa  71.6  0.000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1860  SirA family protein  44.12 
 
 
78 aa  70.9  0.000000000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000771633  normal  0.0684437 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2217  hypothetical protein  39.71 
 
 
76 aa  70.9  0.000000000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.403117  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1451  SirA family protein  45.07 
 
 
75 aa  70.5  0.000000000008  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0672  hypothetical protein  42.03 
 
 
186 aa  70.5  0.000000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00074605  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0686  SirA family protein  39.13 
 
 
194 aa  70.5  0.000000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0686  hypothetical protein  40.58 
 
 
186 aa  69.7  0.00000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.745505  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1881  SirA family protein  42.65 
 
 
75 aa  70.1  0.00000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.045708 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0861  SirA-like  47.06 
 
 
75 aa  70.1  0.00000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4578  SirA-like protein  42.65 
 
 
75 aa  70.1  0.00000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.408362  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0952  SirA-like  42.65 
 
 
75 aa  70.1  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.872302  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1412  SirA family protein  42.65 
 
 
75 aa  70.1  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.960057 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1434  SirA family protein  42.65 
 
 
75 aa  70.1  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0870  rhodanese domain protein  40.58 
 
 
186 aa  69.7  0.00000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000347313 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1982  hypothetical protein  42.03 
 
 
79 aa  68.9  0.00000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.948606  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0038  SirA family protein  34.29 
 
 
78 aa  68.9  0.00000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  unclonable  0.00000000000000689982  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4506  rhodanese domain protein  41.43 
 
 
186 aa  69.3  0.00000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000693639 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2801  SirA family protein  41.18 
 
 
77 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.205489 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0811  SirA-like protein  45.59 
 
 
75 aa  68.9  0.00000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0842772 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1593  SirA family protein  43.48 
 
 
78 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.433427  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0026  SirA family protein  41.18 
 
 
78 aa  68.2  0.00000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000175689  normal  0.0503522 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02400  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  38.89 
 
 
831 aa  68.6  0.00000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1670  SirA family protein  44.29 
 
 
80 aa  67.8  0.00000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0674  hypothetical protein  40 
 
 
76 aa  67.8  0.00000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.384362  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3088  SirA-like  42.65 
 
 
75 aa  67.8  0.00000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1937  SirA family protein  39.13 
 
 
76 aa  67.8  0.00000000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.559837  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4504  hypothetical protein  41.43 
 
 
76 aa  67.4  0.00000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000117975 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0738  rhodanese domain-containing protein  39.13 
 
 
186 aa  67.4  0.00000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0001064  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0776  rhodanese domain-containing protein  39.13 
 
 
186 aa  67.4  0.00000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0967  SirA family protein  41.18 
 
 
72 aa  67.4  0.00000000007  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.500955  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0574  hypothetical protein  41.18 
 
 
75 aa  66.6  0.0000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000789219  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1210  SirA family protein  43.06 
 
 
75 aa  66.2  0.0000000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2377  SirA-like  46.38 
 
 
75 aa  66.6  0.0000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0972982  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1085  SirA family protein  42.86 
 
 
77 aa  66.2  0.0000000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1298  SirA family protein  44.93 
 
 
75 aa  66.2  0.0000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0832  hypothetical protein  40 
 
 
76 aa  65.9  0.0000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00406829  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2515  rhodanese-like domain-containing protein  35.71 
 
 
354 aa  65.9  0.0000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.411992  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0868  hypothetical protein  41.43 
 
 
75 aa  65.9  0.0000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0920  hypothetical protein  42.03 
 
 
76 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4162  SirA family protein  41.67 
 
 
84 aa  65.5  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0429  hypothetical protein  42.03 
 
 
76 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0594568  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1839  hypothetical protein  42.03 
 
 
76 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4189  SirA family protein  41.67 
 
 
84 aa  65.5  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.388351  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2640  hypothetical protein  42.03 
 
 
76 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0863392  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4046  SirA-like  41.67 
 
 
84 aa  65.9  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1662  hypothetical protein  42.03 
 
 
76 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0398143  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0669  SirA family protein  44.29 
 
 
78 aa  65.9  0.0000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1684  hypothetical protein  42.03 
 
 
76 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.109756  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1134  hypothetical protein  46.38 
 
 
75 aa  65.9  0.0000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00450728 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1453  hypothetical protein  42.03 
 
 
76 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0035  rhodanese domain-containing protein  35.71 
 
 
354 aa  65.9  0.0000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0035  rhodanese domain-containing protein  35.71 
 
 
354 aa  65.9  0.0000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0734  hypothetical protein  42.03 
 
 
76 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2890  SirA family protein  39.44 
 
 
189 aa  65.1  0.0000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0485  SirA family protein  36.23 
 
 
80 aa  65.1  0.0000000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  hitchhiker  0.00971722 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0740  hypothetical protein  38.57 
 
 
76 aa  64.7  0.0000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0137112  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0688  hypothetical protein  38.57 
 
 
76 aa  64.7  0.0000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.301237  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0778  hypothetical protein  38.57 
 
 
75 aa  64.7  0.0000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0872  hypothetical protein  38.57 
 
 
76 aa  64.7  0.0000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000063042 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2384  SirA family protein  44.93 
 
 
75 aa  64.7  0.0000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.21335  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2898  SirA family protein  44.93 
 
 
75 aa  64.7  0.0000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4317  SirA family protein  40.79 
 
 
81 aa  63.9  0.0000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.602123  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2932  SirA family protein  40.28 
 
 
77 aa  64.3  0.0000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3470  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  46.55 
 
 
864 aa  63.9  0.0000000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1011  SirA-like  39.71 
 
 
75 aa  63.9  0.0000000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0794  SirA family protein  34.21 
 
 
76 aa  63.9  0.0000000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000819157  normal  0.19401 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1254  hypothetical protein  40 
 
 
77 aa  63.5  0.000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3724  SirA-like  45.07 
 
 
75 aa  63.2  0.000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.893626 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1436  SirA family protein  38.24 
 
 
81 aa  63.5  0.000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.324916  normal  0.46012 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1028  SirA family protein  43.48 
 
 
75 aa  63.2  0.000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.399081  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1672  SirA family protein  38.24 
 
 
76 aa  62.8  0.000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1803  hypothetical protein  37.5 
 
 
78 aa  62.8  0.000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  decreased coverage  0.00452697  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1989  SirA family protein  43.48 
 
 
75 aa  62.8  0.000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000867317 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3385  SirA family protein  44.59 
 
 
81 aa  62.8  0.000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.719543  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0073  rhodanese domain-containing protein  36.36 
 
 
354 aa  62.4  0.000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0688  SirA family protein  40 
 
 
75 aa  62.8  0.000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1300  SirA family protein  40 
 
 
77 aa  62.8  0.000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0506875  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0075  rhodanese domain-containing protein  36.36 
 
 
354 aa  62.4  0.000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1718  SirA family protein  38.24 
 
 
81 aa  62.4  0.000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>