More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbd_1982 on replicon NC_007404
Organism: Thiobacillus denitrificans ATCC 25259



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007404  Tbd_1982  hypothetical protein  100 
 
 		 79 aa  166  1e-40  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.948606  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0967  SirA family protein  54.29 
 
 		 72 aa  91.7  3e-18  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.500955  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2890  SirA family protein  50 
 
 		 189 aa  80.9  0.000000000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2932  SirA family protein  45.33 
 
 		 77 aa  80.5  0.000000000000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2894  SirA family protein  43.06 
 
 		 75 aa  77.4  0.00000000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0561  SirA family protein  41.67 
 
 		 75 aa  77.4  0.00000000000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00147914  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0940  hypothetical protein  47.22 
 
 		 75 aa  76.3  0.0000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000000596514  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0565  SirA family protein  47.22 
 
 		 189 aa  75.9  0.0000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000944688  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0939  hypothetical protein  47.83 
 
 		 75 aa  75.1  0.0000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000269274  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1300  SirA family protein  40.3 
 
 		 77 aa  74.7  0.0000000000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0506875  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0832  hypothetical protein  45.83 
 
 		 76 aa  74.7  0.0000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00406829  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0868  hypothetical protein  43.06 
 
 		 75 aa  74.3  0.0000000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0674  hypothetical protein  44.44 
 
 		 76 aa  74.3  0.0000000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.384362  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2642  SirA family protein  44.44 
 
 		 201 aa  73.9  0.0000000000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.140879  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1085  SirA family protein  43.48 
 
 		 77 aa  73.9  0.0000000000007  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4046  SirA-like  47.83 
 
 		 84 aa  73.6  0.0000000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0038  SirA family protein  38.96 
 
 		 78 aa  73.6  0.0000000000008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  unclonable  0.00000000000000689982  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0830  rhodanese domain protein  44.44 
 
 		 186 aa  72  0.000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00233764  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0436  SirA-like  44.29 
 
 		 75 aa  72  0.000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0937  rhodanese domain protein  44.44 
 
 		 186 aa  72  0.000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000726035  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0740  hypothetical protein  43.06 
 
 		 76 aa  72  0.000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0137112  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0688  hypothetical protein  43.06 
 
 		 76 aa  72  0.000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.301237  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4162  SirA family protein  46.38 
 
 		 84 aa  71.6  0.000000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0872  hypothetical protein  43.06 
 
 		 76 aa  72  0.000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000063042 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0778  hypothetical protein  43.06 
 
 		 75 aa  72  0.000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4189  SirA family protein  46.38 
 
 		 84 aa  71.6  0.000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.388351  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0738  rhodanese domain-containing protein  43.06 
 
 		 186 aa  71.2  0.000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0001064  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0776  rhodanese domain-containing protein  43.06 
 
 		 186 aa  71.2  0.000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4504  hypothetical protein  41.67 
 
 		 76 aa  70.9  0.000000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000117975 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0686  hypothetical protein  43.06 
 
 		 186 aa  70.9  0.000000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.745505  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1254  hypothetical protein  40 
 
 		 77 aa  70.9  0.000000000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0033  hypothetical protein  44 
 
 		 78 aa  70.9  0.000000000006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00000671264  normal  0.064173 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0870  rhodanese domain protein  43.06 
 
 		 186 aa  70.9  0.000000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000347313 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0686  SirA family protein  43.06 
 
 		 194 aa  70.5  0.000000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0125  SirA family protein  44.12 
 
 		 78 aa  70.9  0.000000000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0672  hypothetical protein  41.67 
 
 		 186 aa  70.5  0.000000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00074605  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1548  SirA family protein  38.46 
 
 		 80 aa  70.1  0.000000000008  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.0325283 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3701  SirA family protein  40.26 
 
 		 81 aa  70.5  0.000000000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.60785  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0866  rhodanese domain-containing protein  43.06 
 
 		 186 aa  69.7  0.00000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3088  SirA-like  39.71 
 
 		 75 aa  69.7  0.00000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0688  SirA family protein  43.06 
 
 		 75 aa  69.3  0.00000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0404  SirA family protein  41.79 
 
 		 81 aa  68.9  0.00000000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.188444  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4317  SirA family protein  44.29 
 
 		 81 aa  68.9  0.00000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.602123  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2324  SirA family protein  45.59 
 
 		 77 aa  68.9  0.00000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0434291  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0962  SirA family protein  42.03 
 
 		 92 aa  68.9  0.00000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.3564  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0631  SirA family protein  42.65 
 
 		 76 aa  68.6  0.00000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.161479 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4506  rhodanese domain protein  43.06 
 
 		 186 aa  68.6  0.00000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000693639 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2098  SirA family protein  38.16 
 
 		 80 aa  67.8  0.00000000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2572  SirA family protein  38.16 
 
 		 80 aa  67.8  0.00000000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.410608  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1860  SirA family protein  36.36 
 
 		 78 aa  67.4  0.00000000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000771633  normal  0.0684437 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2217  hypothetical protein  41.18 
 
 		 76 aa  67.4  0.00000000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.403117  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2421  SirA family protein  43.9 
 
 		 84 aa  67.4  0.00000000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3728  SirA family protein  44.44 
 
 		 81 aa  67  0.00000000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.288657  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0383  SirA family protein  42.03 
 
 		 78 aa  66.6  0.0000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.472232  normal  0.0141536 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3385  SirA family protein  42.47 
 
 		 81 aa  66.6  0.0000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.719543  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1937  SirA family protein  36.23 
 
 		 76 aa  66.6  0.0000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.559837  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0794  SirA family protein  37.14 
 
 		 76 aa  66.2  0.0000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000819157  normal  0.19401 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3746  SirA family protein  39.71 
 
 		 74 aa  66.2  0.0000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00371656  unclonable  0.000000591857 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1233  SirA family protein  41.43 
 
 		 79 aa  65.9  0.0000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2116  sulfur transfer protein SirA  38.96 
 
 		 80 aa  65.5  0.0000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.101058 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4185  SirA family protein  41.43 
 
 		 79 aa  65.9  0.0000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.312975  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1656  sulfur transfer protein SirA  38.96 
 
 		 80 aa  65.9  0.0000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.100562  normal  0.450785 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3625  sulfur transfer protein SirA  38.96 
 
 		 80 aa  65.5  0.0000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.385858 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1694  SirA family protein  39.71 
 
 		 75 aa  65.9  0.0000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.304124  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1263  SirA family protein  41.43 
 
 		 79 aa  65.9  0.0000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.600838  normal  0.692978 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0810  hypothetical protein  35.29 
 
 		 75 aa  65.1  0.0000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.566586 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1959  redox protein regulator of disulfide bond formation-like  41.18 
 
 		 103 aa  65.1  0.0000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0000373287  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0026  SirA family protein  42.65 
 
 		 78 aa  64.7  0.0000000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000175689  normal  0.0503522 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0861  SirA-like  36.76 
 
 		 75 aa  63.9  0.0000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1633  sulfur transfer protein SirA  38.96 
 
 		 80 aa  64.3  0.0000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.972147 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0811  SirA-like protein  36.76 
 
 		 75 aa  64.3  0.0000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0842772 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1905  sulfur transfer protein SirA  41.18 
 
 		 83 aa  63.9  0.0000000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00381161  normal  0.533797 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0775  SirA family protein  35.29 
 
 		 80 aa  63.5  0.0000000008  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20060  sulfur transfer protein SirA  41.67 
 
 		 85 aa  63.5  0.0000000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1572  sulfur transfer protein SirA  41.56 
 
 		 79 aa  63.5  0.0000000009  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3766  sulfur transfer protein SirA  40.28 
 
 		 79 aa  63.5  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.769061  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0756  SirA family protein  35.29 
 
 		 75 aa  62.8  0.000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0477358 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3979  SirA family protein  40 
 
 		 79 aa  63.5  0.000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4391  hypothetical protein  36.99 
 
 		 83 aa  63.2  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1011  SirA-like  39.71 
 
 		 75 aa  63.2  0.000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0093  SirA-like protein  40.28 
 
 		 82 aa  62.8  0.000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44270  sulfur transfer protein SirA  40.28 
 
 		 79 aa  63.5  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0826  SirA family protein  35.29 
 
 		 75 aa  62.8  0.000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.24854 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0090  SirA family protein  31.88 
 
 		 85 aa  62.8  0.000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0719339  normal  0.137098 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2653  SirA-like protein  38.98 
 
 		 78 aa  62.8  0.000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00012248  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1367  SirA-like  39.71 
 
 		 79 aa  62.8  0.000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.463137  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1672  SirA family protein  38.89 
 
 		 76 aa  62.4  0.000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1311  SirA family protein  42.86 
 
 		 200 aa  62.8  0.000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3957  hypothetical protein  35.06 
 
 		 83 aa  61.6  0.000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0574  hypothetical protein  36.76 
 
 		 75 aa  62  0.000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000789219  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0166  SirA family protein  37.33 
 
 		 81 aa  62  0.000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.766434  normal  0.899413 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0140  SirA family protein  38.81 
 
 		 97 aa  62  0.000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1544  SirA-like  35.06 
 
 		 83 aa  61.2  0.000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.409096  normal  0.0539174 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1827  sulfur transfer protein SirA  38.89 
 
 		 84 aa  60.8  0.000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0248688  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1718  SirA family protein  35 
 
 		 81 aa  60.8  0.000000005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1155  regulatory protein, MarR  36.11 
 
 		 82 aa  60.8  0.000000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.102823 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1451  SirA family protein  43.64 
 
 		 75 aa  60.5  0.000000007  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2236  SirA family protein  35.71 
 
 		 77 aa  60.5  0.000000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.278986  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2515  rhodanese-like domain-containing protein  38.57 
 
 		 354 aa  60.5  0.000000008  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.411992  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0035  rhodanese domain-containing protein  38.57 
 
 		 354 aa  60.5  0.000000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>