More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_2324 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011060  Ppha_2324  SirA family protein  100 
 
 		 77 aa  160  8.000000000000001e-39  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0434291  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0125  SirA family protein  80.77 
 
 		 78 aa  135  3.0000000000000003e-31  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0026  SirA family protein  79.45 
 
 		 78 aa  129  1.0000000000000001e-29  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000175689  normal  0.0503522 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1959  redox protein regulator of disulfide bond formation-like  74.32 
 
 		 103 aa  127  7.000000000000001e-29  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0000373287  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0033  hypothetical protein  76.71 
 
 		 78 aa  122  2e-27  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00000671264  normal  0.064173 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1860  SirA family protein  71.79 
 
 		 78 aa  122  2e-27  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000771633  normal  0.0684437 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0038  SirA family protein  59.74 
 
 		 78 aa  101  3e-21  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  unclonable  0.00000000000000689982  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0810  hypothetical protein  52.86 
 
 		 75 aa  93.6  8e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.566586 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0574  hypothetical protein  55.71 
 
 		 75 aa  90.5  6e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000789219  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0826  SirA family protein  51.43 
 
 		 75 aa  90.5  8e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.24854 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0756  SirA family protein  51.43 
 
 		 75 aa  90.5  8e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0477358 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0861  SirA-like  51.43 
 
 		 75 aa  90.1  9e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0811  SirA-like protein  51.43 
 
 		 75 aa  89.7  1e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0842772 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1254  hypothetical protein  53.95 
 
 		 77 aa  87.8  4e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1436  SirA family protein  46.91 
 
 		 81 aa  86.3  1e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.324916  normal  0.46012 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3088  SirA-like  48.57 
 
 		 75 aa  85.9  2e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2642  SirA family protein  50 
 
 		 201 aa  85.9  2e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.140879  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1672  SirA family protein  52.86 
 
 		 76 aa  85.9  2e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1881  SirA family protein  50 
 
 		 75 aa  84.7  3e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.045708 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4578  SirA-like protein  50 
 
 		 75 aa  84.7  3e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.408362  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1412  SirA family protein  50 
 
 		 75 aa  84.7  3e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.960057 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0952  SirA-like  50 
 
 		 75 aa  84.7  3e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.872302  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2217  hypothetical protein  52.17 
 
 		 76 aa  85.1  3e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.403117  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1434  SirA family protein  50 
 
 		 75 aa  84.7  3e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1011  SirA-like  51.43 
 
 		 75 aa  84.3  5e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0631  SirA family protein  49.28 
 
 		 76 aa  84.3  5e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.161479 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1353  SirA family protein  50 
 
 		 75 aa  84.3  5e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.563442  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1314  SirA family protein  50 
 
 		 75 aa  84.3  5e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1718  SirA family protein  44.44 
 
 		 81 aa  83.2  0.000000000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1937  SirA family protein  50 
 
 		 76 aa  82.8  0.000000000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.559837  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2187  SirA family protein  51.47 
 
 		 76 aa  82.8  0.000000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0108315  hitchhiker  0.000000214154 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1333  hypothetical protein  48.57 
 
 		 77 aa  82.8  0.000000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2557  hypothetical protein  51.47 
 
 		 76 aa  82.8  0.000000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  decreased coverage  0.00791893  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4504  hypothetical protein  49.32 
 
 		 76 aa  82  0.000000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000117975 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0674  hypothetical protein  47.06 
 
 		 76 aa  82.4  0.000000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.384362  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1670  SirA family protein  48.61 
 
 		 80 aa  82.4  0.000000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0920  hypothetical protein  50.7 
 
 		 76 aa  82  0.000000000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1662  hypothetical protein  50.7 
 
 		 76 aa  82  0.000000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0398143  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1839  hypothetical protein  50.7 
 
 		 76 aa  82  0.000000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2640  hypothetical protein  50.7 
 
 		 76 aa  82  0.000000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0863392  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0429  hypothetical protein  50.7 
 
 		 76 aa  82  0.000000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0594568  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1453  hypothetical protein  50.7 
 
 		 76 aa  82  0.000000000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0734  hypothetical protein  50.7 
 
 		 76 aa  82  0.000000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1684  hypothetical protein  50.7 
 
 		 76 aa  82  0.000000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.109756  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0868  hypothetical protein  47.06 
 
 		 75 aa  81.6  0.000000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2801  SirA family protein  47.14 
 
 		 77 aa  80.9  0.000000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.205489 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0740  hypothetical protein  45.59 
 
 		 76 aa  79.7  0.00000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0137112  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0688  hypothetical protein  45.59 
 
 		 76 aa  79.7  0.00000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.301237  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0778  hypothetical protein  45.59 
 
 		 75 aa  79.7  0.00000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0093  SirA-like protein  51.35 
 
 		 82 aa  79.7  0.00000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0872  hypothetical protein  45.59 
 
 		 76 aa  79.7  0.00000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000063042 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0830  rhodanese domain protein  44.74 
 
 		 186 aa  79.3  0.00000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00233764  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1989  SirA family protein  48.57 
 
 		 75 aa  79.7  0.00000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000867317 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1134  hypothetical protein  48.61 
 
 		 75 aa  79  0.00000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00450728 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2791  SirA family protein  43.66 
 
 		 76 aa  79.3  0.00000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.281845  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0937  rhodanese domain protein  44.74 
 
 		 186 aa  79.3  0.00000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000726035  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1593  SirA family protein  47.89 
 
 		 78 aa  78.6  0.00000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.433427  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0738  rhodanese domain-containing protein  43.42 
 
 		 186 aa  78.2  0.00000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0001064  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0776  rhodanese domain-containing protein  43.42 
 
 		 186 aa  78.2  0.00000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0688  SirA family protein  47.06 
 
 		 75 aa  77.8  0.00000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2088  hypothetical protein  46.38 
 
 		 76 aa  78.2  0.00000000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0107447  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0866  rhodanese domain-containing protein  42.11 
 
 		 186 aa  77.8  0.00000000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0794  SirA family protein  45.83 
 
 		 76 aa  77.8  0.00000000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000819157  normal  0.19401 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0672  hypothetical protein  43.42 
 
 		 186 aa  77.4  0.00000000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00074605  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0686  hypothetical protein  42.11 
 
 		 186 aa  76.6  0.00000000000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.745505  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4506  rhodanese domain protein  42.11 
 
 		 186 aa  76.6  0.00000000000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000693639 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0870  rhodanese domain protein  42.11 
 
 		 186 aa  76.6  0.00000000000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000347313 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0939  hypothetical protein  45.59 
 
 		 75 aa  77  0.00000000000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000269274  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0940  hypothetical protein  45.59 
 
 		 75 aa  76.6  0.0000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000000596514  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2894  SirA family protein  45.59 
 
 		 75 aa  76.6  0.0000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2214  SirA family protein  47.14 
 
 		 75 aa  76.6  0.0000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.160562 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2421  SirA family protein  46.25 
 
 		 84 aa  75.9  0.0000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1085  SirA family protein  44.16 
 
 		 77 aa  75.9  0.0000000000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0561  SirA family protein  45.07 
 
 		 75 aa  75.9  0.0000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00147914  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3614  SirA family protein  47.89 
 
 		 76 aa  75.5  0.0000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000103575 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0686  SirA family protein  39.47 
 
 		 194 aa  75.5  0.0000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1298  SirA family protein  42.86 
 
 		 75 aa  75.1  0.0000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0832  hypothetical protein  45.59 
 
 		 76 aa  75.1  0.0000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00406829  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0565  SirA family protein  45.07 
 
 		 189 aa  74.3  0.0000000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000944688  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2898  SirA family protein  44.29 
 
 		 75 aa  73.9  0.0000000000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2384  SirA family protein  44.29 
 
 		 75 aa  73.9  0.0000000000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.21335  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3746  SirA family protein  45.83 
 
 		 74 aa  73.9  0.0000000000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00371656  unclonable  0.000000591857 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1233  SirA family protein  43.84 
 
 		 79 aa  72.8  0.000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4185  SirA family protein  43.84 
 
 		 79 aa  72.8  0.000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.312975  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1263  SirA family protein  43.84 
 
 		 79 aa  72.8  0.000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.600838  normal  0.692978 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2377  SirA-like  42.86 
 
 		 75 aa  72.8  0.000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0972982  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0962  SirA family protein  42.86 
 
 		 92 aa  72.4  0.000000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.3564  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3724  SirA-like  44.29 
 
 		 75 aa  72  0.000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.893626 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51310  hypothetical protein  44.44 
 
 		 83 aa  72.8  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000169267 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3728  SirA family protein  43.48 
 
 		 81 aa  71.6  0.000000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.288657  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4317  SirA family protein  43.48 
 
 		 81 aa  72  0.000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.602123  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1544  SirA-like  41.89 
 
 		 83 aa  71.2  0.000000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.409096  normal  0.0539174 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2890  SirA family protein  42.25 
 
 		 189 aa  71.2  0.000000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1028  SirA family protein  41.43 
 
 		 75 aa  71.2  0.000000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.399081  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0090  SirA family protein  40.26 
 
 		 85 aa  70.9  0.000000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0719339  normal  0.137098 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3957  hypothetical protein  40.54 
 
 		 83 aa  70.1  0.000000000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0669  SirA family protein  39.47 
 
 		 78 aa  70.1  0.000000000009  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4391  hypothetical protein  40.26 
 
 		 83 aa  70.1  0.000000000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3701  SirA family protein  42.03 
 
 		 81 aa  70.1  0.000000000009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.60785  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2098  SirA family protein  38.46 
 
 		 80 aa  70.1  0.00000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>