269 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SYO3AOP1_1300 on replicon NC_010730
Organism: Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010730  SYO3AOP1_1300  SirA family protein  100 
 
 
77 aa  159  1e-38  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0506875  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0404  SirA family protein  56.58 
 
 
81 aa  100  7e-21  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.188444  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0967  SirA family protein  58.21 
 
 
72 aa  85.9  2e-16  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.500955  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0436  SirA-like  44.59 
 
 
75 aa  78.6  0.00000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1982  hypothetical protein  40.3 
 
 
79 aa  74.7  0.0000000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.948606  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2890  SirA family protein  43.24 
 
 
189 aa  74.3  0.0000000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1085  SirA family protein  43.42 
 
 
77 aa  72.4  0.000000000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0940  hypothetical protein  44.93 
 
 
75 aa  71.2  0.000000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000000596514  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0166  SirA family protein  41.18 
 
 
81 aa  68.9  0.00000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.766434  normal  0.899413 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0775  SirA family protein  42.67 
 
 
80 aa  69.3  0.00000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0939  hypothetical protein  41.89 
 
 
75 aa  69.3  0.00000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000269274  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0565  SirA family protein  40.54 
 
 
189 aa  69.3  0.00000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000944688  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2642  SirA family protein  39.44 
 
 
201 aa  67.8  0.00000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.140879  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0868  hypothetical protein  39.13 
 
 
75 aa  67.4  0.00000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0810  hypothetical protein  38.16 
 
 
75 aa  66.2  0.0000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.566586 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0866  rhodanese domain-containing protein  36.84 
 
 
186 aa  66.2  0.0000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2894  SirA family protein  39.13 
 
 
75 aa  66.2  0.0000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0686  SirA family protein  38.16 
 
 
194 aa  66.6  0.0000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0738  rhodanese domain-containing protein  38.16 
 
 
186 aa  65.9  0.0000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0001064  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0672  hypothetical protein  39.47 
 
 
186 aa  65.9  0.0000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00074605  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0776  rhodanese domain-containing protein  38.16 
 
 
186 aa  65.9  0.0000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0937  rhodanese domain protein  38.16 
 
 
186 aa  65.9  0.0000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000726035  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0830  rhodanese domain protein  38.16 
 
 
186 aa  65.9  0.0000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00233764  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0686  hypothetical protein  38.16 
 
 
186 aa  65.1  0.0000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.745505  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0870  rhodanese domain protein  38.16 
 
 
186 aa  65.1  0.0000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000347313 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0631  SirA family protein  40.3 
 
 
76 aa  65.1  0.0000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.161479 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3436  SirA family protein  38.24 
 
 
81 aa  64.7  0.0000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000543679  normal  0.174019 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2932  SirA family protein  39.47 
 
 
77 aa  64.7  0.0000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0561  SirA family protein  35.14 
 
 
75 aa  64.3  0.0000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00147914  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0688  SirA family protein  36.23 
 
 
75 aa  63.9  0.0000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0756  SirA family protein  38.16 
 
 
75 aa  63.9  0.0000000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0477358 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3088  SirA-like  35.53 
 
 
75 aa  63.5  0.0000000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0826  SirA family protein  38.16 
 
 
75 aa  63.9  0.0000000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.24854 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0125  SirA family protein  33.33 
 
 
78 aa  63.5  0.0000000009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4506  rhodanese domain protein  36.84 
 
 
186 aa  63.5  0.0000000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000693639 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1860  SirA family protein  33.33 
 
 
78 aa  63.5  0.000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000771633  normal  0.0684437 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2098  SirA family protein  35.53 
 
 
80 aa  63.2  0.000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2572  SirA family protein  35.53 
 
 
80 aa  63.2  0.000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.410608  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0674  hypothetical protein  33.33 
 
 
76 aa  62  0.000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.384362  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2217  hypothetical protein  37.31 
 
 
76 aa  62.4  0.000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.403117  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0598  SirA family protein  37.5 
 
 
75 aa  62.8  0.000000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1458  SirA-like  40.85 
 
 
78 aa  62.4  0.000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.000274297  normal  0.357093 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0962  SirA family protein  40 
 
 
92 aa  62.8  0.000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.3564  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3117  hypothetical protein  40.58 
 
 
76 aa  62  0.000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2715  SirA family protein  40.58 
 
 
76 aa  62  0.000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000000196179 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0861  SirA-like  36.84 
 
 
75 aa  62  0.000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4046  SirA-like  38.81 
 
 
84 aa  61.6  0.000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2600  hypothetical protein  40.58 
 
 
76 aa  62  0.000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2228  SirA family protein  40.58 
 
 
76 aa  62  0.000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.976785 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1937  SirA family protein  36.76 
 
 
76 aa  61.2  0.000000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.559837  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0383  SirA family protein  37.31 
 
 
78 aa  61.2  0.000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.472232  normal  0.0141536 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4504  hypothetical protein  34.78 
 
 
76 aa  60.8  0.000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000117975 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0794  SirA family protein  34.25 
 
 
76 aa  60.8  0.000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000819157  normal  0.19401 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1718  SirA family protein  35.82 
 
 
81 aa  60.5  0.000000007  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0033  hypothetical protein  34.33 
 
 
78 aa  59.7  0.00000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00000671264  normal  0.064173 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3080  SirA family protein  41.43 
 
 
115 aa  60.1  0.00000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000709238  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4162  SirA family protein  37.31 
 
 
84 aa  59.7  0.00000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2791  SirA family protein  37.33 
 
 
76 aa  59.7  0.00000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.281845  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4189  SirA family protein  37.31 
 
 
84 aa  59.7  0.00000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.388351  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0740  hypothetical protein  31.88 
 
 
76 aa  59.3  0.00000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0137112  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0688  hypothetical protein  31.88 
 
 
76 aa  59.3  0.00000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.301237  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0778  hypothetical protein  31.88 
 
 
75 aa  59.3  0.00000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1670  SirA family protein  36 
 
 
80 aa  58.9  0.00000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0811  SirA-like protein  37.31 
 
 
75 aa  59.3  0.00000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0842772 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0872  hypothetical protein  31.88 
 
 
76 aa  59.3  0.00000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000063042 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1254  hypothetical protein  35.53 
 
 
77 aa  58.5  0.00000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20060  sulfur transfer protein SirA  34.21 
 
 
85 aa  58.5  0.00000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0832  hypothetical protein  33.33 
 
 
76 aa  58.5  0.00000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00406829  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0574  hypothetical protein  35.82 
 
 
75 aa  58.2  0.00000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000789219  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2339  SirA family protein  41.18 
 
 
75 aa  57.8  0.00000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0889916  normal  0.318145 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1548  SirA family protein  34.33 
 
 
80 aa  57.8  0.00000005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.0325283 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1905  sulfur transfer protein SirA  32.89 
 
 
83 aa  56.2  0.0000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00381161  normal  0.533797 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0026  SirA family protein  29.33 
 
 
78 aa  56.2  0.0000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000175689  normal  0.0503522 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2324  SirA family protein  31.58 
 
 
77 aa  56.6  0.0000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0434291  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1333  hypothetical protein  34.21 
 
 
77 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1672  SirA family protein  38.81 
 
 
76 aa  56.6  0.0000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0524  SirA family protein  31.58 
 
 
78 aa  56.6  0.0000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.842922 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1779  SirA family protein  35.82 
 
 
81 aa  56.2  0.0000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2801  SirA family protein  34.21 
 
 
77 aa  55.5  0.0000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.205489 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3302  SirA family protein  34.78 
 
 
76 aa  56.2  0.0000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.267105 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1404  SirA family protein  46.38 
 
 
85 aa  56.2  0.0000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0684683  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1287  SirA family protein  36.76 
 
 
104 aa  55.5  0.0000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.413798  normal  0.313223 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1353  SirA family protein  35.53 
 
 
75 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.563442  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1311  SirA family protein  37.29 
 
 
200 aa  55.1  0.0000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4578  SirA-like protein  35.53 
 
 
75 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.408362  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0952  SirA-like  35.53 
 
 
75 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.872302  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1881  SirA family protein  35.53 
 
 
75 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.045708 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1314  SirA family protein  35.53 
 
 
75 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1434  SirA family protein  35.53 
 
 
75 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1412  SirA family protein  35.53 
 
 
75 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.960057 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2618  SirA-like protein  37.31 
 
 
80 aa  54.7  0.0000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2083  SirA family protein  38.57 
 
 
79 aa  55.1  0.0000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0811704  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0038  SirA family protein  28 
 
 
78 aa  54.7  0.0000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  unclonable  0.00000000000000689982  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1656  sulfur transfer protein SirA  32 
 
 
80 aa  54.3  0.0000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.100562  normal  0.450785 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0567  SirA family protein  31.08 
 
 
75 aa  54.3  0.0000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.23848  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0090  SirA family protein  27.78 
 
 
85 aa  54.3  0.0000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0719339  normal  0.137098 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1436  SirA family protein  32.84 
 
 
81 aa  53.9  0.0000007  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.324916  normal  0.46012 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2653  SirA-like protein  32.76 
 
 
78 aa  53.9  0.0000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00012248  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2116  sulfur transfer protein SirA  30.67 
 
 
80 aa  53.5  0.0000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.101058 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3625  sulfur transfer protein SirA  30.67 
 
 
80 aa  53.5  0.0000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.385858 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>