251 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HS_1572 on replicon NC_008309
Organism: Haemophilus somnus 129PT



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008309  HS_1572  sulfur transfer protein SirA  100 
 
 		 79 aa  165  2e-40  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0232  sulfur transfer protein SirA  63.75 
 
 		 84 aa  119  9.999999999999999e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0570  sulfur transfer protein SirA  63.75 
 
 		 84 aa  119  9.999999999999999e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3986  sulfur transfer protein SirA  63.75 
 
 		 84 aa  119  9.999999999999999e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0225  regulator of information in SirA family protein  66.67 
 
 		 78 aa  119  1.9999999999999998e-26  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0029  redox protein regulator of disulfide bond formation  69.01 
 
 		 99 aa  117  4.9999999999999996e-26  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0748983  normal  0.0110056 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0015  sulfur transfer protein SirA  69.57 
 
 		 81 aa  115  3e-25  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0331062  normal  0.432402 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0013  sulfur transfer protein SirA  60.49 
 
 		 81 aa  114  3.9999999999999997e-25  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000321499  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0013  sulfur transfer protein SirA  61.25 
 
 		 81 aa  113  6.9999999999999995e-25  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000182945 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0013  sulfur transfer protein SirA  61.25 
 
 		 81 aa  113  6.9999999999999995e-25  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0557081 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0021  sulfur transfer protein SirA  61.25 
 
 		 81 aa  113  6.9999999999999995e-25  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.628095  hitchhiker  0.000000017124 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0012  sulfur transfer protein SirA  68.12 
 
 		 81 aa  113  8.999999999999998e-25  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0017  sulfur transfer protein SirA  68.12 
 
 		 81 aa  113  8.999999999999998e-25  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000196342 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0011  sulfur transfer protein SirA  66.67 
 
 		 81 aa  113  1.0000000000000001e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0019  sulfur transfer protein SirA  61.25 
 
 		 81 aa  112  2.0000000000000002e-24  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0020  sulfur transfer protein SirA  66.67 
 
 		 81 aa  112  2.0000000000000002e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000878962 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0017  sulfur transfer protein SirA  66.67 
 
 		 81 aa  111  3e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0103959 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0011  sulfur transfer protein SirA  66.67 
 
 		 81 aa  111  3e-24  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.119018  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0018  sulfur transfer protein SirA  66.67 
 
 		 81 aa  111  3e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0017  sulfur transfer protein SirA  66.67 
 
 		 81 aa  111  3e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000123371 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0205  SirA family protein  57.5 
 
 		 81 aa  110  6e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.106509 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0013  sulfur transfer protein SirA  66.67 
 
 		 81 aa  110  6e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001993  tRNA 5-methylaminomethyl-2-thiouridine synthase TusA  62.16 
 
 		 82 aa  109  1.0000000000000001e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00453  sulfur transfer protein SirA  60.81 
 
 		 82 aa  107  4.0000000000000004e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03319  cell developmental protein SirA  57.5 
 
 		 81 aa  107  7.000000000000001e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0245  SirA family protein  57.5 
 
 		 81 aa  107  7.000000000000001e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3852  sulfur transfer protein SirA  57.5 
 
 		 81 aa  107  7.000000000000001e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3669  sulfur transfer protein SirA  57.5 
 
 		 81 aa  107  7.000000000000001e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03272  hypothetical protein  57.5 
 
 		 81 aa  107  7.000000000000001e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0246  sulfur transfer protein SirA  57.5 
 
 		 81 aa  107  7.000000000000001e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4790  sulfur transfer protein SirA  57.5 
 
 		 81 aa  107  7.000000000000001e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3952  sulfur transfer protein SirA  57.5 
 
 		 81 aa  107  7.000000000000001e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2495  sulfur transfer protein SirA  62.16 
 
 		 82 aa  106  1e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3950  hypothetical protein  56.25 
 
 		 111 aa  106  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.785107  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3780  hypothetical protein  56.25 
 
 		 111 aa  106  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3847  hypothetical protein  56.25 
 
 		 111 aa  106  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3890  hypothetical protein  56.25 
 
 		 111 aa  106  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3877  sulfur transfer protein SirA  58.02 
 
 		 81 aa  106  1e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.899871  normal  0.161761 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3770  hypothetical protein  56.25 
 
 		 111 aa  106  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3754  sulfur transfer protein SirA  56.96 
 
 		 81 aa  104  4e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4069  SirA family protein  56.25 
 
 		 81 aa  103  5e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2968  sulfur transfer protein SirA  61.64 
 
 		 83 aa  103  5e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0282279  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3882  SirA family protein  53.75 
 
 		 81 aa  103  6e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04046  sirA protein  56.76 
 
 		 86 aa  102  1e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0087  sulfur transfer protein SirA  55 
 
 		 81 aa  102  2e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.253958  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0092  sulfur transfer protein SirA  59.15 
 
 		 80 aa  102  2e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4280  SirA-like  56.76 
 
 		 83 aa  99  2e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.277621  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0010  sirA protein  56.79 
 
 		 81 aa  94.7  3e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1656  sulfur transfer protein SirA  44.16 
 
 		 80 aa  80.9  0.000000000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.100562  normal  0.450785 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2116  sulfur transfer protein SirA  44.16 
 
 		 80 aa  80.5  0.000000000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.101058 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3625  sulfur transfer protein SirA  44.16 
 
 		 80 aa  80.5  0.000000000000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.385858 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1633  sulfur transfer protein SirA  44.16 
 
 		 80 aa  80.1  0.000000000000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.972147 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1827  sulfur transfer protein SirA  42.86 
 
 		 84 aa  80.1  0.00000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0248688  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20060  sulfur transfer protein SirA  45.95 
 
 		 85 aa  78.6  0.00000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3888  sulfur transfer protein SirA  45.45 
 
 		 83 aa  78.6  0.00000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.420847  normal  0.0778981 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1155  regulatory protein, MarR  47.95 
 
 		 82 aa  78.2  0.00000000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.102823 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2236  SirA family protein  47.06 
 
 		 77 aa  77.4  0.00000000000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.278986  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2018  SirA protein, putative  43.24 
 
 		 84 aa  76.6  0.0000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0674453  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2411  SirA-like protein  44.78 
 
 		 83 aa  76.6  0.0000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0140  SirA family protein  42.17 
 
 		 97 aa  76.6  0.0000000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44270  sulfur transfer protein SirA  44.44 
 
 		 79 aa  76.3  0.0000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1905  sulfur transfer protein SirA  47.06 
 
 		 83 aa  75.9  0.0000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00381161  normal  0.533797 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3766  sulfur transfer protein SirA  44.44 
 
 		 79 aa  75.9  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.769061  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0059  SirA-like  46.75 
 
 		 86 aa  75.1  0.0000000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.470716 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0054  hypothetical protein  45.45 
 
 		 86 aa  74.7  0.0000000000004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1779  SirA family protein  41.56 
 
 		 81 aa  73.6  0.000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1458  SirA-like  43.59 
 
 		 78 aa  68.2  0.00000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.000274297  normal  0.357093 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1982  hypothetical protein  41.56 
 
 		 79 aa  63.5  0.0000000009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.948606  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1672  SirA family protein  38.89 
 
 		 76 aa  62.8  0.000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0940  hypothetical protein  38.36 
 
 		 75 aa  61.6  0.000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000000596514  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2618  SirA-like protein  34.78 
 
 		 80 aa  60.5  0.000000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0939  hypothetical protein  38.03 
 
 		 75 aa  60.1  0.00000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000269274  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0688  SirA family protein  34.25 
 
 		 75 aa  59.7  0.00000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0967  SirA family protein  39.13 
 
 		 72 aa  58.9  0.00000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.500955  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1254  hypothetical protein  33.33 
 
 		 77 aa  58.9  0.00000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2932  SirA family protein  31.94 
 
 		 77 aa  58.9  0.00000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0674  hypothetical protein  34.25 
 
 		 76 aa  58.5  0.00000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.384362  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0868  hypothetical protein  35.62 
 
 		 75 aa  57.8  0.00000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4504  hypothetical protein  34.25 
 
 		 76 aa  58.2  0.00000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000117975 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4391  hypothetical protein  29.73 
 
 		 83 aa  57.4  0.00000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1134  hypothetical protein  33.33 
 
 		 75 aa  57.4  0.00000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00450728 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0038  SirA family protein  29.87 
 
 		 78 aa  57.4  0.00000007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  unclonable  0.00000000000000689982  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1937  SirA family protein  33.8 
 
 		 76 aa  57  0.00000008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.559837  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35370  SirA-like protein  31.88 
 
 		 83 aa  56.6  0.0000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3088  SirA-like  33.82 
 
 		 75 aa  56.6  0.0000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0436  SirA-like  37.68 
 
 		 75 aa  56.6  0.0000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0794  SirA family protein  30.43 
 
 		 76 aa  56.2  0.0000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000819157  normal  0.19401 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1694  SirA family protein  33.8 
 
 		 75 aa  55.8  0.0000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.304124  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0740  hypothetical protein  32.88 
 
 		 76 aa  55.1  0.0000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0137112  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0688  hypothetical protein  32.88 
 
 		 76 aa  55.1  0.0000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.301237  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2894  SirA family protein  30.14 
 
 		 75 aa  55.1  0.0000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0778  hypothetical protein  32.88 
 
 		 75 aa  55.1  0.0000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4185  SirA family protein  29.11 
 
 		 79 aa  55.1  0.0000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.312975  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0872  hypothetical protein  32.88 
 
 		 76 aa  55.1  0.0000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000063042 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1233  SirA family protein  30.43 
 
 		 79 aa  55.1  0.0000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1367  SirA-like  30.38 
 
 		 79 aa  54.7  0.0000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.463137  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1263  SirA family protein  30.43 
 
 		 79 aa  55.1  0.0000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.600838  normal  0.692978 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0832  hypothetical protein  32.88 
 
 		 76 aa  54.7  0.0000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00406829  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1014  putative aminotransferase  38.18 
 
 		 78 aa  54.7  0.0000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0541001  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51310  hypothetical protein  27.03 
 
 		 83 aa  54.3  0.0000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000169267 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>