282 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noc_2618 on replicon NC_007484
Organism: Nitrosococcus oceani ATCC 19707



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007484  Noc_2618  SirA-like protein  100 
 
 		 80 aa  165  2e-40  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2217  hypothetical protein  53.95 
 
 		 76 aa  97.4  5e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.403117  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0631  SirA family protein  50.67 
 
 		 76 aa  94  6e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.161479 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1937  SirA family protein  48.68 
 
 		 76 aa  89.4  1e-17  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.559837  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1672  SirA family protein  53.52 
 
 		 76 aa  85.1  3e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1254  hypothetical protein  52.94 
 
 		 77 aa  80.5  0.000000000000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3088  SirA-like  47.95 
 
 		 75 aa  76.3  0.0000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0574  hypothetical protein  46.58 
 
 		 75 aa  76.6  0.0000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000789219  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2557  hypothetical protein  51.32 
 
 		 76 aa  76.3  0.0000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  decreased coverage  0.00791893  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2187  SirA family protein  51.32 
 
 		 76 aa  76.3  0.0000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0108315  hitchhiker  0.000000214154 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2791  SirA family protein  49.32 
 
 		 76 aa  75.1  0.0000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.281845  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2377  SirA-like  47.89 
 
 		 75 aa  73.9  0.0000000000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0972982  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0232  sulfur transfer protein SirA  40.54 
 
 		 84 aa  72.8  0.000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3986  sulfur transfer protein SirA  40.54 
 
 		 84 aa  72.8  0.000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0570  sulfur transfer protein SirA  40.54 
 
 		 84 aa  72.8  0.000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0810  hypothetical protein  42.47 
 
 		 75 aa  72  0.000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.566586 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0826  SirA family protein  42.47 
 
 		 75 aa  72  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.24854 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1881  SirA family protein  46.38 
 
 		 75 aa  72  0.000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.045708 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0756  SirA family protein  42.47 
 
 		 75 aa  72  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0477358 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4578  SirA-like protein  46.38 
 
 		 75 aa  72  0.000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.408362  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1333  hypothetical protein  46.38 
 
 		 77 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0952  SirA-like  46.38 
 
 		 75 aa  72  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.872302  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1134  hypothetical protein  45.95 
 
 		 75 aa  72.4  0.000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00450728 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1412  SirA family protein  46.38 
 
 		 75 aa  72  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.960057 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1434  SirA family protein  46.38 
 
 		 75 aa  72  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2801  SirA family protein  46.38 
 
 		 77 aa  71.6  0.000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.205489 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1353  SirA family protein  46.38 
 
 		 75 aa  71.2  0.000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.563442  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1314  SirA family protein  46.38 
 
 		 75 aa  71.2  0.000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3170  SirA family protein  43.84 
 
 		 77 aa  70.5  0.000000000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.206236 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1298  SirA family protein  46.48 
 
 		 75 aa  70.1  0.000000000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0330  SirA family protein  43.24 
 
 		 80 aa  70.1  0.00000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0794  SirA family protein  42.67 
 
 		 76 aa  70.1  0.00000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000819157  normal  0.19401 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0920  hypothetical protein  47.14 
 
 		 76 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1839  hypothetical protein  47.14 
 
 		 76 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1011  SirA-like  42.47 
 
 		 75 aa  68.9  0.00000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1684  hypothetical protein  47.14 
 
 		 76 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.109756  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2640  hypothetical protein  47.14 
 
 		 76 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0863392  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1453  hypothetical protein  47.14 
 
 		 76 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0734  hypothetical protein  47.14 
 
 		 76 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0811  SirA-like protein  42.47 
 
 		 75 aa  68.9  0.00000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0842772 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4069  SirA family protein  43.06 
 
 		 81 aa  69.3  0.00000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1662  hypothetical protein  47.14 
 
 		 76 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0398143  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0429  hypothetical protein  47.14 
 
 		 76 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0594568  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2088  hypothetical protein  48.61 
 
 		 76 aa  68.6  0.00000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0107447  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0861  SirA-like  42.47 
 
 		 75 aa  68.6  0.00000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3882  SirA family protein  42.47 
 
 		 81 aa  68.2  0.00000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1458  SirA-like  47.37 
 
 		 78 aa  68.6  0.00000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.000274297  normal  0.357093 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1028  SirA family protein  45.21 
 
 		 75 aa  68.6  0.00000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.399081  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2898  SirA family protein  45.21 
 
 		 75 aa  67.8  0.00000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0093  SirA-like protein  45.57 
 
 		 82 aa  67.8  0.00000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2384  SirA family protein  45.21 
 
 		 75 aa  67.8  0.00000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.21335  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3746  SirA family protein  45.07 
 
 		 74 aa  67.8  0.00000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00371656  unclonable  0.000000591857 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2575  molybdopterin cofactor biosynthesis MoaC region  36.84 
 
 		 85 aa  67.8  0.00000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0033  hypothetical protein  42.03 
 
 		 78 aa  67  0.00000000007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00000671264  normal  0.064173 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1593  SirA family protein  47.14 
 
 		 78 aa  67  0.00000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.433427  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1718  SirA family protein  40.28 
 
 		 81 aa  67  0.00000000008  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0092  sulfur transfer protein SirA  41.67 
 
 		 80 aa  67  0.00000000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2324  SirA family protein  40.85 
 
 		 77 aa  66.2  0.0000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0434291  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2214  SirA family protein  44.93 
 
 		 75 aa  66.2  0.0000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.160562 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0087  sulfur transfer protein SirA  41.67 
 
 		 81 aa  66.6  0.0000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.253958  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0125  SirA family protein  40.85 
 
 		 78 aa  66.6  0.0000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1436  SirA family protein  40.28 
 
 		 81 aa  66.2  0.0000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.324916  normal  0.46012 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0013  sulfur transfer protein SirA  34.29 
 
 		 81 aa  65.5  0.0000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0017  sulfur transfer protein SirA  35.21 
 
 		 81 aa  65.9  0.0000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000196342 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1989  SirA family protein  43.48 
 
 		 75 aa  65.9  0.0000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000867317 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0205  SirA family protein  35.62 
 
 		 81 aa  65.5  0.0000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.106509 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0015  sulfur transfer protein SirA  33.8 
 
 		 81 aa  65.1  0.0000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0331062  normal  0.432402 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3877  sulfur transfer protein SirA  38.89 
 
 		 81 aa  65.1  0.0000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.899871  normal  0.161761 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0012  sulfur transfer protein SirA  33.8 
 
 		 81 aa  65.1  0.0000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0020  sulfur transfer protein SirA  33.8 
 
 		 81 aa  65.1  0.0000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000878962 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1779  SirA family protein  42.47 
 
 		 81 aa  65.1  0.0000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0225  regulator of information in SirA family protein  39.13 
 
 		 78 aa  65.1  0.0000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0026  SirA family protein  38.03 
 
 		 78 aa  64.7  0.0000000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000175689  normal  0.0503522 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1959  redox protein regulator of disulfide bond formation-like  42.03 
 
 		 103 aa  64.3  0.0000000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0000373287  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03319  cell developmental protein SirA  37.5 
 
 		 81 aa  63.9  0.0000000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0245  SirA family protein  37.5 
 
 		 81 aa  63.9  0.0000000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3852  sulfur transfer protein SirA  37.5 
 
 		 81 aa  63.9  0.0000000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0246  sulfur transfer protein SirA  37.5 
 
 		 81 aa  63.9  0.0000000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4790  sulfur transfer protein SirA  37.5 
 
 		 81 aa  63.9  0.0000000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3669  sulfur transfer protein SirA  37.5 
 
 		 81 aa  63.9  0.0000000007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03272  hypothetical protein  37.5 
 
 		 81 aa  63.9  0.0000000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3952  sulfur transfer protein SirA  37.5 
 
 		 81 aa  63.9  0.0000000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001993  tRNA 5-methylaminomethyl-2-thiouridine synthase TusA  37.14 
 
 		 82 aa  63.5  0.0000000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35370  SirA-like protein  43.06 
 
 		 83 aa  63.5  0.0000000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0011  sulfur transfer protein SirA  35.21 
 
 		 81 aa  63.5  0.0000000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1659  SirA family protein  41.33 
 
 		 79 aa  63.2  0.000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.995311  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3724  SirA-like  42.25 
 
 		 75 aa  63.2  0.000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.893626 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0029  redox protein regulator of disulfide bond formation  34.25 
 
 		 99 aa  63.2  0.000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0748983  normal  0.0110056 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3770  hypothetical protein  36.11 
 
 		 111 aa  62  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1085  SirA family protein  42.25 
 
 		 77 aa  62  0.000000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0017  sulfur transfer protein SirA  32.86 
 
 		 81 aa  62.4  0.000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0103959 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3890  hypothetical protein  36.11 
 
 		 111 aa  62  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0011  sulfur transfer protein SirA  32.39 
 
 		 81 aa  62.8  0.000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.119018  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2495  sulfur transfer protein SirA  38.57 
 
 		 82 aa  62.8  0.000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3780  hypothetical protein  36.11 
 
 		 111 aa  62  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04046  sirA protein  38.57 
 
 		 86 aa  62.4  0.000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3847  hypothetical protein  36.11 
 
 		 111 aa  62  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0017  sulfur transfer protein SirA  32.86 
 
 		 81 aa  62.4  0.000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000123371 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0013  sulfur transfer protein SirA  32.39 
 
 		 81 aa  62.4  0.000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000182945 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0013  sulfur transfer protein SirA  32.39 
 
 		 81 aa  62.4  0.000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0557081 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>