More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_1458 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008044  TM1040_1458  SirA-like  100 
 
 		 78 aa  158  3e-38  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.000274297  normal  0.357093 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2339  SirA family protein  66.18 
 
 		 75 aa  94.4  5e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0889916  normal  0.318145 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2132  hypothetical protein  58.11 
 
 		 75 aa  93.2  9e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  hitchhiker  0.00495785  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0807  SirA family protein  58.11 
 
 		 101 aa  93.6  9e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.720013  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0717  SirA family protein  52.7 
 
 		 102 aa  87.4  5e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.178055  normal  0.908547 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2558  SirA family protein  54.17 
 
 		 80 aa  78.6  0.00000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.488236 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2399  SirA-like  54.93 
 
 		 74 aa  77.4  0.00000000000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.433209  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0794  SirA family protein  44 
 
 		 76 aa  74.3  0.0000000000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000819157  normal  0.19401 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3601  SirA family protein  45.59 
 
 		 74 aa  73.2  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0232  sulfur transfer protein SirA  46.25 
 
 		 84 aa  73.2  0.000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0570  sulfur transfer protein SirA  46.25 
 
 		 84 aa  73.2  0.000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3986  sulfur transfer protein SirA  46.25 
 
 		 84 aa  73.2  0.000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3894  SirA family protein  46.27 
 
 		 74 aa  72  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.401469  hitchhiker  0.00420681 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0436  SirA-like  39.44 
 
 		 75 aa  71.2  0.000000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20060  sulfur transfer protein SirA  44.44 
 
 		 85 aa  71.6  0.000000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1905  sulfur transfer protein SirA  45.21 
 
 		 83 aa  70.5  0.000000000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00381161  normal  0.533797 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0092  sulfur transfer protein SirA  46.05 
 
 		 80 aa  70.1  0.000000000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1937  SirA family protein  40 
 
 		 76 aa  70.1  0.000000000009  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.559837  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0087  sulfur transfer protein SirA  46.05 
 
 		 81 aa  70.1  0.00000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.253958  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4069  SirA family protein  46.91 
 
 		 81 aa  69.7  0.00000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3877  sulfur transfer protein SirA  45.68 
 
 		 81 aa  69.7  0.00000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.899871  normal  0.161761 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1633  sulfur transfer protein SirA  44.3 
 
 		 80 aa  68.9  0.00000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.972147 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1672  SirA family protein  44.44 
 
 		 76 aa  68.9  0.00000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03319  cell developmental protein SirA  45.68 
 
 		 81 aa  68.6  0.00000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0245  SirA family protein  45.68 
 
 		 81 aa  68.6  0.00000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2018  SirA protein, putative  39.19 
 
 		 84 aa  68.6  0.00000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0674453  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3852  sulfur transfer protein SirA  45.68 
 
 		 81 aa  68.6  0.00000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1827  sulfur transfer protein SirA  39.19 
 
 		 84 aa  68.6  0.00000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0248688  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2217  hypothetical protein  42.11 
 
 		 76 aa  68.6  0.00000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.403117  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3669  sulfur transfer protein SirA  45.68 
 
 		 81 aa  68.6  0.00000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2618  SirA-like protein  47.37 
 
 		 80 aa  68.6  0.00000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3888  sulfur transfer protein SirA  40.26 
 
 		 83 aa  68.6  0.00000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.420847  normal  0.0778981 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0246  sulfur transfer protein SirA  45.68 
 
 		 81 aa  68.6  0.00000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3952  sulfur transfer protein SirA  45.68 
 
 		 81 aa  68.6  0.00000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1572  sulfur transfer protein SirA  43.59 
 
 		 79 aa  68.2  0.00000000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44270  sulfur transfer protein SirA  41.89 
 
 		 79 aa  68.2  0.00000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4790  sulfur transfer protein SirA  45.68 
 
 		 81 aa  68.6  0.00000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03272  hypothetical protein  45.68 
 
 		 81 aa  68.6  0.00000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2034  hypothetical protein  44.78 
 
 		 85 aa  68.2  0.00000000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.358481  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1656  sulfur transfer protein SirA  44.3 
 
 		 80 aa  67.8  0.00000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.100562  normal  0.450785 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3766  sulfur transfer protein SirA  41.89 
 
 		 79 aa  68.2  0.00000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.769061  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2088  hypothetical protein  42.11 
 
 		 76 aa  67.8  0.00000000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0107447  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2570  SirA family protein  46.27 
 
 		 78 aa  67.8  0.00000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0845145  normal  0.388571 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2116  sulfur transfer protein SirA  44.3 
 
 		 80 aa  67.4  0.00000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.101058 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3625  sulfur transfer protein SirA  44.3 
 
 		 80 aa  67.4  0.00000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.385858 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1644  SirA family protein  56.52 
 
 		 100 aa  67.4  0.00000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0015  sulfur transfer protein SirA  43.48 
 
 		 81 aa  67.4  0.00000000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0331062  normal  0.432402 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0904  SirA family protein  46.27 
 
 		 78 aa  67  0.00000000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.849606  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3890  hypothetical protein  44.44 
 
 		 111 aa  66.2  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0205  SirA family protein  43.75 
 
 		 81 aa  66.6  0.0000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.106509 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0019  sulfur transfer protein SirA  41.25 
 
 		 81 aa  66.2  0.0000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3950  hypothetical protein  44.44 
 
 		 111 aa  66.2  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.785107  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3847  hypothetical protein  44.44 
 
 		 111 aa  66.2  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3754  sulfur transfer protein SirA  44.44 
 
 		 81 aa  66.6  0.0000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0631  SirA family protein  40 
 
 		 76 aa  66.6  0.0000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.161479 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3770  hypothetical protein  44.44 
 
 		 111 aa  66.2  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0967  SirA family protein  41.43 
 
 		 72 aa  66.2  0.0000000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.500955  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3780  hypothetical protein  44.44 
 
 		 111 aa  66.2  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0013  sulfur transfer protein SirA  41.25 
 
 		 81 aa  66.6  0.0000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000182945 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0013  sulfur transfer protein SirA  41.25 
 
 		 81 aa  66.6  0.0000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0557081 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0021  sulfur transfer protein SirA  41.25 
 
 		 81 aa  66.2  0.0000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.628095  hitchhiker  0.000000017124 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1779  SirA family protein  42.11 
 
 		 81 aa  66.2  0.0000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0012  sulfur transfer protein SirA  42.03 
 
 		 81 aa  65.5  0.0000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0017  sulfur transfer protein SirA  43.48 
 
 		 81 aa  65.9  0.0000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000196342 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0020  sulfur transfer protein SirA  43.48 
 
 		 81 aa  65.1  0.0000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000878962 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0225  regulator of information in SirA family protein  42.86 
 
 		 78 aa  65.1  0.0000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0029  redox protein regulator of disulfide bond formation  43.06 
 
 		 99 aa  64.7  0.0000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0748983  normal  0.0110056 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1085  SirA family protein  39.44 
 
 		 77 aa  64.7  0.0000000004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0017  sulfur transfer protein SirA  43.48 
 
 		 81 aa  64.3  0.0000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000123371 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0018  sulfur transfer protein SirA  43.48 
 
 		 81 aa  64.3  0.0000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0017  sulfur transfer protein SirA  43.48 
 
 		 81 aa  64.3  0.0000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0103959 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3882  SirA family protein  45 
 
 		 81 aa  64.3  0.0000000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2791  SirA family protein  41.1 
 
 		 76 aa  63.9  0.0000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.281845  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4059  hypothetical protein  48.53 
 
 		 90 aa  63.9  0.0000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0011  sulfur transfer protein SirA  43.48 
 
 		 81 aa  63.9  0.0000000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.119018  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0574  hypothetical protein  38.36 
 
 		 75 aa  63.9  0.0000000008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000789219  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0013  sulfur transfer protein SirA  43.48 
 
 		 81 aa  63.5  0.0000000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2495  sulfur transfer protein SirA  43.06 
 
 		 82 aa  62.8  0.000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3688  SirA-like  42.65 
 
 		 80 aa  63.2  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0013  sulfur transfer protein SirA  38.75 
 
 		 81 aa  63.2  0.000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000321499  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6347  hypothetical protein  48.48 
 
 		 71 aa  63.2  0.000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.341476  normal  0.150375 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3149  SirA family protein  41.67 
 
 		 89 aa  63.2  0.000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0259716 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0810  hypothetical protein  38.36 
 
 		 75 aa  62  0.000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.566586 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3088  SirA-like  39.19 
 
 		 75 aa  62.4  0.000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1254  hypothetical protein  36 
 
 		 77 aa  62.4  0.000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1300  SirA family protein  40.85 
 
 		 77 aa  62.4  0.000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0506875  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2411  SirA-like protein  38.57 
 
 		 83 aa  62  0.000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3129  SirA-like  44.12 
 
 		 80 aa  62.8  0.000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.445608  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2642  SirA family protein  35.14 
 
 		 201 aa  62.4  0.000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.140879  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1011  SirA-like  38.36 
 
 		 75 aa  62  0.000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2890  SirA family protein  35.06 
 
 		 189 aa  61.2  0.000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001993  tRNA 5-methylaminomethyl-2-thiouridine synthase TusA  38.57 
 
 		 82 aa  61.6  0.000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0940  hypothetical protein  35.62 
 
 		 75 aa  61.2  0.000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000000596514  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0011  sulfur transfer protein SirA  40.58 
 
 		 81 aa  61.6  0.000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1353  SirA family protein  38.89 
 
 		 75 aa  60.8  0.000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.563442  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1314  SirA family protein  38.89 
 
 		 75 aa  60.8  0.000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00453  sulfur transfer protein SirA  40 
 
 		 82 aa  60.8  0.000000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0330  SirA family protein  40.54 
 
 		 80 aa  60.8  0.000000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1718  SirA family protein  36.11 
 
 		 81 aa  60.5  0.000000007  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0561  SirA family protein  33.78 
 
 		 75 aa  60.5  0.000000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00147914  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>