More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_3894 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012850  Rleg_3894  SirA family protein  100 
 
 		 74 aa  155  3e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.401469  hitchhiker  0.00420681 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3601  SirA family protein  95.89 
 
 		 74 aa  149  2e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2570  SirA family protein  66.67 
 
 		 78 aa  107  7.000000000000001e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0845145  normal  0.388571 
 
 
-
 
NC_004310  BR2034  hypothetical protein  58.9 
 
 		 85 aa  97.4  5e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.358481  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3059  SirA-like  60.87 
 
 		 76 aa  97.1  7e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.282994  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4059  hypothetical protein  57.97 
 
 		 90 aa  95.9  1e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0904  SirA family protein  57.14 
 
 		 78 aa  91.3  4e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.849606  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0807  SirA family protein  50.75 
 
 		 101 aa  79.3  0.00000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.720013  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2132  hypothetical protein  50.75 
 
 		 75 aa  79  0.00000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  hitchhiker  0.00495785  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0717  SirA family protein  47.76 
 
 		 102 aa  77.4  0.00000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.178055  normal  0.908547 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4368  SirA family protein  51.43 
 
 		 82 aa  72.4  0.000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1458  SirA-like  46.27 
 
 		 78 aa  72  0.000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.000274297  normal  0.357093 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2339  SirA family protein  43.28 
 
 		 75 aa  71.6  0.000000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0889916  normal  0.318145 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2558  SirA family protein  45.59 
 
 		 80 aa  69.7  0.00000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.488236 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0903  SirA family protein  48.57 
 
 		 94 aa  68.9  0.00000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0179319  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1254  hypothetical protein  40.3 
 
 		 77 aa  68.6  0.00000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0831  SirA family protein  47.14 
 
 		 93 aa  68.2  0.00000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.378872  normal  0.616604 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3129  SirA-like  47.95 
 
 		 80 aa  68.2  0.00000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.445608  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1644  SirA family protein  50 
 
 		 100 aa  67.8  0.00000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0794  SirA family protein  43.28 
 
 		 76 aa  67.8  0.00000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000819157  normal  0.19401 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0863  SirA family protein  48.57 
 
 		 88 aa  67.4  0.00000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.252783  normal  0.310522 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4174  SirA family protein  42.47 
 
 		 85 aa  67  0.00000000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.197617  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2429  SirA-like  50 
 
 		 91 aa  66.2  0.0000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1085  SirA family protein  42.65 
 
 		 77 aa  65.5  0.0000000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3088  SirA-like  36.76 
 
 		 75 aa  65.5  0.0000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0033  hypothetical protein  39.71 
 
 		 78 aa  65.1  0.0000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00000671264  normal  0.064173 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1626  SirA-like  37.84 
 
 		 75 aa  65.1  0.0000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000122761  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2324  SirA family protein  38.24 
 
 		 77 aa  65.5  0.0000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0434291  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3548  SirA family protein  45.71 
 
 		 100 aa  64.7  0.0000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.379024  normal  0.567232 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0975  SirA-like protein  47.76 
 
 		 101 aa  64.7  0.0000000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.369067  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1011  SirA-like  39.71 
 
 		 75 aa  64.7  0.0000000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2937  SirA-like  46.27 
 
 		 97 aa  64.3  0.0000000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0093  SirA-like protein  41.67 
 
 		 82 aa  63.9  0.0000000007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0978  SirA family protein  43.48 
 
 		 80 aa  63.5  0.0000000008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0114244 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7291  SirA family protein  44.44 
 
 		 87 aa  63.2  0.000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0861  SirA-like  41.18 
 
 		 75 aa  63.2  0.000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1672  SirA family protein  39.71 
 
 		 76 aa  63.2  0.000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5996  SirA family protein  47.06 
 
 		 89 aa  62  0.000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00696256 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1873  SirA-like  39.73 
 
 		 82 aa  62.4  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.265759  normal  0.477358 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3493  SirA-like  41.1 
 
 		 94 aa  62.4  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.73146  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0940  hypothetical protein  36.23 
 
 		 75 aa  62.8  0.000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000000596514  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3302  SirA family protein  37.5 
 
 		 76 aa  62  0.000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.267105 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3614  SirA family protein  44.29 
 
 		 76 aa  61.2  0.000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000103575 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4578  SirA-like protein  38.24 
 
 		 75 aa  61.6  0.000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.408362  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2399  SirA-like  50 
 
 		 74 aa  61.2  0.000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.433209  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1412  SirA family protein  38.24 
 
 		 75 aa  61.6  0.000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.960057 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3688  SirA-like  41.1 
 
 		 80 aa  61.6  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1881  SirA family protein  38.24 
 
 		 75 aa  61.6  0.000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.045708 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0952  SirA-like  38.24 
 
 		 75 aa  61.6  0.000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.872302  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0631  SirA family protein  40.3 
 
 		 76 aa  61.6  0.000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.161479 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0330  SirA family protein  37.31 
 
 		 80 aa  61.2  0.000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1434  SirA family protein  38.24 
 
 		 75 aa  61.6  0.000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2088  hypothetical protein  38.81 
 
 		 76 aa  60.8  0.000000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0107447  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0756  SirA family protein  39.71 
 
 		 75 aa  60.8  0.000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0477358 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1959  redox protein regulator of disulfide bond formation-like  38.46 
 
 		 103 aa  61.2  0.000000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0000373287  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0826  SirA family protein  39.71 
 
 		 75 aa  60.8  0.000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.24854 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1314  SirA family protein  38.24 
 
 		 75 aa  60.8  0.000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1353  SirA family protein  38.24 
 
 		 75 aa  60.8  0.000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.563442  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0939  hypothetical protein  34.78 
 
 		 75 aa  60.8  0.000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000269274  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2791  SirA family protein  34.78 
 
 		 76 aa  60.5  0.000000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.281845  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0811  SirA-like protein  39.71 
 
 		 75 aa  60.8  0.000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0842772 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6347  hypothetical protein  42.42 
 
 		 71 aa  60.5  0.000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.341476  normal  0.150375 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0810  hypothetical protein  39.71 
 
 		 75 aa  60.5  0.000000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.566586 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0574  hypothetical protein  35.29 
 
 		 75 aa  60.5  0.000000008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000789219  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5387  SirA family protein  47.46 
 
 		 89 aa  60.5  0.000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.895582  normal  0.53519 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1662  hypothetical protein  39.13 
 
 		 76 aa  60.1  0.000000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0398143  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0734  hypothetical protein  39.13 
 
 		 76 aa  60.1  0.000000009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0920  hypothetical protein  39.13 
 
 		 76 aa  60.1  0.000000009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1453  hypothetical protein  39.13 
 
 		 76 aa  60.1  0.000000009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0429  hypothetical protein  39.13 
 
 		 76 aa  60.1  0.000000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0594568  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1839  hypothetical protein  39.13 
 
 		 76 aa  60.1  0.000000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1684  hypothetical protein  39.13 
 
 		 76 aa  60.1  0.000000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.109756  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2640  hypothetical protein  39.13 
 
 		 76 aa  60.1  0.000000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0863392  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1937  SirA family protein  37.31 
 
 		 76 aa  59.7  0.00000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.559837  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1298  SirA family protein  38.24 
 
 		 75 aa  59.7  0.00000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0090  SirA family protein  39.19 
 
 		 85 aa  60.1  0.00000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0719339  normal  0.137098 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1333  hypothetical protein  36.76 
 
 		 77 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2932  SirA family protein  38.81 
 
 		 77 aa  59.7  0.00000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2384  SirA family protein  39.71 
 
 		 75 aa  58.9  0.00000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.21335  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0866  rhodanese domain-containing protein  34.33 
 
 		 186 aa  58.9  0.00000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1134  hypothetical protein  42.86 
 
 		 75 aa  59.3  0.00000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00450728 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2801  SirA family protein  36.76 
 
 		 77 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.205489 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1593  SirA family protein  40.58 
 
 		 78 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.433427  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2898  SirA family protein  39.71 
 
 		 75 aa  58.9  0.00000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1989  SirA family protein  36.76 
 
 		 75 aa  58.5  0.00000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000867317 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0436  SirA-like  34.33 
 
 		 75 aa  58.5  0.00000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1201  SirA family protein  42.42 
 
 		 92 aa  58.5  0.00000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2217  hypothetical protein  37.31 
 
 		 76 aa  58.5  0.00000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.403117  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1218  SirA family protein  40.91 
 
 		 77 aa  58.5  0.00000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0674  hypothetical protein  30.43 
 
 		 76 aa  58.2  0.00000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.384362  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4504  hypothetical protein  31.88 
 
 		 76 aa  58.2  0.00000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000117975 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1028  SirA family protein  38.24 
 
 		 75 aa  57.8  0.00000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.399081  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2500  SirA family protein  38.81 
 
 		 213 aa  57.8  0.00000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0937  rhodanese domain protein  35.82 
 
 		 186 aa  57.4  0.00000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000726035  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2653  SirA-like protein  37.5 
 
 		 78 aa  57.4  0.00000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00012248  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0830  rhodanese domain protein  35.82 
 
 		 186 aa  57.4  0.00000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00233764  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0125  SirA family protein  33.82 
 
 		 78 aa  57.8  0.00000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3777  SirA family protein  38.98 
 
 		 60 aa  57.4  0.00000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04360  predicted redox protein, regulator of disulfide bond formation  34.25 
 
 		 73 aa  57.4  0.00000007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00145857 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1633  sulfur transfer protein SirA  36.62 
 
 		 80 aa  57  0.00000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.972147 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>