291 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_2570 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009636  Smed_2570  SirA family protein  100 
 
 		 78 aa  161  3e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0845145  normal  0.388571 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3894  SirA family protein  66.67 
 
 		 74 aa  107  7.000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.401469  hitchhiker  0.00420681 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3601  SirA family protein  66.18 
 
 		 74 aa  105  3e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3059  SirA-like  64.71 
 
 		 76 aa  98.6  3e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.282994  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2034  hypothetical protein  62.32 
 
 		 85 aa  95.9  2e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.358481  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0904  SirA family protein  63.77 
 
 		 78 aa  95.1  3e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.849606  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4059  hypothetical protein  61.19 
 
 		 90 aa  92.8  2e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4368  SirA family protein  46.67 
 
 		 82 aa  73.9  0.0000000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7291  SirA family protein  51.47 
 
 		 87 aa  72.8  0.000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0831  SirA family protein  44.74 
 
 		 93 aa  70.9  0.000000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.378872  normal  0.616604 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0717  SirA family protein  44.78 
 
 		 102 aa  70.5  0.000000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.178055  normal  0.908547 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5996  SirA family protein  51.47 
 
 		 89 aa  70.1  0.000000000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00696256 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0978  SirA family protein  45.33 
 
 		 80 aa  69.7  0.00000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0114244 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2339  SirA family protein  46.27 
 
 		 75 aa  69.7  0.00000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0889916  normal  0.318145 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0903  SirA family protein  44.59 
 
 		 94 aa  69.3  0.00000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0179319  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2558  SirA family protein  47.62 
 
 		 80 aa  69.3  0.00000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.488236 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0807  SirA family protein  44.78 
 
 		 101 aa  68.6  0.00000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.720013  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2132  hypothetical protein  44.78 
 
 		 75 aa  68.6  0.00000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  hitchhiker  0.00495785  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3129  SirA-like  49.28 
 
 		 80 aa  67.8  0.00000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.445608  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2429  SirA-like  48.57 
 
 		 91 aa  68.2  0.00000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1458  SirA-like  46.27 
 
 		 78 aa  67.8  0.00000000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.000274297  normal  0.357093 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5387  SirA family protein  51.67 
 
 		 89 aa  67.4  0.00000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.895582  normal  0.53519 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2324  SirA family protein  37.66 
 
 		 77 aa  67  0.00000000008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0434291  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0975  SirA-like protein  46.38 
 
 		 101 aa  66.6  0.00000000009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.369067  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4174  SirA family protein  45.83 
 
 		 85 aa  66.2  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.197617  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6347  hypothetical protein  50 
 
 		 71 aa  66.2  0.0000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.341476  normal  0.150375 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2937  SirA-like  44.93 
 
 		 97 aa  66.6  0.0000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0863  SirA family protein  43.24 
 
 		 88 aa  66.2  0.0000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.252783  normal  0.310522 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3688  SirA-like  48.53 
 
 		 80 aa  65.9  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1085  SirA family protein  42.86 
 
 		 77 aa  65.1  0.0000000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1959  redox protein regulator of disulfide bond formation-like  37.5 
 
 		 103 aa  64.7  0.0000000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0000373287  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1626  SirA-like  42.03 
 
 		 75 aa  64.7  0.0000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000122761  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3493  SirA-like  45.59 
 
 		 94 aa  64.3  0.0000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.73146  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0940  hypothetical protein  40.3 
 
 		 75 aa  63.5  0.0000000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000000596514  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0939  hypothetical protein  38.89 
 
 		 75 aa  63.2  0.000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000269274  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0866  rhodanese domain-containing protein  44.07 
 
 		 186 aa  62.4  0.000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1011  SirA-like  38.24 
 
 		 75 aa  62  0.000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1873  SirA-like  40 
 
 		 82 aa  62.4  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.265759  normal  0.477358 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1254  hypothetical protein  33.77 
 
 		 77 aa  62  0.000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0794  SirA family protein  35.14 
 
 		 76 aa  61.6  0.000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000819157  normal  0.19401 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3548  SirA family protein  43.06 
 
 		 100 aa  61.2  0.000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.379024  normal  0.567232 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0033  hypothetical protein  36.99 
 
 		 78 aa  61.2  0.000000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00000671264  normal  0.064173 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2399  SirA-like  43.33 
 
 		 74 aa  60.8  0.000000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.433209  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0330  SirA family protein  37.31 
 
 		 80 aa  60.5  0.000000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0674  hypothetical protein  35.82 
 
 		 76 aa  60.1  0.000000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.384362  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4504  hypothetical protein  37.31 
 
 		 76 aa  59.7  0.00000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000117975 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2653  SirA-like protein  42.86 
 
 		 78 aa  59.7  0.00000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00012248  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1633  sulfur transfer protein SirA  41.18 
 
 		 80 aa  60.1  0.00000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.972147 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2116  sulfur transfer protein SirA  41.18 
 
 		 80 aa  59.3  0.00000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.101058 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1656  sulfur transfer protein SirA  41.18 
 
 		 80 aa  59.3  0.00000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.100562  normal  0.450785 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0574  hypothetical protein  36.76 
 
 		 75 aa  58.9  0.00000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000789219  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2819  SirA-like protein  38.81 
 
 		 83 aa  59.3  0.00000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3625  sulfur transfer protein SirA  41.18 
 
 		 80 aa  59.3  0.00000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.385858 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2932  SirA family protein  36.84 
 
 		 77 aa  58.9  0.00000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3746  SirA family protein  40.74 
 
 		 74 aa  57.8  0.00000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00371656  unclonable  0.000000591857 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0740  hypothetical protein  34.33 
 
 		 76 aa  57.4  0.00000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0137112  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0688  hypothetical protein  34.33 
 
 		 76 aa  57.4  0.00000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.301237  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0830  rhodanese domain protein  38.98 
 
 		 186 aa  57.4  0.00000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00233764  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0778  hypothetical protein  34.33 
 
 		 75 aa  57.4  0.00000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0872  hypothetical protein  34.33 
 
 		 76 aa  57.4  0.00000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000063042 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0686  SirA family protein  38.98 
 
 		 194 aa  57.4  0.00000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1672  SirA family protein  39.71 
 
 		 76 aa  57.4  0.00000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0038  SirA family protein  32.35 
 
 		 78 aa  57.4  0.00000007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  unclonable  0.00000000000000689982  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2088  hypothetical protein  37.31 
 
 		 76 aa  57.4  0.00000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0107447  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0937  rhodanese domain protein  38.98 
 
 		 186 aa  57.4  0.00000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000726035  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0026  SirA family protein  29.73 
 
 		 78 aa  57  0.00000008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000175689  normal  0.0503522 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0125  SirA family protein  32.88 
 
 		 78 aa  57  0.00000008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1644  SirA family protein  43.24 
 
 		 100 aa  57  0.00000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0870  rhodanese domain protein  37.29 
 
 		 186 aa  56.6  0.0000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000347313 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0738  rhodanese domain-containing protein  37.29 
 
 		 186 aa  56.6  0.0000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0001064  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0686  hypothetical protein  37.29 
 
 		 186 aa  56.6  0.0000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.745505  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0672  hypothetical protein  37.29 
 
 		 186 aa  56.6  0.0000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00074605  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0776  rhodanese domain-containing protein  37.29 
 
 		 186 aa  56.6  0.0000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0017  sulfur transfer protein SirA  38.89 
 
 		 81 aa  55.5  0.0000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0103959 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1860  SirA family protein  31.51 
 
 		 78 aa  56.2  0.0000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000771633  normal  0.0684437 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0868  hypothetical protein  34.33 
 
 		 75 aa  55.8  0.0000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0225  regulator of information in SirA family protein  38.16 
 
 		 78 aa  56.2  0.0000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0832  hypothetical protein  37.31 
 
 		 76 aa  56.2  0.0000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00406829  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1937  SirA family protein  35.82 
 
 		 76 aa  55.8  0.0000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.559837  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0436  SirA-like  31.51 
 
 		 75 aa  56.2  0.0000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0018  sulfur transfer protein SirA  38.89 
 
 		 81 aa  55.5  0.0000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0059  SirA-like  39.44 
 
 		 86 aa  55.8  0.0000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.470716 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0561  SirA family protein  34.33 
 
 		 75 aa  55.8  0.0000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00147914  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0017  sulfur transfer protein SirA  38.89 
 
 		 81 aa  55.5  0.0000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000123371 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2187  SirA family protein  36.84 
 
 		 76 aa  55.1  0.0000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0108315  hitchhiker  0.000000214154 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4506  rhodanese domain protein  37.29 
 
 		 186 aa  55.5  0.0000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000693639 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0054  hypothetical protein  39.44 
 
 		 86 aa  55.1  0.0000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20060  sulfur transfer protein SirA  39.71 
 
 		 85 aa  55.1  0.0000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001993  tRNA 5-methylaminomethyl-2-thiouridine synthase TusA  36 
 
 		 82 aa  55.1  0.0000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2642  SirA family protein  37.31 
 
 		 201 aa  55.1  0.0000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.140879  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3614  SirA family protein  36.92 
 
 		 76 aa  55.1  0.0000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000103575 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2557  hypothetical protein  36.84 
 
 		 76 aa  55.1  0.0000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  decreased coverage  0.00791893  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1779  SirA family protein  38.81 
 
 		 81 aa  55.5  0.0000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2894  SirA family protein  34.33 
 
 		 75 aa  55.1  0.0000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3088  SirA-like  36.76 
 
 		 75 aa  55.1  0.0000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0861  SirA-like  35.29 
 
 		 75 aa  54.7  0.0000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0631  SirA family protein  37.31 
 
 		 76 aa  54.7  0.0000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.161479 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0093  SirA-like protein  41.18 
 
 		 82 aa  54.7  0.0000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0013  sulfur transfer protein SirA  38.89 
 
 		 81 aa  54.7  0.0000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0020  sulfur transfer protein SirA  36.49 
 
 		 81 aa  54.3  0.0000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000878962 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>