289 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_0717 on replicon NC_009428
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009428  Rsph17025_0717  SirA family protein  100 
 
 
102 aa  207  3e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.178055  normal  0.908547 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0807  SirA family protein  84.16 
 
 
101 aa  159  1e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.720013  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2132  hypothetical protein  88 
 
 
75 aa  140  6e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  hitchhiker  0.00495785  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1458  SirA-like  52.7 
 
 
78 aa  87.4  5e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.000274297  normal  0.357093 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3601  SirA family protein  47.06 
 
 
74 aa  78.6  0.00000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3894  SirA family protein  47.76 
 
 
74 aa  77.4  0.00000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.401469  hitchhiker  0.00420681 
 
 
-
 
NC_004310  BR2034  hypothetical protein  56.72 
 
 
85 aa  77.4  0.00000000000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.358481  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3088  SirA-like  45.95 
 
 
75 aa  76.3  0.0000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1672  SirA family protein  43.24 
 
 
76 aa  75.5  0.0000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0794  SirA family protein  42.47 
 
 
76 aa  75.5  0.0000000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000819157  normal  0.19401 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2217  hypothetical protein  42.47 
 
 
76 aa  74.7  0.0000000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.403117  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0631  SirA family protein  43.06 
 
 
76 aa  74.3  0.0000000000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.161479 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0093  SirA-like protein  44.3 
 
 
82 aa  74.3  0.0000000000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4059  hypothetical protein  49.3 
 
 
90 aa  73.9  0.0000000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0903  SirA family protein  47.56 
 
 
94 aa  73.2  0.000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0179319  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2399  SirA-like  47.89 
 
 
74 aa  73.2  0.000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.433209  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3059  SirA-like  50 
 
 
76 aa  72.8  0.000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.282994  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0863  SirA family protein  47.5 
 
 
88 aa  72  0.000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.252783  normal  0.310522 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0330  SirA family protein  42.11 
 
 
80 aa  71.6  0.000000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1011  SirA-like  40.54 
 
 
75 aa  71.2  0.000000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1134  hypothetical protein  45.33 
 
 
75 aa  71.2  0.000000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00450728 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2570  SirA family protein  44.78 
 
 
78 aa  70.5  0.000000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0845145  normal  0.388571 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0574  hypothetical protein  39.19 
 
 
75 aa  70.5  0.000000000008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000789219  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0831  SirA family protein  50 
 
 
93 aa  70.1  0.00000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.378872  normal  0.616604 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1937  SirA family protein  43.24 
 
 
76 aa  70.1  0.00000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.559837  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2558  SirA family protein  46.48 
 
 
80 aa  70.1  0.00000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.488236 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2088  hypothetical protein  41.1 
 
 
76 aa  68.9  0.00000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0107447  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0861  SirA-like  44.59 
 
 
75 aa  68.9  0.00000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1779  SirA family protein  43.84 
 
 
81 aa  68.6  0.00000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5996  SirA family protein  49.3 
 
 
89 aa  68.2  0.00000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00696256 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0810  hypothetical protein  41.89 
 
 
75 aa  67.4  0.00000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.566586 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0904  SirA family protein  47.76 
 
 
78 aa  67.4  0.00000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.849606  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2339  SirA family protein  40.54 
 
 
75 aa  67  0.00000000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0889916  normal  0.318145 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7291  SirA family protein  46.91 
 
 
87 aa  67  0.00000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4506  rhodanese domain protein  33.78 
 
 
186 aa  66.6  0.0000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000693639 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3746  SirA family protein  40.85 
 
 
74 aa  66.6  0.0000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00371656  unclonable  0.000000591857 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0937  rhodanese domain protein  33.33 
 
 
186 aa  65.9  0.0000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000726035  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0686  hypothetical protein  33.78 
 
 
186 aa  65.5  0.0000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.745505  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0672  hypothetical protein  35.14 
 
 
186 aa  66.2  0.0000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00074605  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0830  rhodanese domain protein  32.89 
 
 
186 aa  65.9  0.0000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00233764  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0870  rhodanese domain protein  33.78 
 
 
186 aa  65.5  0.0000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000347313 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0017  sulfur transfer protein SirA  40 
 
 
81 aa  65.1  0.0000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000196342 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1644  SirA family protein  55.71 
 
 
100 aa  64.7  0.0000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2429  SirA-like  40.26 
 
 
91 aa  64.7  0.0000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1298  SirA family protein  37.84 
 
 
75 aa  64.7  0.0000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1881  SirA family protein  39.19 
 
 
75 aa  64.3  0.0000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.045708 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4578  SirA-like protein  39.19 
 
 
75 aa  64.3  0.0000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.408362  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2377  SirA-like  40.54 
 
 
75 aa  64.3  0.0000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0972982  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1412  SirA family protein  39.19 
 
 
75 aa  64.3  0.0000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.960057 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0811  SirA-like protein  40.54 
 
 
75 aa  64.3  0.0000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0842772 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0952  SirA-like  39.19 
 
 
75 aa  64.3  0.0000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.872302  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1434  SirA family protein  39.19 
 
 
75 aa  64.3  0.0000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1353  SirA family protein  39.19 
 
 
75 aa  64.3  0.0000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.563442  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1085  SirA family protein  36.62 
 
 
77 aa  64.3  0.0000000006  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1314  SirA family protein  39.19 
 
 
75 aa  64.3  0.0000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3614  SirA family protein  44 
 
 
76 aa  63.9  0.0000000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000103575 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1718  SirA family protein  37.5 
 
 
81 aa  63.9  0.0000000007  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5387  SirA family protein  51.67 
 
 
89 aa  63.9  0.0000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.895582  normal  0.53519 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0826  SirA family protein  39.19 
 
 
75 aa  63.5  0.000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.24854 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0738  rhodanese domain-containing protein  32 
 
 
186 aa  63.2  0.000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0001064  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0756  SirA family protein  39.19 
 
 
75 aa  63.5  0.000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0477358 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1254  hypothetical protein  38.57 
 
 
77 aa  63.2  0.000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0090  SirA family protein  47.06 
 
 
85 aa  63.2  0.000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0719339  normal  0.137098 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0776  rhodanese domain-containing protein  32 
 
 
186 aa  63.2  0.000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0020  sulfur transfer protein SirA  38.75 
 
 
81 aa  63.2  0.000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000878962 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0038  SirA family protein  36.76 
 
 
78 aa  62.4  0.000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  unclonable  0.00000000000000689982  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0866  rhodanese domain-containing protein  33.85 
 
 
186 aa  62.8  0.000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4174  SirA family protein  45.59 
 
 
85 aa  62.4  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.197617  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0975  SirA-like protein  40.58 
 
 
101 aa  62.4  0.000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.369067  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2898  SirA family protein  37.84 
 
 
75 aa  62.8  0.000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2791  SirA family protein  43.33 
 
 
76 aa  62  0.000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.281845  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0686  SirA family protein  33.85 
 
 
194 aa  62  0.000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2384  SirA family protein  37.84 
 
 
75 aa  62.8  0.000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.21335  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1436  SirA family protein  37.5 
 
 
81 aa  62.8  0.000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.324916  normal  0.46012 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1989  SirA family protein  37.84 
 
 
75 aa  61.6  0.000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000867317 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1201  SirA family protein  52.63 
 
 
92 aa  61.6  0.000000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0033  hypothetical protein  36.23 
 
 
78 aa  60.8  0.000000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00000671264  normal  0.064173 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3724  SirA-like  36.49 
 
 
75 aa  60.8  0.000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.893626 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3548  SirA family protein  44.93 
 
 
100 aa  60.5  0.000000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.379024  normal  0.567232 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1333  hypothetical protein  35.14 
 
 
77 aa  60.8  0.000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03319  cell developmental protein SirA  40.28 
 
 
81 aa  60.5  0.000000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0245  SirA family protein  40.28 
 
 
81 aa  60.5  0.000000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1028  SirA family protein  37.84 
 
 
75 aa  60.5  0.000000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.399081  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3669  sulfur transfer protein SirA  40.28 
 
 
81 aa  60.5  0.000000008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3952  sulfur transfer protein SirA  40.28 
 
 
81 aa  60.5  0.000000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03272  hypothetical protein  40.28 
 
 
81 aa  60.5  0.000000008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4790  sulfur transfer protein SirA  40.28 
 
 
81 aa  60.5  0.000000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0246  sulfur transfer protein SirA  40.28 
 
 
81 aa  60.5  0.000000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3852  sulfur transfer protein SirA  40.28 
 
 
81 aa  60.5  0.000000008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2214  SirA family protein  36.49 
 
 
75 aa  60.5  0.000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.160562 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3170  SirA family protein  35.14 
 
 
77 aa  59.7  0.00000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.206236 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3129  SirA-like  41.18 
 
 
80 aa  59.7  0.00000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.445608  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1633  sulfur transfer protein SirA  40.85 
 
 
80 aa  59.7  0.00000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.972147 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0125  SirA family protein  34.78 
 
 
78 aa  59.7  0.00000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2324  SirA family protein  33.33 
 
 
77 aa  59.3  0.00000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0434291  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2801  SirA family protein  35.14 
 
 
77 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.205489 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2411  SirA-like protein  35.71 
 
 
83 aa  58.9  0.00000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0015  sulfur transfer protein SirA  35 
 
 
81 aa  58.9  0.00000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0331062  normal  0.432402 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2937  SirA-like  39.13 
 
 
97 aa  59.3  0.00000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2116  sulfur transfer protein SirA  39.44 
 
 
80 aa  58.5  0.00000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.101058 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>