272 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_0092 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012917  PC1_0092  sulfur transfer protein SirA  100 
 
 		 80 aa  166  1e-40  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0087  sulfur transfer protein SirA  97.5 
 
 		 81 aa  163  9e-40  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.253958  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4069  SirA family protein  90 
 
 		 81 aa  148  2e-35  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3877  sulfur transfer protein SirA  87.5 
 
 		 81 aa  148  3e-35  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.899871  normal  0.161761 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3882  SirA family protein  86.25 
 
 		 81 aa  147  6e-35  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0570  sulfur transfer protein SirA  86.25 
 
 		 84 aa  145  2.0000000000000003e-34  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3986  sulfur transfer protein SirA  86.25 
 
 		 84 aa  145  2.0000000000000003e-34  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0232  sulfur transfer protein SirA  86.25 
 
 		 84 aa  145  2.0000000000000003e-34  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3780  hypothetical protein  83.75 
 
 		 111 aa  144  5e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3847  hypothetical protein  83.75 
 
 		 111 aa  144  5e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3890  hypothetical protein  83.75 
 
 		 111 aa  144  5e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3770  hypothetical protein  83.75 
 
 		 111 aa  144  5e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3950  hypothetical protein  83.75 
 
 		 111 aa  144  5e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.785107  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03319  cell developmental protein SirA  81.25 
 
 		 81 aa  139  9.999999999999999e-33  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0245  SirA family protein  81.25 
 
 		 81 aa  139  9.999999999999999e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3669  sulfur transfer protein SirA  81.25 
 
 		 81 aa  139  9.999999999999999e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3852  sulfur transfer protein SirA  81.25 
 
 		 81 aa  139  9.999999999999999e-33  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3952  sulfur transfer protein SirA  81.25 
 
 		 81 aa  139  9.999999999999999e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4790  sulfur transfer protein SirA  81.25 
 
 		 81 aa  139  9.999999999999999e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0246  sulfur transfer protein SirA  81.25 
 
 		 81 aa  139  9.999999999999999e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03272  hypothetical protein  81.25 
 
 		 81 aa  139  9.999999999999999e-33  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3754  sulfur transfer protein SirA  80 
 
 		 81 aa  137  6e-32  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0205  SirA family protein  80 
 
 		 81 aa  135  3.0000000000000003e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.106509 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0011  sulfur transfer protein SirA  72.5 
 
 		 81 aa  127  5.0000000000000004e-29  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.119018  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0017  sulfur transfer protein SirA  71.25 
 
 		 81 aa  124  6e-28  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0103959 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0018  sulfur transfer protein SirA  71.25 
 
 		 81 aa  124  6e-28  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0017  sulfur transfer protein SirA  71.25 
 
 		 81 aa  124  6e-28  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000123371 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0013  sulfur transfer protein SirA  71.25 
 
 		 81 aa  124  6e-28  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000182945 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0013  sulfur transfer protein SirA  71.25 
 
 		 81 aa  124  6e-28  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0557081 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0013  sulfur transfer protein SirA  71.25 
 
 		 81 aa  124  6e-28  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0021  sulfur transfer protein SirA  71.25 
 
 		 81 aa  123  8.000000000000001e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.628095  hitchhiker  0.000000017124 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0019  sulfur transfer protein SirA  71.25 
 
 		 81 aa  122  1e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0020  sulfur transfer protein SirA  68.75 
 
 		 81 aa  123  1e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000878962 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0015  sulfur transfer protein SirA  68.75 
 
 		 81 aa  123  1e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0331062  normal  0.432402 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0029  redox protein regulator of disulfide bond formation  71.25 
 
 		 99 aa  123  1e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0748983  normal  0.0110056 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0013  sulfur transfer protein SirA  70 
 
 		 81 aa  121  4e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000321499  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0017  sulfur transfer protein SirA  67.5 
 
 		 81 aa  119  9.999999999999999e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000196342 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2968  sulfur transfer protein SirA  68.75 
 
 		 83 aa  119  9.999999999999999e-27  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0282279  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0012  sulfur transfer protein SirA  67.5 
 
 		 81 aa  118  3e-26  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0011  sulfur transfer protein SirA  65 
 
 		 81 aa  116  9.999999999999999e-26  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00453  sulfur transfer protein SirA  66.23 
 
 		 82 aa  115  1.9999999999999998e-25  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001993  tRNA 5-methylaminomethyl-2-thiouridine synthase TusA  66.23 
 
 		 82 aa  115  1.9999999999999998e-25  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2495  sulfur transfer protein SirA  63.64 
 
 		 82 aa  108  2.0000000000000002e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0010  sirA protein  59.49 
 
 		 81 aa  105  2e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0225  regulator of information in SirA family protein  64.79 
 
 		 78 aa  105  3e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04046  sirA protein  57.89 
 
 		 86 aa  103  6e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4280  SirA-like  57.69 
 
 		 83 aa  102  1e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.277621  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1572  sulfur transfer protein SirA  59.15 
 
 		 79 aa  102  2e-21  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2411  SirA-like protein  55.71 
 
 		 83 aa  89.4  2e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1905  sulfur transfer protein SirA  53.75 
 
 		 83 aa  88.2  3e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00381161  normal  0.533797 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1633  sulfur transfer protein SirA  56.96 
 
 		 80 aa  86.7  9e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.972147 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3888  sulfur transfer protein SirA  54.93 
 
 		 83 aa  86.3  1e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.420847  normal  0.0778981 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20060  sulfur transfer protein SirA  53.52 
 
 		 85 aa  85.5  2e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1827  sulfur transfer protein SirA  50.62 
 
 		 84 aa  85.9  2e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0248688  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1656  sulfur transfer protein SirA  54.43 
 
 		 80 aa  85.1  3e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.100562  normal  0.450785 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2116  sulfur transfer protein SirA  54.43 
 
 		 80 aa  84.7  4e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.101058 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3625  sulfur transfer protein SirA  54.43 
 
 		 80 aa  84.7  4e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.385858 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3766  sulfur transfer protein SirA  53.16 
 
 		 79 aa  84.3  5e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.769061  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44270  sulfur transfer protein SirA  54.93 
 
 		 79 aa  84.3  5e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2018  SirA protein, putative  52.11 
 
 		 84 aa  82.4  0.000000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0674453  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0059  SirA-like  55.71 
 
 		 86 aa  81.3  0.000000000000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.470716 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0054  hypothetical protein  50 
 
 		 86 aa  80.1  0.000000000000008  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1779  SirA family protein  51.47 
 
 		 81 aa  80.1  0.000000000000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0140  SirA family protein  46.34 
 
 		 97 aa  79.3  0.00000000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1155  regulatory protein, MarR  49.28 
 
 		 82 aa  74.3  0.0000000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.102823 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2236  SirA family protein  48.53 
 
 		 77 aa  71.6  0.000000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.278986  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1458  SirA-like  46.05 
 
 		 78 aa  70.1  0.000000000008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.000274297  normal  0.357093 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2618  SirA-like protein  41.67 
 
 		 80 aa  67  0.00000000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1672  SirA family protein  42.25 
 
 		 76 aa  66.6  0.0000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1694  SirA family protein  36.11 
 
 		 75 aa  64.3  0.0000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.304124  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1937  SirA family protein  37.5 
 
 		 76 aa  63.5  0.0000000009  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.559837  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3957  hypothetical protein  37.35 
 
 		 83 aa  62.8  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1544  SirA-like  37.35 
 
 		 83 aa  63.2  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.409096  normal  0.0539174 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0631  SirA family protein  37.84 
 
 		 76 aa  63.2  0.000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.161479 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51310  hypothetical protein  39.02 
 
 		 83 aa  63.2  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000169267 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2932  SirA family protein  39.13 
 
 		 77 aa  63.2  0.000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2217  hypothetical protein  36 
 
 		 76 aa  62.4  0.000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.403117  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1134  hypothetical protein  38.03 
 
 		 75 aa  61.6  0.000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00450728 
 
 
-
 
NC_004310  BR2034  hypothetical protein  41.79 
 
 		 85 aa  62  0.000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.358481  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3088  SirA-like  36.62 
 
 		 75 aa  61.6  0.000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2575  molybdopterin cofactor biosynthesis MoaC region  35 
 
 		 85 aa  61.6  0.000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2377  SirA-like  38.03 
 
 		 75 aa  61.2  0.000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0972982  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2339  SirA family protein  42.65 
 
 		 75 aa  61.2  0.000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0889916  normal  0.318145 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1254  hypothetical protein  32.43 
 
 		 77 aa  60.8  0.000000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4391  hypothetical protein  39.44 
 
 		 83 aa  60.5  0.000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2791  SirA family protein  36.11 
 
 		 76 aa  59.7  0.00000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.281845  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1085  SirA family protein  40.85 
 
 		 77 aa  58.9  0.00000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35370  SirA-like protein  37.5 
 
 		 83 aa  58.2  0.00000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4189  SirA family protein  34.18 
 
 		 84 aa  58.5  0.00000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.388351  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0794  SirA family protein  32 
 
 		 76 aa  58.5  0.00000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000819157  normal  0.19401 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4162  SirA family protein  34.18 
 
 		 84 aa  58.5  0.00000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1367  SirA-like  37.5 
 
 		 79 aa  58.2  0.00000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.463137  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2132  hypothetical protein  38.89 
 
 		 75 aa  58.2  0.00000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  hitchhiker  0.00495785  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2500  SirA family protein  35.06 
 
 		 213 aa  58.2  0.00000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0807  SirA family protein  38.89 
 
 		 101 aa  58.2  0.00000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.720013  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1412  SirA family protein  34.29 
 
 		 75 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.960057 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1881  SirA family protein  34.29 
 
 		 75 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.045708 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4578  SirA-like protein  34.29 
 
 		 75 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.408362  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3436  SirA family protein  31.65 
 
 		 81 aa  57.8  0.00000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000543679  normal  0.174019 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1434  SirA family protein  34.29 
 
 		 75 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>