254 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_4059 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_4059  hypothetical protein  100 
 
 		 90 aa  181  3e-45  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3601  SirA family protein  59.42 
 
 		 74 aa  97.8  5e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3894  SirA family protein  57.97 
 
 		 74 aa  95.9  1e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.401469  hitchhiker  0.00420681 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3059  SirA-like  61.76 
 
 		 76 aa  95.1  3e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.282994  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2570  SirA family protein  61.19 
 
 		 78 aa  92.8  2e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0845145  normal  0.388571 
 
 
-
 
NC_004310  BR2034  hypothetical protein  59.7 
 
 		 85 aa  89.7  1e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.358481  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0904  SirA family protein  56.52 
 
 		 78 aa  85.1  3e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.849606  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4368  SirA family protein  51.32 
 
 		 82 aa  77  0.00000000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0863  SirA family protein  56.06 
 
 		 88 aa  74.3  0.0000000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.252783  normal  0.310522 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0903  SirA family protein  56.06 
 
 		 94 aa  74.3  0.0000000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0179319  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0717  SirA family protein  49.3 
 
 		 102 aa  73.9  0.0000000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.178055  normal  0.908547 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0807  SirA family protein  50.7 
 
 		 101 aa  73.6  0.0000000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.720013  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2132  hypothetical protein  50.7 
 
 		 75 aa  73.2  0.000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  hitchhiker  0.00495785  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0831  SirA family protein  54.55 
 
 		 93 aa  72.4  0.000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.378872  normal  0.616604 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5387  SirA family protein  59.65 
 
 		 89 aa  70.9  0.000000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.895582  normal  0.53519 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7291  SirA family protein  60.34 
 
 		 87 aa  70.5  0.000000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4174  SirA family protein  53.33 
 
 		 85 aa  69.7  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.197617  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3493  SirA-like  53.33 
 
 		 94 aa  69.3  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.73146  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2429  SirA-like  55.88 
 
 		 91 aa  68.9  0.00000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1873  SirA-like  52.94 
 
 		 82 aa  68.2  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.265759  normal  0.477358 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0090  SirA family protein  46.15 
 
 		 85 aa  67.4  0.00000000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0719339  normal  0.137098 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2558  SirA family protein  50.82 
 
 		 80 aa  67.4  0.00000000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.488236 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5996  SirA family protein  57.14 
 
 		 89 aa  66.6  0.0000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00696256 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0794  SirA family protein  42.03 
 
 		 76 aa  66.2  0.0000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000819157  normal  0.19401 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2339  SirA family protein  47.06 
 
 		 75 aa  65.9  0.0000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0889916  normal  0.318145 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0975  SirA-like protein  50 
 
 		 101 aa  65.1  0.0000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.369067  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2937  SirA-like  45.95 
 
 		 97 aa  65.5  0.0000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3548  SirA family protein  52.78 
 
 		 100 aa  64.7  0.0000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.379024  normal  0.567232 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1458  SirA-like  48.53 
 
 		 78 aa  63.9  0.0000000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.000274297  normal  0.357093 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6347  hypothetical protein  50 
 
 		 71 aa  62.8  0.000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.341476  normal  0.150375 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3129  SirA-like  48.57 
 
 		 80 aa  63.2  0.000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.445608  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1254  hypothetical protein  41.18 
 
 		 77 aa  61.6  0.000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0978  SirA family protein  54.39 
 
 		 80 aa  59.3  0.00000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0114244 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1959  redox protein regulator of disulfide bond formation-like  39.47 
 
 		 103 aa  58.9  0.00000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0000373287  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3688  SirA-like  45.33 
 
 		 80 aa  58.2  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0029  redox protein regulator of disulfide bond formation  38.75 
 
 		 99 aa  58.2  0.00000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0748983  normal  0.0110056 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3614  SirA family protein  38.57 
 
 		 76 aa  56.2  0.0000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000103575 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0436  SirA-like  32.88 
 
 		 75 aa  56.2  0.0000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0013  sulfur transfer protein SirA  41.18 
 
 		 81 aa  56.2  0.0000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000182945 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0013  sulfur transfer protein SirA  41.18 
 
 		 81 aa  56.2  0.0000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0557081 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0020  sulfur transfer protein SirA  38.36 
 
 		 81 aa  55.8  0.0000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000878962 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0018  sulfur transfer protein SirA  39.71 
 
 		 81 aa  56.2  0.0000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2086  SirA family protein  42.03 
 
 		 81 aa  55.8  0.0000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.204116  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0017  sulfur transfer protein SirA  39.71 
 
 		 81 aa  56.2  0.0000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0103959 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0011  sulfur transfer protein SirA  39.71 
 
 		 81 aa  56.2  0.0000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.119018  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0013  sulfur transfer protein SirA  39.71 
 
 		 81 aa  55.5  0.0000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0017  sulfur transfer protein SirA  39.71 
 
 		 81 aa  56.2  0.0000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000123371 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1644  SirA family protein  48.65 
 
 		 100 aa  56.2  0.0000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0021  sulfur transfer protein SirA  41.18 
 
 		 81 aa  56.2  0.0000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.628095  hitchhiker  0.000000017124 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0017  sulfur transfer protein SirA  38.36 
 
 		 81 aa  55.5  0.0000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000196342 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1011  SirA-like  41.18 
 
 		 75 aa  55.1  0.0000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2399  SirA-like  50 
 
 		 74 aa  55.1  0.0000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.433209  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0093  SirA-like protein  46.3 
 
 		 82 aa  55.1  0.0000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1085  SirA family protein  49.09 
 
 		 77 aa  55.1  0.0000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1298  SirA family protein  43.08 
 
 		 75 aa  54.7  0.0000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1937  SirA family protein  37.14 
 
 		 76 aa  54.7  0.0000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.559837  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3746  SirA family protein  39.71 
 
 		 74 aa  54.7  0.0000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00371656  unclonable  0.000000591857 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3986  sulfur transfer protein SirA  35.53 
 
 		 84 aa  54.3  0.0000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1134  hypothetical protein  40 
 
 		 75 aa  54.3  0.0000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00450728 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0232  sulfur transfer protein SirA  35.53 
 
 		 84 aa  54.3  0.0000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0570  sulfur transfer protein SirA  35.53 
 
 		 84 aa  54.3  0.0000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0019  sulfur transfer protein SirA  39.71 
 
 		 81 aa  54.3  0.0000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3088  SirA-like  42.86 
 
 		 75 aa  54.3  0.0000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0940  hypothetical protein  36.11 
 
 		 75 aa  53.9  0.0000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000000596514  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1201  SirA family protein  46.3 
 
 		 92 aa  53.9  0.0000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1218  SirA family protein  37.88 
 
 		 77 aa  53.9  0.0000007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0330  SirA family protein  36.23 
 
 		 80 aa  53.9  0.0000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0013  sulfur transfer protein SirA  35.53 
 
 		 81 aa  53.9  0.0000008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000321499  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3877  sulfur transfer protein SirA  36.11 
 
 		 81 aa  53.5  0.0000009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.899871  normal  0.161761 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1310  SirA family protein  41.18 
 
 		 70 aa  53.5  0.0000009  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2968  sulfur transfer protein SirA  39.13 
 
 		 83 aa  53.5  0.0000009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0282279  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1366  SirA family protein  41.18 
 
 		 70 aa  53.1  0.000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0026  SirA family protein  35.29 
 
 		 78 aa  53.1  0.000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000175689  normal  0.0503522 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4069  SirA family protein  35.62 
 
 		 81 aa  53.1  0.000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1672  SirA family protein  36.76 
 
 		 76 aa  53.5  0.000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0125  SirA family protein  38.24 
 
 		 78 aa  53.5  0.000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1694  SirA family protein  39.39 
 
 		 75 aa  53.5  0.000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.304124  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0087  sulfur transfer protein SirA  36.11 
 
 		 81 aa  53.1  0.000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.253958  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4504  hypothetical protein  31.94 
 
 		 76 aa  52.4  0.000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000117975 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0574  hypothetical protein  35.29 
 
 		 75 aa  52  0.000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000789219  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2324  SirA family protein  33.82 
 
 		 77 aa  52.4  0.000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0434291  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0939  hypothetical protein  34.25 
 
 		 75 aa  52.8  0.000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000269274  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0015  sulfur transfer protein SirA  36.76 
 
 		 81 aa  52.4  0.000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0331062  normal  0.432402 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3882  SirA family protein  34.21 
 
 		 81 aa  52.8  0.000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0092  sulfur transfer protein SirA  35.62 
 
 		 80 aa  52.8  0.000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0631  SirA family protein  35.29 
 
 		 76 aa  52.4  0.000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.161479 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0011  sulfur transfer protein SirA  35.53 
 
 		 81 aa  52.4  0.000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0643  SirA family protein  38.24 
 
 		 70 aa  52  0.000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0861  SirA-like  42.62 
 
 		 75 aa  52  0.000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001993  tRNA 5-methylaminomethyl-2-thiouridine synthase TusA  35.29 
 
 		 82 aa  51.6  0.000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3780  hypothetical protein  36.11 
 
 		 111 aa  51.2  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3770  hypothetical protein  36.11 
 
 		 111 aa  51.2  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3847  hypothetical protein  36.11 
 
 		 111 aa  51.2  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3890  hypothetical protein  36.11 
 
 		 111 aa  51.2  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3950  hypothetical protein  36.11 
 
 		 111 aa  51.2  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.785107  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1860  SirA family protein  32.35 
 
 		 78 aa  51.2  0.000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000771633  normal  0.0684437 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2384  SirA family protein  40 
 
 		 75 aa  51.6  0.000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.21335  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00453  sulfur transfer protein SirA  35.29 
 
 		 82 aa  51.2  0.000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2187  SirA family protein  35.62 
 
 		 76 aa  51.6  0.000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0108315  hitchhiker  0.000000214154 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2898  SirA family protein  40 
 
 		 75 aa  51.6  0.000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>