298 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_2132 on replicon NC_007493
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009049  Rsph17029_0807  SirA family protein  100 
 
 		 101 aa  152  2e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.720013  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2132  hypothetical protein  100 
 
 		 75 aa  151  2.9999999999999998e-36  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  hitchhiker  0.00495785  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0717  SirA family protein  88 
 
 		 102 aa  140  6e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.178055  normal  0.908547 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1458  SirA-like  58.11 
 
 		 78 aa  93.2  9e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.000274297  normal  0.357093 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3601  SirA family protein  50 
 
 		 74 aa  80.5  0.000000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1672  SirA family protein  44.59 
 
 		 76 aa  80.5  0.000000000000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR2034  hypothetical protein  55.22 
 
 		 85 aa  78.6  0.00000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.358481  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3894  SirA family protein  50.75 
 
 		 74 aa  79  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.401469  hitchhiker  0.00420681 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0631  SirA family protein  45.21 
 
 		 76 aa  78.6  0.00000000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.161479 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2217  hypothetical protein  43.24 
 
 		 76 aa  77.4  0.00000000000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.403117  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0093  SirA-like protein  48.72 
 
 		 82 aa  77.4  0.00000000000007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3088  SirA-like  45.95 
 
 		 75 aa  75.9  0.0000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1011  SirA-like  43.24 
 
 		 75 aa  75.5  0.0000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2558  SirA family protein  55.56 
 
 		 80 aa  75.1  0.0000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.488236 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0574  hypothetical protein  41.89 
 
 		 75 aa  74.7  0.0000000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000789219  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2399  SirA-like  50.7 
 
 		 74 aa  75.1  0.0000000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.433209  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0794  SirA family protein  42.47 
 
 		 76 aa  74.3  0.0000000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000819157  normal  0.19401 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0330  SirA family protein  42.67 
 
 		 80 aa  73.6  0.0000000000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4059  hypothetical protein  50.7 
 
 		 90 aa  73.2  0.000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2339  SirA family protein  48 
 
 		 75 aa  73.6  0.000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0889916  normal  0.318145 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1937  SirA family protein  45.21 
 
 		 76 aa  72.8  0.000000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.559837  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0863  SirA family protein  52.86 
 
 		 88 aa  71.6  0.000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.252783  normal  0.310522 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0903  SirA family protein  52.86 
 
 		 94 aa  72  0.000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0179319  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1134  hypothetical protein  45.33 
 
 		 75 aa  71.6  0.000000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00450728 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2088  hypothetical protein  41.1 
 
 		 76 aa  71.2  0.000000000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0107447  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0831  SirA family protein  51.43 
 
 		 93 aa  70.9  0.000000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.378872  normal  0.616604 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1779  SirA family protein  45.21 
 
 		 81 aa  68.9  0.00000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1644  SirA family protein  60.87 
 
 		 100 aa  68.9  0.00000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2570  SirA family protein  44.78 
 
 		 78 aa  68.6  0.00000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0845145  normal  0.388571 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0861  SirA-like  45.95 
 
 		 75 aa  68.2  0.00000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1254  hypothetical protein  41.43 
 
 		 77 aa  68.2  0.00000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0904  SirA family protein  46.27 
 
 		 78 aa  67.8  0.00000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.849606  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0810  hypothetical protein  41.89 
 
 		 75 aa  67  0.00000000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.566586 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3059  SirA-like  46.48 
 
 		 76 aa  67  0.00000000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.282994  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5996  SirA family protein  51.43 
 
 		 89 aa  67  0.00000000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00696256 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1085  SirA family protein  38.03 
 
 		 77 aa  67  0.00000000008  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2377  SirA-like  40.54 
 
 		 75 aa  66.2  0.0000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0972982  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1718  SirA family protein  38.89 
 
 		 81 aa  66.2  0.0000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1298  SirA family protein  37.84 
 
 		 75 aa  65.9  0.0000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0811  SirA-like protein  43.24 
 
 		 75 aa  65.5  0.0000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0842772 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3746  SirA family protein  39.44 
 
 		 74 aa  65.9  0.0000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00371656  unclonable  0.000000591857 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1353  SirA family protein  39.19 
 
 		 75 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.563442  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4506  rhodanese domain protein  32.43 
 
 		 186 aa  65.1  0.0000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000693639 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1412  SirA family protein  39.19 
 
 		 75 aa  65.5  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.960057 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4578  SirA-like protein  39.19 
 
 		 75 aa  65.5  0.0000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.408362  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2791  SirA family protein  45.76 
 
 		 76 aa  65.1  0.0000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.281845  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1881  SirA family protein  39.19 
 
 		 75 aa  65.5  0.0000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.045708 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0952  SirA-like  39.19 
 
 		 75 aa  65.5  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.872302  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1314  SirA family protein  39.19 
 
 		 75 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1434  SirA family protein  39.19 
 
 		 75 aa  65.5  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0756  SirA family protein  40.54 
 
 		 75 aa  64.7  0.0000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0477358 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1989  SirA family protein  39.19 
 
 		 75 aa  64.7  0.0000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000867317 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0826  SirA family protein  40.54 
 
 		 75 aa  64.7  0.0000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.24854 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2429  SirA-like  46.38 
 
 		 91 aa  63.9  0.0000000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0033  hypothetical protein  39.13 
 
 		 78 aa  63.5  0.0000000009  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00000671264  normal  0.064173 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1436  SirA family protein  37.5 
 
 		 81 aa  63.5  0.000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.324916  normal  0.46012 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3724  SirA-like  36.49 
 
 		 75 aa  62.8  0.000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.893626 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2214  SirA family protein  37.84 
 
 		 75 aa  63.5  0.000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.160562 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2898  SirA family protein  37.84 
 
 		 75 aa  62.4  0.000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4174  SirA family protein  47.06 
 
 		 85 aa  62.8  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.197617  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2384  SirA family protein  37.84 
 
 		 75 aa  62.4  0.000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.21335  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1905  SirA family protein  46.77 
 
 		 76 aa  62.4  0.000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.00000195023  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1860  SirA family protein  36.23 
 
 		 78 aa  61.6  0.000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000771633  normal  0.0684437 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2324  SirA family protein  36.23 
 
 		 77 aa  62  0.000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0434291  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1201  SirA family protein  45.83 
 
 		 92 aa  61.6  0.000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1333  hypothetical protein  35.14 
 
 		 77 aa  61.6  0.000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0937  rhodanese domain protein  31.08 
 
 		 186 aa  61.6  0.000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000726035  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3614  SirA family protein  42.67 
 
 		 76 aa  61.6  0.000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000103575 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0672  hypothetical protein  32.43 
 
 		 186 aa  61.6  0.000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00074605  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2937  SirA-like  42.03 
 
 		 97 aa  61.2  0.000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0830  rhodanese domain protein  31.08 
 
 		 186 aa  61.6  0.000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00233764  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0125  SirA family protein  36.23 
 
 		 78 aa  61.6  0.000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7291  SirA family protein  46.48 
 
 		 87 aa  60.8  0.000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0975  SirA-like protein  42.03 
 
 		 101 aa  61.2  0.000000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.369067  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0686  SirA family protein  32.31 
 
 		 194 aa  61.2  0.000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0090  SirA family protein  45.59 
 
 		 85 aa  61.2  0.000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0719339  normal  0.137098 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0870  rhodanese domain protein  31.08 
 
 		 186 aa  60.8  0.000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000347313 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0686  hypothetical protein  31.08 
 
 		 186 aa  60.8  0.000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.745505  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3170  SirA family protein  35.14 
 
 		 77 aa  60.8  0.000000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.206236 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03319  cell developmental protein SirA  40.28 
 
 		 81 aa  60.8  0.000000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0245  SirA family protein  40.28 
 
 		 81 aa  60.8  0.000000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03272  hypothetical protein  40.28 
 
 		 81 aa  60.8  0.000000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0940  hypothetical protein  36.49 
 
 		 75 aa  60.5  0.000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000000596514  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3548  SirA family protein  46.38 
 
 		 100 aa  60.5  0.000000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.379024  normal  0.567232 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3852  sulfur transfer protein SirA  40.28 
 
 		 81 aa  60.8  0.000000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3952  sulfur transfer protein SirA  40.28 
 
 		 81 aa  60.8  0.000000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3669  sulfur transfer protein SirA  40.28 
 
 		 81 aa  60.8  0.000000007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4790  sulfur transfer protein SirA  40.28 
 
 		 81 aa  60.8  0.000000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0246  sulfur transfer protein SirA  40.28 
 
 		 81 aa  60.8  0.000000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5387  SirA family protein  45.59 
 
 		 89 aa  60.5  0.000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.895582  normal  0.53519 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1905  sulfur transfer protein SirA  37.84 
 
 		 83 aa  60.5  0.000000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00381161  normal  0.533797 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1684  hypothetical protein  40 
 
 		 76 aa  60.1  0.000000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.109756  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0920  hypothetical protein  40 
 
 		 76 aa  60.1  0.000000009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0734  hypothetical protein  40 
 
 		 76 aa  60.1  0.000000009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1453  hypothetical protein  40 
 
 		 76 aa  60.1  0.000000009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1839  hypothetical protein  40 
 
 		 76 aa  60.1  0.000000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0429  hypothetical protein  40 
 
 		 76 aa  60.1  0.000000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0594568  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0038  SirA family protein  32.35 
 
 		 78 aa  60.1  0.000000009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  unclonable  0.00000000000000689982  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2640  hypothetical protein  40 
 
 		 76 aa  60.1  0.000000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0863392  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1662  hypothetical protein  40 
 
 		 76 aa  60.1  0.000000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0398143  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>