276 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_1905 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_1905  sulfur transfer protein SirA  100 
 
 		 83 aa  173  6e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00381161  normal  0.533797 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44270  sulfur transfer protein SirA  84.81 
 
 		 79 aa  144  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3766  sulfur transfer protein SirA  89.19 
 
 		 79 aa  143  9e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.769061  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20060  sulfur transfer protein SirA  81.01 
 
 		 85 aa  137  6e-32  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3888  sulfur transfer protein SirA  78.05 
 
 		 83 aa  136  1e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.420847  normal  0.0778981 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1633  sulfur transfer protein SirA  83.78 
 
 		 80 aa  133  9e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.972147 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2116  sulfur transfer protein SirA  81.08 
 
 		 80 aa  130  6e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.101058 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3625  sulfur transfer protein SirA  81.08 
 
 		 80 aa  130  6e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.385858 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1656  sulfur transfer protein SirA  81.08 
 
 		 80 aa  130  7.999999999999999e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.100562  normal  0.450785 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1827  sulfur transfer protein SirA  75 
 
 		 84 aa  129  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0248688  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2018  SirA protein, putative  72.62 
 
 		 84 aa  129  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0674453  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2236  SirA family protein  64 
 
 		 77 aa  104  3e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.278986  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2411  SirA-like protein  62.86 
 
 		 83 aa  103  7e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1779  SirA family protein  64.71 
 
 		 81 aa  101  3e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1155  regulatory protein, MarR  64.71 
 
 		 82 aa  98.6  3e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.102823 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0092  sulfur transfer protein SirA  53.75 
 
 		 80 aa  88.2  3e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4069  SirA family protein  53.33 
 
 		 81 aa  85.1  3e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0087  sulfur transfer protein SirA  54.93 
 
 		 81 aa  84.7  3e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.253958  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3877  sulfur transfer protein SirA  53.42 
 
 		 81 aa  84  7e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.899871  normal  0.161761 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0232  sulfur transfer protein SirA  53.42 
 
 		 84 aa  83.2  0.000000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0570  sulfur transfer protein SirA  53.42 
 
 		 84 aa  83.2  0.000000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3986  sulfur transfer protein SirA  53.42 
 
 		 84 aa  83.2  0.000000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03319  cell developmental protein SirA  53.52 
 
 		 81 aa  82  0.000000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0245  SirA family protein  53.52 
 
 		 81 aa  82  0.000000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3952  sulfur transfer protein SirA  53.52 
 
 		 81 aa  82  0.000000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3852  sulfur transfer protein SirA  53.52 
 
 		 81 aa  82  0.000000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0246  sulfur transfer protein SirA  53.52 
 
 		 81 aa  82  0.000000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03272  hypothetical protein  53.52 
 
 		 81 aa  82  0.000000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3669  sulfur transfer protein SirA  53.52 
 
 		 81 aa  82  0.000000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3754  sulfur transfer protein SirA  52.05 
 
 		 81 aa  82.4  0.000000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4790  sulfur transfer protein SirA  53.52 
 
 		 81 aa  82  0.000000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3882  SirA family protein  52.05 
 
 		 81 aa  81.6  0.000000000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3770  hypothetical protein  53.52 
 
 		 111 aa  81.6  0.000000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3950  hypothetical protein  53.52 
 
 		 111 aa  81.6  0.000000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.785107  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3847  hypothetical protein  53.52 
 
 		 111 aa  81.6  0.000000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3890  hypothetical protein  53.52 
 
 		 111 aa  81.6  0.000000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3780  hypothetical protein  53.52 
 
 		 111 aa  81.6  0.000000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0059  SirA-like  48.1 
 
 		 86 aa  79.7  0.00000000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.470716 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1233  SirA family protein  49.33 
 
 		 79 aa  79  0.00000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0017  sulfur transfer protein SirA  52.94 
 
 		 81 aa  79.3  0.00000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000196342 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1263  SirA family protein  49.33 
 
 		 79 aa  79  0.00000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.600838  normal  0.692978 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0140  SirA family protein  47.5 
 
 		 97 aa  79.3  0.00000000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4185  SirA family protein  49.33 
 
 		 79 aa  78.6  0.00000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.312975  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2968  sulfur transfer protein SirA  45.57 
 
 		 83 aa  78.6  0.00000000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0282279  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0054  hypothetical protein  48.72 
 
 		 86 aa  78.2  0.00000000000004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0015  sulfur transfer protein SirA  51.47 
 
 		 81 aa  78.2  0.00000000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0331062  normal  0.432402 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0205  SirA family protein  50.7 
 
 		 81 aa  77.8  0.00000000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.106509 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0020  sulfur transfer protein SirA  51.47 
 
 		 81 aa  77.8  0.00000000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000878962 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0225  regulator of information in SirA family protein  52.86 
 
 		 78 aa  77.8  0.00000000000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001993  tRNA 5-methylaminomethyl-2-thiouridine synthase TusA  50 
 
 		 82 aa  77.4  0.00000000000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0012  sulfur transfer protein SirA  51.47 
 
 		 81 aa  77.4  0.00000000000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0011  sulfur transfer protein SirA  46.25 
 
 		 81 aa  77  0.00000000000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.119018  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0017  sulfur transfer protein SirA  50 
 
 		 81 aa  76.6  0.0000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000123371 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4391  hypothetical protein  45 
 
 		 83 aa  76.3  0.0000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0017  sulfur transfer protein SirA  50 
 
 		 81 aa  76.6  0.0000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0103959 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0018  sulfur transfer protein SirA  50 
 
 		 81 aa  76.6  0.0000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0013  sulfur transfer protein SirA  50 
 
 		 81 aa  76.6  0.0000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000182945 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0013  sulfur transfer protein SirA  50 
 
 		 81 aa  76.6  0.0000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0557081 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0021  sulfur transfer protein SirA  50 
 
 		 81 aa  76.3  0.0000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.628095  hitchhiker  0.000000017124 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0010  sirA protein  43.75 
 
 		 81 aa  75.9  0.0000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0019  sulfur transfer protein SirA  50 
 
 		 81 aa  75.9  0.0000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04046  sirA protein  52.94 
 
 		 86 aa  75.5  0.0000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1572  sulfur transfer protein SirA  47.06 
 
 		 79 aa  75.9  0.0000000000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0013  sulfur transfer protein SirA  50 
 
 		 81 aa  75.9  0.0000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3979  SirA family protein  49.3 
 
 		 79 aa  75.1  0.0000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00453  sulfur transfer protein SirA  48.53 
 
 		 82 aa  75.1  0.0000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2495  sulfur transfer protein SirA  51.47 
 
 		 82 aa  75.1  0.0000000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0029  redox protein regulator of disulfide bond formation  50.7 
 
 		 99 aa  75.5  0.0000000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0748983  normal  0.0110056 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51310  hypothetical protein  48.61 
 
 		 83 aa  74.7  0.0000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000169267 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1085  SirA family protein  41.56 
 
 		 77 aa  73.9  0.0000000000008  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0013  sulfur transfer protein SirA  48.53 
 
 		 81 aa  73.9  0.0000000000008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000321499  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1367  SirA-like  45.33 
 
 		 79 aa  73.2  0.000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.463137  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4280  SirA-like  49.32 
 
 		 83 aa  73.2  0.000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.277621  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0011  sulfur transfer protein SirA  50 
 
 		 81 aa  73.2  0.000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3957  hypothetical protein  47.89 
 
 		 83 aa  72.4  0.000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1544  SirA-like  47.89 
 
 		 83 aa  72  0.000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.409096  normal  0.0539174 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1458  SirA-like  45.21 
 
 		 78 aa  70.5  0.000000000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.000274297  normal  0.357093 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1937  SirA family protein  43.66 
 
 		 76 aa  68.9  0.00000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.559837  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1672  SirA family protein  40.79 
 
 		 76 aa  68.9  0.00000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0574  hypothetical protein  37.33 
 
 		 75 aa  67.4  0.00000000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000789219  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0810  hypothetical protein  39.13 
 
 		 75 aa  67  0.00000000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.566586 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1134  hypothetical protein  40.58 
 
 		 75 aa  66.2  0.0000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00450728 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2187  SirA family protein  39.19 
 
 		 76 aa  65.5  0.0000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0108315  hitchhiker  0.000000214154 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2557  hypothetical protein  39.19 
 
 		 76 aa  65.5  0.0000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  decreased coverage  0.00791893  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0811  SirA-like protein  39.13 
 
 		 75 aa  65.9  0.0000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0842772 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0861  SirA-like  39.13 
 
 		 75 aa  65.5  0.0000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2642  SirA family protein  36.59 
 
 		 201 aa  65.1  0.0000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.140879  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2399  SirA-like  43.66 
 
 		 74 aa  64.7  0.0000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.433209  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2217  hypothetical protein  41.1 
 
 		 76 aa  64.7  0.0000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.403117  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4578  SirA-like protein  36.23 
 
 		 75 aa  64.3  0.0000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.408362  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1659  SirA family protein  43.66 
 
 		 79 aa  64.3  0.0000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.995311  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1881  SirA family protein  36.23 
 
 		 75 aa  64.3  0.0000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.045708 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0952  SirA-like  36.23 
 
 		 75 aa  64.3  0.0000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.872302  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2890  SirA family protein  39.19 
 
 		 189 aa  64.3  0.0000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1434  SirA family protein  36.23 
 
 		 75 aa  64.3  0.0000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0756  SirA family protein  37.68 
 
 		 75 aa  64.3  0.0000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0477358 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1412  SirA family protein  36.23 
 
 		 75 aa  64.3  0.0000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.960057 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0826  SirA family protein  37.68 
 
 		 75 aa  64.3  0.0000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.24854 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1982  hypothetical protein  41.18 
 
 		 79 aa  63.9  0.0000000008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.948606  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3746  SirA family protein  38.03 
 
 		 74 aa  63.5  0.0000000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00371656  unclonable  0.000000591857 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>