More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd1591_4069 on replicon NC_012912
Organism: Dickeya zeae Ech1591



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012912  Dd1591_4069  SirA family protein  100 
 
 
81 aa  169  1e-41  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3882  SirA family protein  90.12 
 
 
81 aa  153  6e-37  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0092  sulfur transfer protein SirA  90 
 
 
80 aa  148  2e-35  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3877  sulfur transfer protein SirA  85.19 
 
 
81 aa  147  4e-35  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.899871  normal  0.161761 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0087  sulfur transfer protein SirA  90 
 
 
81 aa  147  5e-35  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.253958  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0232  sulfur transfer protein SirA  86.25 
 
 
84 aa  146  1.0000000000000001e-34  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3986  sulfur transfer protein SirA  86.25 
 
 
84 aa  146  1.0000000000000001e-34  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0570  sulfur transfer protein SirA  86.25 
 
 
84 aa  146  1.0000000000000001e-34  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3847  hypothetical protein  81.25 
 
 
111 aa  141  3e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3890  hypothetical protein  81.25 
 
 
111 aa  141  3e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3950  hypothetical protein  81.25 
 
 
111 aa  141  3e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.785107  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3770  hypothetical protein  81.25 
 
 
111 aa  141  3e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3780  hypothetical protein  81.25 
 
 
111 aa  141  3e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03319  cell developmental protein SirA  77.78 
 
 
81 aa  137  4.999999999999999e-32  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0245  SirA family protein  77.78 
 
 
81 aa  137  4.999999999999999e-32  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03272  hypothetical protein  77.78 
 
 
81 aa  137  4.999999999999999e-32  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3852  sulfur transfer protein SirA  77.78 
 
 
81 aa  137  4.999999999999999e-32  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3952  sulfur transfer protein SirA  77.78 
 
 
81 aa  137  4.999999999999999e-32  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3669  sulfur transfer protein SirA  77.78 
 
 
81 aa  137  4.999999999999999e-32  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0246  sulfur transfer protein SirA  77.78 
 
 
81 aa  137  4.999999999999999e-32  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4790  sulfur transfer protein SirA  77.78 
 
 
81 aa  137  4.999999999999999e-32  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0205  SirA family protein  79.01 
 
 
81 aa  137  7e-32  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.106509 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3754  sulfur transfer protein SirA  76.54 
 
 
81 aa  135  2e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0011  sulfur transfer protein SirA  70 
 
 
81 aa  125  1.0000000000000001e-28  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.119018  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0013  sulfur transfer protein SirA  70 
 
 
81 aa  125  2.0000000000000002e-28  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000321499  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0013  sulfur transfer protein SirA  68.75 
 
 
81 aa  124  4.0000000000000003e-28  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000182945 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0013  sulfur transfer protein SirA  68.75 
 
 
81 aa  124  4.0000000000000003e-28  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0557081 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0021  sulfur transfer protein SirA  68.75 
 
 
81 aa  124  4.0000000000000003e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.628095  hitchhiker  0.000000017124 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0019  sulfur transfer protein SirA  68.75 
 
 
81 aa  123  8.000000000000001e-28  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0029  redox protein regulator of disulfide bond formation  71.25 
 
 
99 aa  123  8.000000000000001e-28  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0748983  normal  0.0110056 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0017  sulfur transfer protein SirA  68.75 
 
 
81 aa  122  2e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000123371 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0017  sulfur transfer protein SirA  68.75 
 
 
81 aa  122  2e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0103959 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0018  sulfur transfer protein SirA  68.75 
 
 
81 aa  122  2e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0015  sulfur transfer protein SirA  68.75 
 
 
81 aa  122  2e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0331062  normal  0.432402 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0013  sulfur transfer protein SirA  68.75 
 
 
81 aa  121  3e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0017  sulfur transfer protein SirA  67.5 
 
 
81 aa  121  4e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000196342 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0012  sulfur transfer protein SirA  67.5 
 
 
81 aa  121  4e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0020  sulfur transfer protein SirA  67.5 
 
 
81 aa  120  5e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000878962 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0011  sulfur transfer protein SirA  65 
 
 
81 aa  119  1.9999999999999998e-26  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2968  sulfur transfer protein SirA  67.5 
 
 
83 aa  117  4.9999999999999996e-26  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0282279  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001993  tRNA 5-methylaminomethyl-2-thiouridine synthase TusA  63.64 
 
 
82 aa  111  3e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0010  sirA protein  60.76 
 
 
81 aa  110  7.000000000000001e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00453  sulfur transfer protein SirA  62.34 
 
 
82 aa  110  9e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2495  sulfur transfer protein SirA  62.34 
 
 
82 aa  108  2.0000000000000002e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4280  SirA-like  58.97 
 
 
83 aa  106  1e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.277621  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0225  regulator of information in SirA family protein  63.89 
 
 
78 aa  105  2e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1572  sulfur transfer protein SirA  56.25 
 
 
79 aa  103  5e-22  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04046  sirA protein  55.13 
 
 
86 aa  102  2e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0054  hypothetical protein  51.28 
 
 
86 aa  88.6  3e-17  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0059  SirA-like  55.41 
 
 
86 aa  88.6  3e-17  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.470716 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2411  SirA-like protein  54.29 
 
 
83 aa  87  8e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1633  sulfur transfer protein SirA  53.09 
 
 
80 aa  85.9  2e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.972147 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0140  SirA family protein  48.78 
 
 
97 aa  85.9  2e-16  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1905  sulfur transfer protein SirA  53.33 
 
 
83 aa  85.1  3e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00381161  normal  0.533797 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1656  sulfur transfer protein SirA  50.62 
 
 
80 aa  84.7  4e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.100562  normal  0.450785 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2116  sulfur transfer protein SirA  50.62 
 
 
80 aa  84.3  5e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.101058 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3625  sulfur transfer protein SirA  50.62 
 
 
80 aa  84.3  5e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.385858 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3888  sulfur transfer protein SirA  48.75 
 
 
83 aa  82.8  0.000000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.420847  normal  0.0778981 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20060  sulfur transfer protein SirA  52.11 
 
 
85 aa  81.6  0.000000000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44270  sulfur transfer protein SirA  52.05 
 
 
79 aa  80.5  0.000000000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1779  SirA family protein  50 
 
 
81 aa  80.1  0.000000000000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3766  sulfur transfer protein SirA  52.05 
 
 
79 aa  80.1  0.00000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.769061  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1827  sulfur transfer protein SirA  49.32 
 
 
84 aa  79  0.00000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0248688  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2018  SirA protein, putative  47.95 
 
 
84 aa  77.8  0.00000000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0674453  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1155  regulatory protein, MarR  47.89 
 
 
82 aa  76.6  0.0000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.102823 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2236  SirA family protein  47.06 
 
 
77 aa  71.2  0.000000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.278986  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1672  SirA family protein  42.25 
 
 
76 aa  71.2  0.000000000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1458  SirA-like  46.91 
 
 
78 aa  69.7  0.00000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.000274297  normal  0.357093 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2618  SirA-like protein  43.06 
 
 
80 aa  69.3  0.00000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0631  SirA family protein  39.19 
 
 
76 aa  67.8  0.00000000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.161479 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2217  hypothetical protein  37.33 
 
 
76 aa  67  0.00000000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.403117  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1937  SirA family protein  37.33 
 
 
76 aa  66.2  0.0000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.559837  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2932  SirA family protein  39.13 
 
 
77 aa  64.3  0.0000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1694  SirA family protein  35.62 
 
 
75 aa  63.9  0.0000000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.304124  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3088  SirA-like  36.62 
 
 
75 aa  63.5  0.000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2339  SirA family protein  44.12 
 
 
75 aa  63.2  0.000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0889916  normal  0.318145 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1134  hypothetical protein  38.03 
 
 
75 aa  63.2  0.000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00450728 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3957  hypothetical protein  37.35 
 
 
83 aa  62  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1544  SirA-like  37.35 
 
 
83 aa  62.4  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.409096  normal  0.0539174 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1254  hypothetical protein  31.43 
 
 
77 aa  62.4  0.000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1085  SirA family protein  40.85 
 
 
77 aa  62.4  0.000000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2575  molybdopterin cofactor biosynthesis MoaC region  35 
 
 
85 aa  62  0.000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1881  SirA family protein  35.29 
 
 
75 aa  61.6  0.000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.045708 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4578  SirA-like protein  35.29 
 
 
75 aa  61.6  0.000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.408362  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0952  SirA-like  35.29 
 
 
75 aa  61.6  0.000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.872302  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1412  SirA family protein  35.29 
 
 
75 aa  61.6  0.000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.960057 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1434  SirA family protein  35.29 
 
 
75 aa  61.6  0.000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2377  SirA-like  36.62 
 
 
75 aa  61.2  0.000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0972982  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1353  SirA family protein  35.29 
 
 
75 aa  60.5  0.000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.563442  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1314  SirA family protein  35.29 
 
 
75 aa  60.5  0.000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0574  hypothetical protein  31.51 
 
 
75 aa  60.5  0.000000008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000789219  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51310  hypothetical protein  37.8 
 
 
83 aa  60.1  0.000000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000169267 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2791  SirA family protein  34.72 
 
 
76 aa  60.1  0.00000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.281845  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1233  SirA family protein  37.5 
 
 
79 aa  58.9  0.00000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0810  hypothetical protein  33.82 
 
 
75 aa  59.3  0.00000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.566586 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1263  SirA family protein  37.5 
 
 
79 aa  58.9  0.00000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.600838  normal  0.692978 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4391  hypothetical protein  38.03 
 
 
83 aa  58.5  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4185  SirA family protein  37.5 
 
 
79 aa  58.5  0.00000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.312975  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0967  SirA family protein  34.78 
 
 
72 aa  58.5  0.00000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.500955  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1298  SirA family protein  33.8 
 
 
75 aa  58.5  0.00000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>