271 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_2558 on replicon NC_008686
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008686  Pden_2558  SirA family protein  100 
 
 		 80 aa  159  1e-38  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.488236 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2339  SirA family protein  55.71 
 
 		 75 aa  84  7e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0889916  normal  0.318145 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1458  SirA-like  54.17 
 
 		 78 aa  78.6  0.00000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.000274297  normal  0.357093 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2399  SirA-like  56.52 
 
 		 74 aa  77.4  0.00000000000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.433209  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2132  hypothetical protein  55.56 
 
 		 75 aa  75.1  0.0000000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  hitchhiker  0.00495785  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0807  SirA family protein  55.56 
 
 		 101 aa  75.1  0.0000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.720013  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3059  SirA-like  49.28 
 
 		 76 aa  74.3  0.0000000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.282994  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3601  SirA family protein  46.38 
 
 		 74 aa  72  0.000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3894  SirA family protein  45.59 
 
 		 74 aa  69.7  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.401469  hitchhiker  0.00420681 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0717  SirA family protein  46.48 
 
 		 102 aa  70.1  0.00000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.178055  normal  0.908547 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2570  SirA family protein  47.62 
 
 		 78 aa  69.3  0.00000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0845145  normal  0.388571 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4059  hypothetical protein  50.82 
 
 		 90 aa  67.4  0.00000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5996  SirA family protein  56.9 
 
 		 89 aa  65.1  0.0000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00696256 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1254  hypothetical protein  40.58 
 
 		 77 aa  64.7  0.0000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0794  SirA family protein  38.81 
 
 		 76 aa  64.3  0.0000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000819157  normal  0.19401 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2791  SirA family protein  40 
 
 		 76 aa  63.5  0.0000000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.281845  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0904  SirA family protein  50 
 
 		 78 aa  62.4  0.000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.849606  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0436  SirA-like  36.23 
 
 		 75 aa  62.4  0.000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4368  SirA family protein  46.48 
 
 		 82 aa  61.6  0.000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR2034  hypothetical protein  50 
 
 		 85 aa  61.6  0.000000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.358481  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1011  SirA-like  41.43 
 
 		 75 aa  61.6  0.000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7291  SirA family protein  46.48 
 
 		 87 aa  60.5  0.000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1201  SirA family protein  43.66 
 
 		 92 aa  59.7  0.00000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2217  hypothetical protein  39.44 
 
 		 76 aa  59.7  0.00000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.403117  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2705  SirA family protein  45.07 
 
 		 81 aa  60.1  0.00000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0574  hypothetical protein  38.57 
 
 		 75 aa  59.7  0.00000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000789219  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1779  SirA family protein  39.73 
 
 		 81 aa  58.9  0.00000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0090  SirA family protein  42.31 
 
 		 85 aa  58.5  0.00000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0719339  normal  0.137098 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0330  SirA family protein  39.44 
 
 		 80 aa  58.2  0.00000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2088  hypothetical protein  42.25 
 
 		 76 aa  58.2  0.00000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0107447  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0631  SirA family protein  38.57 
 
 		 76 aa  58.2  0.00000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.161479 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0017  sulfur transfer protein SirA  37.5 
 
 		 81 aa  57.8  0.00000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000196342 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1672  SirA family protein  34.72 
 
 		 76 aa  57.4  0.00000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0861  SirA-like  42.37 
 
 		 75 aa  57  0.00000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3614  SirA family protein  40 
 
 		 76 aa  57  0.00000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000103575 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0810  hypothetical protein  41.43 
 
 		 75 aa  57  0.00000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.566586 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0831  SirA family protein  43.06 
 
 		 93 aa  56.2  0.0000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.378872  normal  0.616604 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1455  SirA family protein  42.25 
 
 		 74 aa  56.2  0.0000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.316855  normal  0.421643 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1218  SirA family protein  43.1 
 
 		 77 aa  56.6  0.0000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0826  SirA family protein  41.43 
 
 		 75 aa  56.2  0.0000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.24854 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0093  SirA-like protein  40 
 
 		 82 aa  56.6  0.0000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0756  SirA family protein  41.43 
 
 		 75 aa  56.2  0.0000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0477358 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0059  SirA-like  37.84 
 
 		 86 aa  56.2  0.0000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.470716 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0811  SirA-like protein  38.57 
 
 		 75 aa  56.2  0.0000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0842772 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1937  SirA family protein  40.35 
 
 		 76 aa  56.2  0.0000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.559837  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1905  SirA family protein  47.62 
 
 		 76 aa  55.8  0.0000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.00000195023  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0020  sulfur transfer protein SirA  35.21 
 
 		 81 aa  55.8  0.0000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000878962 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2500  SirA family protein  35.06 
 
 		 213 aa  56.2  0.0000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3746  SirA family protein  37.93 
 
 		 74 aa  55.8  0.0000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00371656  unclonable  0.000000591857 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0021  sulfur transfer protein SirA  36.62 
 
 		 81 aa  55.5  0.0000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.628095  hitchhiker  0.000000017124 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0015  sulfur transfer protein SirA  37.5 
 
 		 81 aa  55.1  0.0000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0331062  normal  0.432402 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0140  SirA family protein  39.66 
 
 		 97 aa  55.5  0.0000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15610  predicted redox protein, regulator of disulfide bond formation  52.83 
 
 		 110 aa  55.5  0.0000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0013  sulfur transfer protein SirA  35.21 
 
 		 81 aa  55.1  0.0000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000182945 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0013  sulfur transfer protein SirA  35.21 
 
 		 81 aa  55.1  0.0000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0557081 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0011  sulfur transfer protein SirA  36.62 
 
 		 81 aa  55.1  0.0000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2668  SirA-like protein  37.5 
 
 		 89 aa  54.7  0.0000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.220469  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1827  sulfur transfer protein SirA  42.11 
 
 		 84 aa  55.1  0.0000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0248688  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3088  SirA-like  40.35 
 
 		 75 aa  54.7  0.0000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3302  SirA family protein  50 
 
 		 76 aa  54.7  0.0000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.267105 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1085  SirA family protein  40.35 
 
 		 77 aa  54.7  0.0000004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2557  hypothetical protein  40.58 
 
 		 76 aa  54.7  0.0000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  decreased coverage  0.00791893  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2187  SirA family protein  40.58 
 
 		 76 aa  54.7  0.0000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0108315  hitchhiker  0.000000214154 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0011  sulfur transfer protein SirA  36.62 
 
 		 81 aa  54.7  0.0000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.119018  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2429  SirA-like  41.56 
 
 		 91 aa  54.3  0.0000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0019  sulfur transfer protein SirA  35.21 
 
 		 81 aa  54.3  0.0000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0054  hypothetical protein  37.84 
 
 		 86 aa  54.3  0.0000006  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0012  sulfur transfer protein SirA  37.5 
 
 		 81 aa  54.3  0.0000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2653  SirA-like protein  39.66 
 
 		 78 aa  54.3  0.0000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00012248  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1333  hypothetical protein  42.59 
 
 		 77 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2801  SirA family protein  42.86 
 
 		 77 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.205489 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1718  SirA family protein  41.07 
 
 		 81 aa  53.9  0.0000006  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20060  sulfur transfer protein SirA  43.86 
 
 		 85 aa  53.9  0.0000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0013  sulfur transfer protein SirA  35.21 
 
 		 81 aa  53.9  0.0000008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000321499  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0686  SirA family protein  28.81 
 
 		 194 aa  53.9  0.0000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0353  SirA-like  34.78 
 
 		 77 aa  53.5  0.0000009  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3534  SirA family protein  44.93 
 
 		 76 aa  53.5  0.0000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.724974  decreased coverage  0.000159335 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0598  SirA family protein  37.68 
 
 		 75 aa  53.1  0.000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0866  rhodanese domain-containing protein  28.81 
 
 		 186 aa  53.1  0.000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2018  SirA protein, putative  41.07 
 
 		 84 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0674453  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1453  hypothetical protein  42.86 
 
 		 76 aa  53.1  0.000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0920  hypothetical protein  42.86 
 
 		 76 aa  53.1  0.000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0937  rhodanese domain protein  28.81 
 
 		 186 aa  53.1  0.000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000726035  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1839  hypothetical protein  42.86 
 
 		 76 aa  53.1  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1412  SirA family protein  42.86 
 
 		 75 aa  53.1  0.000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.960057 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0903  SirA family protein  41.67 
 
 		 94 aa  53.1  0.000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0179319  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1881  SirA family protein  42.86 
 
 		 75 aa  53.1  0.000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.045708 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4578  SirA-like protein  42.86 
 
 		 75 aa  53.1  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.408362  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0967  SirA family protein  42.11 
 
 		 72 aa  53.5  0.000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.500955  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2640  hypothetical protein  42.86 
 
 		 76 aa  53.1  0.000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0863392  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0734  hypothetical protein  42.86 
 
 		 76 aa  53.1  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6347  hypothetical protein  52.08 
 
 		 71 aa  53.1  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.341476  normal  0.150375 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0429  hypothetical protein  42.86 
 
 		 76 aa  53.1  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0594568  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2575  molybdopterin cofactor biosynthesis MoaC region  36.49 
 
 		 85 aa  53.5  0.000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3493  SirA-like  40.28 
 
 		 94 aa  52.8  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.73146  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1662  hypothetical protein  42.86 
 
 		 76 aa  53.1  0.000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0398143  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0952  SirA-like  42.86 
 
 		 75 aa  53.1  0.000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.872302  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1684  hypothetical protein  42.86 
 
 		 76 aa  53.1  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.109756  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1434  SirA family protein  42.86 
 
 		 75 aa  53.1  0.000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1311  SirA family protein  37.14 
 
 		 200 aa  52.8  0.000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>