296 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_1644 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_1644  SirA family protein  100 
 
 		 100 aa  202  1e-51  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2132  hypothetical protein  60.87 
 
 		 75 aa  85.5  2e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  hitchhiker  0.00495785  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0807  SirA family protein  60.87 
 
 		 101 aa  85.5  2e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.720013  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1458  SirA-like  56.52 
 
 		 78 aa  82.4  0.000000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.000274297  normal  0.357093 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3601  SirA family protein  50.7 
 
 		 74 aa  81.6  0.000000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0717  SirA family protein  55.71 
 
 		 102 aa  80.9  0.000000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.178055  normal  0.908547 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3894  SirA family protein  50 
 
 		 74 aa  78.2  0.00000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.401469  hitchhiker  0.00420681 
 
 
-
 
NC_004310  BR2034  hypothetical protein  49.28 
 
 		 85 aa  74.7  0.0000000000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.358481  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2339  SirA family protein  51.47 
 
 		 75 aa  72  0.000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0889916  normal  0.318145 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0904  SirA family protein  46.38 
 
 		 78 aa  70.5  0.000000000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.849606  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4059  hypothetical protein  48.65 
 
 		 90 aa  68.9  0.00000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2570  SirA family protein  43.24 
 
 		 78 aa  68.2  0.00000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0845145  normal  0.388571 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3059  SirA-like  45.95 
 
 		 76 aa  67.4  0.00000000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.282994  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2558  SirA family protein  43.59 
 
 		 80 aa  67  0.00000000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.488236 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1085  SirA family protein  39.71 
 
 		 77 aa  66.6  0.00000000009  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0903  SirA family protein  45.24 
 
 		 94 aa  66.6  0.0000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0179319  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1672  SirA family protein  41.18 
 
 		 76 aa  66.6  0.0000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7291  SirA family protein  49.33 
 
 		 87 aa  65.5  0.0000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2217  hypothetical protein  42.03 
 
 		 76 aa  65.5  0.0000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.403117  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2705  SirA family protein  43.21 
 
 		 81 aa  64.7  0.0000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2399  SirA-like  58.33 
 
 		 74 aa  64.7  0.0000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.433209  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0831  SirA family protein  50.72 
 
 		 93 aa  64.7  0.0000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.378872  normal  0.616604 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0794  SirA family protein  42.65 
 
 		 76 aa  64.3  0.0000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000819157  normal  0.19401 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0863  SirA family protein  44.05 
 
 		 88 aa  63.5  0.0000000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.252783  normal  0.310522 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3766  sulfur transfer protein SirA  40.28 
 
 		 79 aa  62.4  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.769061  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3088  SirA-like  39.71 
 
 		 75 aa  62.4  0.000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0631  SirA family protein  38.24 
 
 		 76 aa  62.4  0.000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.161479 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44270  sulfur transfer protein SirA  37.18 
 
 		 79 aa  62.8  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0012  sulfur transfer protein SirA  35 
 
 		 81 aa  62  0.000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3548  SirA family protein  46.48 
 
 		 100 aa  61.6  0.000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.379024  normal  0.567232 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1905  sulfur transfer protein SirA  38.89 
 
 		 83 aa  60.8  0.000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00381161  normal  0.533797 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5996  SirA family protein  49.28 
 
 		 89 aa  60.5  0.000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00696256 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1937  SirA family protein  37.68 
 
 		 76 aa  60.5  0.000000008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.559837  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1626  SirA-like  40 
 
 		 75 aa  60.5  0.000000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000122761  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2116  sulfur transfer protein SirA  39.19 
 
 		 80 aa  60.1  0.000000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.101058 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3625  sulfur transfer protein SirA  39.19 
 
 		 80 aa  60.1  0.000000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.385858 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0011  sulfur transfer protein SirA  35 
 
 		 81 aa  60.1  0.00000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.119018  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1656  sulfur transfer protein SirA  37.84 
 
 		 80 aa  59.7  0.00000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.100562  normal  0.450785 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0975  SirA-like protein  35.63 
 
 		 101 aa  59.7  0.00000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.369067  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2937  SirA-like  34.88 
 
 		 97 aa  59.3  0.00000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0330  SirA family protein  40 
 
 		 80 aa  60.1  0.00000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2894  SirA family protein  35.71 
 
 		 75 aa  58.9  0.00000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0574  hypothetical protein  36.76 
 
 		 75 aa  59.3  0.00000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000789219  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1633  sulfur transfer protein SirA  38.89 
 
 		 80 aa  58.9  0.00000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.972147 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0090  SirA family protein  40.51 
 
 		 85 aa  59.3  0.00000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0719339  normal  0.137098 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0017  sulfur transfer protein SirA  35 
 
 		 81 aa  59.3  0.00000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0103959 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0017  sulfur transfer protein SirA  35 
 
 		 81 aa  59.3  0.00000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000123371 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3493  SirA-like  44.44 
 
 		 94 aa  59.3  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.73146  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0018  sulfur transfer protein SirA  35 
 
 		 81 aa  59.3  0.00000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03319  cell developmental protein SirA  36.25 
 
 		 81 aa  58.5  0.00000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0245  SirA family protein  36.25 
 
 		 81 aa  58.5  0.00000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0013  sulfur transfer protein SirA  35 
 
 		 81 aa  58.2  0.00000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0015  sulfur transfer protein SirA  32.5 
 
 		 81 aa  58.5  0.00000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0331062  normal  0.432402 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4790  sulfur transfer protein SirA  36.25 
 
 		 81 aa  58.5  0.00000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3852  sulfur transfer protein SirA  36.25 
 
 		 81 aa  58.5  0.00000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03272  hypothetical protein  36.25 
 
 		 81 aa  58.5  0.00000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3669  sulfur transfer protein SirA  36.25 
 
 		 81 aa  58.5  0.00000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3952  sulfur transfer protein SirA  36.25 
 
 		 81 aa  58.5  0.00000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0246  sulfur transfer protein SirA  36.25 
 
 		 81 aa  58.5  0.00000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2429  SirA-like  41.89 
 
 		 91 aa  58.2  0.00000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0013  sulfur transfer protein SirA  33.75 
 
 		 81 aa  58.2  0.00000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000182945 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0013  sulfur transfer protein SirA  33.75 
 
 		 81 aa  58.2  0.00000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0557081 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0021  sulfur transfer protein SirA  33.75 
 
 		 81 aa  57.8  0.00000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.628095  hitchhiker  0.000000017124 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0020  sulfur transfer protein SirA  33.75 
 
 		 81 aa  57.8  0.00000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000878962 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0019  sulfur transfer protein SirA  33.75 
 
 		 81 aa  57.8  0.00000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1254  hypothetical protein  39.71 
 
 		 77 aa  57.4  0.00000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1881  SirA family protein  36.76 
 
 		 75 aa  57  0.00000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.045708 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1827  sulfur transfer protein SirA  38.03 
 
 		 84 aa  57  0.00000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0248688  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4578  SirA-like protein  36.76 
 
 		 75 aa  57  0.00000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.408362  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1412  SirA family protein  36.76 
 
 		 75 aa  57  0.00000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.960057 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0952  SirA-like  36.76 
 
 		 75 aa  57  0.00000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.872302  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1434  SirA family protein  36.76 
 
 		 75 aa  57  0.00000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1718  SirA family protein  35.29 
 
 		 81 aa  57  0.00000009  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0017  sulfur transfer protein SirA  36.23 
 
 		 81 aa  56.6  0.0000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000196342 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1779  SirA family protein  40.51 
 
 		 81 aa  56.6  0.0000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2618  SirA-like protein  43.06 
 
 		 80 aa  56.2  0.0000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0561  SirA family protein  32.86 
 
 		 75 aa  56.2  0.0000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00147914  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3754  sulfur transfer protein SirA  35 
 
 		 81 aa  56.6  0.0000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3746  SirA family protein  33.82 
 
 		 74 aa  56.6  0.0000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00371656  unclonable  0.000000591857 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1011  SirA-like  36.76 
 
 		 75 aa  55.8  0.0000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1353  SirA family protein  36.76 
 
 		 75 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.563442  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2500  SirA family protein  40.54 
 
 		 213 aa  55.5  0.0000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1314  SirA family protein  36.76 
 
 		 75 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1233  SirA family protein  43.94 
 
 		 79 aa  55.1  0.0000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1263  SirA family protein  43.94 
 
 		 79 aa  55.1  0.0000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.600838  normal  0.692978 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1333  hypothetical protein  35.29 
 
 		 77 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4174  SirA family protein  39.13 
 
 		 85 aa  54.7  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.197617  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4185  SirA family protein  43.94 
 
 		 79 aa  54.7  0.0000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.312975  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0093  SirA-like protein  43.64 
 
 		 82 aa  54.7  0.0000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0011  sulfur transfer protein SirA  33.75 
 
 		 81 aa  54.7  0.0000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3986  sulfur transfer protein SirA  33.75 
 
 		 84 aa  54.3  0.0000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1684  hypothetical protein  40.85 
 
 		 76 aa  54.7  0.0000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.109756  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0920  hypothetical protein  40.85 
 
 		 76 aa  54.7  0.0000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0570  sulfur transfer protein SirA  33.75 
 
 		 84 aa  54.3  0.0000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1839  hypothetical protein  40.85 
 
 		 76 aa  54.7  0.0000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2640  hypothetical protein  40.85 
 
 		 76 aa  54.7  0.0000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0863392  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2801  SirA family protein  35.29 
 
 		 77 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.205489 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1662  hypothetical protein  40.85 
 
 		 76 aa  54.7  0.0000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0398143  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1453  hypothetical protein  40.85 
 
 		 76 aa  54.7  0.0000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0232  sulfur transfer protein SirA  33.75 
 
 		 84 aa  54.3  0.0000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>