More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlg_2500 on replicon NC_008340
Organism: Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008340  Mlg_2500  SirA family protein  100 
 
 
213 aa  437  9.999999999999999e-123  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0090  SirA family protein  44.12 
 
 
85 aa  73.2  0.000000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0719339  normal  0.137098 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0794  SirA family protein  45.71 
 
 
76 aa  72.4  0.000000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000819157  normal  0.19401 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0093  SirA-like protein  47.95 
 
 
82 aa  71.2  0.00000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2217  hypothetical protein  45.71 
 
 
76 aa  70.1  0.00000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.403117  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002901  hypothetical protein  37.65 
 
 
102 aa  70.1  0.00000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1704  hypothetical protein  46.67 
 
 
104 aa  69.7  0.00000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.370277  normal  0.320332 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3746  SirA family protein  42.03 
 
 
74 aa  69.3  0.00000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00371656  unclonable  0.000000591857 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0811  SirA-like protein  43.48 
 
 
75 aa  69.3  0.00000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0842772 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1672  SirA family protein  46.38 
 
 
76 aa  69.3  0.00000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0810  hypothetical protein  42.03 
 
 
75 aa  68.6  0.00000000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.566586 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0861  SirA-like  42.03 
 
 
75 aa  68.6  0.00000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1881  SirA family protein  43.48 
 
 
75 aa  67.8  0.0000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.045708 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1412  SirA family protein  43.48 
 
 
75 aa  67.8  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.960057 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1989  SirA family protein  43.48 
 
 
75 aa  67.8  0.0000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000867317 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4578  SirA-like protein  43.48 
 
 
75 aa  67.8  0.0000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.408362  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0952  SirA-like  43.48 
 
 
75 aa  67.8  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.872302  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03059  hypothetical protein  41.98 
 
 
98 aa  67.8  0.0000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1434  SirA family protein  43.48 
 
 
75 aa  67.8  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1353  SirA family protein  43.48 
 
 
75 aa  67  0.0000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.563442  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1254  hypothetical protein  44.12 
 
 
77 aa  67  0.0000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0631  SirA family protein  43.48 
 
 
76 aa  67  0.0000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.161479 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1011  SirA-like  43.48 
 
 
75 aa  67.4  0.0000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1314  SirA family protein  43.48 
 
 
75 aa  67  0.0000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2088  hypothetical protein  47.14 
 
 
76 aa  66.6  0.0000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0107447  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0756  SirA family protein  39.13 
 
 
75 aa  66.2  0.0000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0477358 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2557  hypothetical protein  43.48 
 
 
76 aa  66.2  0.0000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  decreased coverage  0.00791893  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1959  redox protein regulator of disulfide bond formation-like  44.44 
 
 
103 aa  66.2  0.0000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0000373287  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2187  SirA family protein  43.48 
 
 
76 aa  66.2  0.0000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0108315  hitchhiker  0.000000214154 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0826  SirA family protein  39.13 
 
 
75 aa  66.2  0.0000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.24854 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2384  SirA family protein  42.03 
 
 
75 aa  66.2  0.0000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.21335  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1684  hypothetical protein  44.29 
 
 
76 aa  65.9  0.0000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.109756  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0920  hypothetical protein  44.29 
 
 
76 aa  65.9  0.0000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1662  hypothetical protein  44.29 
 
 
76 aa  65.9  0.0000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0398143  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3088  SirA-like  44.93 
 
 
75 aa  66.2  0.0000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1839  hypothetical protein  44.29 
 
 
76 aa  65.9  0.0000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2640  hypothetical protein  44.29 
 
 
76 aa  65.9  0.0000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0863392  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2898  SirA family protein  42.03 
 
 
75 aa  66.2  0.0000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3724  SirA-like  43.48 
 
 
75 aa  65.9  0.0000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.893626 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1453  hypothetical protein  44.29 
 
 
76 aa  65.9  0.0000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0734  hypothetical protein  44.29 
 
 
76 aa  65.9  0.0000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0429  hypothetical protein  44.29 
 
 
76 aa  65.9  0.0000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0594568  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1028  SirA family protein  43.48 
 
 
75 aa  65.9  0.0000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.399081  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2214  SirA family protein  42.03 
 
 
75 aa  65.9  0.0000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.160562 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1333  hypothetical protein  42.03 
 
 
77 aa  65.5  0.0000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2377  SirA-like  40.58 
 
 
75 aa  65.1  0.0000000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0972982  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2801  SirA family protein  42.03 
 
 
77 aa  65.1  0.0000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.205489 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3170  SirA family protein  42.25 
 
 
77 aa  65.1  0.0000000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.206236 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4506  rhodanese domain protein  36.11 
 
 
186 aa  64.3  0.000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000693639 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4481  hypothetical protein  38.14 
 
 
111 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.370309 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0574  hypothetical protein  42.03 
 
 
75 aa  64.7  0.000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000789219  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2791  SirA family protein  44.29 
 
 
76 aa  64.3  0.000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.281845  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1298  SirA family protein  40.58 
 
 
75 aa  64.3  0.000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1134  hypothetical protein  42.03 
 
 
75 aa  63.9  0.000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00450728 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0026  SirA family protein  38.03 
 
 
78 aa  63.9  0.000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000175689  normal  0.0503522 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0024  hypothetical protein  43.66 
 
 
116 aa  63.5  0.000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.343271 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1937  SirA family protein  42.03 
 
 
76 aa  63.5  0.000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.559837  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2575  molybdopterin cofactor biosynthesis MoaC region  36 
 
 
85 aa  63.9  0.000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1718  SirA family protein  40.58 
 
 
81 aa  63.5  0.000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2324  SirA family protein  39.44 
 
 
77 aa  63.2  0.000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0434291  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0561  SirA family protein  40.58 
 
 
75 aa  62.8  0.000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00147914  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4707  hypothetical protein  41.1 
 
 
104 aa  63.5  0.000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.248298  normal  0.0499606 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2894  SirA family protein  39.13 
 
 
75 aa  62.4  0.000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1436  SirA family protein  39.13 
 
 
81 aa  62.8  0.000000004  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.324916  normal  0.46012 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1402  hypothetical protein  40.2 
 
 
116 aa  62.8  0.000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0116274  normal  0.782631 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1593  SirA family protein  45.07 
 
 
78 aa  62.4  0.000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.433427  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5256  hypothetical protein  37.25 
 
 
100 aa  62.4  0.000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.44914  normal  0.0167613 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3614  SirA family protein  49.12 
 
 
76 aa  62.4  0.000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000103575 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3804  hypothetical protein  37.04 
 
 
116 aa  62  0.000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3509  hypothetical protein  37.04 
 
 
116 aa  62  0.000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1155  regulatory protein, MarR  34.72 
 
 
82 aa  61.6  0.000000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.102823 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0309  hypothetical protein  37.33 
 
 
142 aa  61.6  0.000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1233  SirA family protein  42.86 
 
 
79 aa  61.2  0.00000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1263  SirA family protein  42.86 
 
 
79 aa  61.2  0.00000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.600838  normal  0.692978 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0565  SirA family protein  43.64 
 
 
189 aa  61.2  0.00000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000944688  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4185  SirA family protein  42.86 
 
 
79 aa  60.8  0.00000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.312975  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0063  hypothetical protein  39.74 
 
 
97 aa  61.2  0.00000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.883633  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1860  SirA family protein  35.06 
 
 
78 aa  61.2  0.00000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000771633  normal  0.0684437 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3979  SirA family protein  42.86 
 
 
79 aa  61.2  0.00000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0020  sulfur transfer protein SirA  35.71 
 
 
81 aa  60.8  0.00000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000878962 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2890  SirA family protein  45.45 
 
 
189 aa  61.2  0.00000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0868  hypothetical protein  40.58 
 
 
75 aa  60.5  0.00000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0017  sulfur transfer protein SirA  35.71 
 
 
81 aa  60.1  0.00000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000196342 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0738  rhodanese domain-containing protein  33.8 
 
 
186 aa  60.1  0.00000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0001064  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0830  rhodanese domain protein  32.39 
 
 
186 aa  60.5  0.00000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00233764  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0018  sulfur transfer protein SirA  36.23 
 
 
81 aa  60.1  0.00000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0361  hypothetical protein  39.47 
 
 
127 aa  60.5  0.00000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0017  sulfur transfer protein SirA  36.23 
 
 
81 aa  60.1  0.00000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000123371 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0038  SirA family protein  39.71 
 
 
78 aa  60.5  0.00000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  unclonable  0.00000000000000689982  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3367  hypothetical protein  38.03 
 
 
89 aa  60.5  0.00000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0796854  normal  0.25879 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0017  sulfur transfer protein SirA  36.23 
 
 
81 aa  60.1  0.00000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0103959 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0776  rhodanese domain-containing protein  33.8 
 
 
186 aa  60.1  0.00000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4391  hypothetical protein  46.38 
 
 
83 aa  60.5  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2819  SirA-like protein  41.03 
 
 
83 aa  60.8  0.00000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5816  hypothetical protein  37.25 
 
 
100 aa  60.1  0.00000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4504  hypothetical protein  40.58 
 
 
76 aa  60.1  0.00000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000117975 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0013  sulfur transfer protein SirA  36.23 
 
 
81 aa  60.1  0.00000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3601  SirA family protein  41.18 
 
 
74 aa  60.8  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0940  hypothetical protein  39.13 
 
 
75 aa  60.5  0.00000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000000596514  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51310  hypothetical protein  44.93 
 
 
83 aa  60.5  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000169267 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>