277 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_2429 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008254  Meso_2429  SirA-like  100 
 
 		 91 aa  184  4e-46  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0975  SirA-like protein  81.43 
 
 		 101 aa  118  3e-26  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.369067  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2937  SirA-like  77.14 
 
 		 97 aa  114  6e-25  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3129  SirA-like  75.34 
 
 		 80 aa  110  8.000000000000001e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.445608  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3493  SirA-like  68.83 
 
 		 94 aa  107  6e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.73146  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1873  SirA-like  67.53 
 
 		 82 aa  106  1e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.265759  normal  0.477358 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3688  SirA-like  69.33 
 
 		 80 aa  102  1e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6347  hypothetical protein  65.67 
 
 		 71 aa  93.6  7e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.341476  normal  0.150375 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5996  SirA family protein  66.67 
 
 		 89 aa  91.3  4e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00696256 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4174  SirA family protein  65.28 
 
 		 85 aa  91.3  4e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.197617  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0903  SirA family protein  61.97 
 
 		 94 aa  89.4  2e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0179319  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0831  SirA family protein  59.72 
 
 		 93 aa  88.2  4e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.378872  normal  0.616604 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0863  SirA family protein  61.11 
 
 		 88 aa  87.4  6e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.252783  normal  0.310522 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0978  SirA family protein  58.11 
 
 		 80 aa  86.7  1e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0114244 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7291  SirA family protein  58.57 
 
 		 87 aa  82.4  0.000000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4368  SirA family protein  60 
 
 		 82 aa  80.9  0.000000000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3548  SirA family protein  57.75 
 
 		 100 aa  80.5  0.000000000000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.379024  normal  0.567232 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5387  SirA family protein  60.66 
 
 		 89 aa  77  0.00000000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.895582  normal  0.53519 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4059  hypothetical protein  55.88 
 
 		 90 aa  68.9  0.00000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2570  SirA family protein  48.57 
 
 		 78 aa  68.2  0.00000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0845145  normal  0.388571 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3894  SirA family protein  50 
 
 		 74 aa  66.2  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.401469  hitchhiker  0.00420681 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3601  SirA family protein  49.28 
 
 		 74 aa  66.2  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4504  hypothetical protein  46.38 
 
 		 76 aa  65.5  0.0000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000117975 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0717  SirA family protein  40.26 
 
 		 102 aa  64.7  0.0000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.178055  normal  0.908547 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0832  hypothetical protein  44.93 
 
 		 76 aa  63.9  0.0000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00406829  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2132  hypothetical protein  46.38 
 
 		 75 aa  63.9  0.0000000008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  hitchhiker  0.00495785  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0807  SirA family protein  46.38 
 
 		 101 aa  63.9  0.0000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.720013  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0939  hypothetical protein  48.57 
 
 		 75 aa  62.8  0.000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000269274  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0868  hypothetical protein  43.48 
 
 		 75 aa  61.6  0.000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0674  hypothetical protein  43.48 
 
 		 76 aa  62  0.000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.384362  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0940  hypothetical protein  48.57 
 
 		 75 aa  62  0.000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000000596514  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3059  SirA-like  45.71 
 
 		 76 aa  61.6  0.000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.282994  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0794  SirA family protein  42.86 
 
 		 76 aa  61.6  0.000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000819157  normal  0.19401 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1085  SirA family protein  44.12 
 
 		 77 aa  60.8  0.000000006  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3746  SirA family protein  41.18 
 
 		 74 aa  60.8  0.000000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00371656  unclonable  0.000000591857 
 
 
-
 
NC_004310  BR2034  hypothetical protein  47.76 
 
 		 85 aa  60.5  0.000000007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.358481  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0033  hypothetical protein  44.29 
 
 		 78 aa  60.8  0.000000007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00000671264  normal  0.064173 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4506  rhodanese domain protein  36.84 
 
 		 186 aa  60.8  0.000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000693639 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0740  hypothetical protein  42.03 
 
 		 76 aa  58.9  0.00000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0137112  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0688  hypothetical protein  42.03 
 
 		 76 aa  58.9  0.00000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.301237  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0672  hypothetical protein  36.84 
 
 		 186 aa  58.9  0.00000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00074605  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0830  rhodanese domain protein  35.53 
 
 		 186 aa  59.3  0.00000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00233764  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0778  hypothetical protein  42.03 
 
 		 75 aa  58.9  0.00000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0872  hypothetical protein  42.03 
 
 		 76 aa  58.9  0.00000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000063042 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0937  rhodanese domain protein  35.53 
 
 		 186 aa  59.3  0.00000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000726035  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0686  hypothetical protein  35.53 
 
 		 186 aa  58.5  0.00000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.745505  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0870  rhodanese domain protein  35.53 
 
 		 186 aa  58.5  0.00000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000347313 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0631  SirA family protein  37.14 
 
 		 76 aa  58.2  0.00000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.161479 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0866  rhodanese domain-containing protein  34.72 
 
 		 186 aa  57.4  0.00000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0904  SirA family protein  46.27 
 
 		 78 aa  57.4  0.00000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.849606  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1718  SirA family protein  36.23 
 
 		 81 aa  56.6  0.0000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2339  SirA family protein  41.89 
 
 		 75 aa  56.6  0.0000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0889916  normal  0.318145 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0090  SirA family protein  41.18 
 
 		 85 aa  55.8  0.0000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0719339  normal  0.137098 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2217  hypothetical protein  37.14 
 
 		 76 aa  55.8  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.403117  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0738  rhodanese domain-containing protein  34.21 
 
 		 186 aa  55.8  0.0000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0001064  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0574  hypothetical protein  39.13 
 
 		 75 aa  55.8  0.0000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000789219  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1254  hypothetical protein  38.89 
 
 		 77 aa  55.8  0.0000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0776  rhodanese domain-containing protein  34.21 
 
 		 186 aa  55.8  0.0000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1458  SirA-like  42.03 
 
 		 78 aa  56.2  0.0000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.000274297  normal  0.357093 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0686  SirA family protein  30.95 
 
 		 194 aa  55.1  0.0000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2324  SirA family protein  40.85 
 
 		 77 aa  55.1  0.0000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0434291  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0125  SirA family protein  37.33 
 
 		 78 aa  55.5  0.0000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1436  SirA family protein  33.33 
 
 		 81 aa  54.7  0.0000004  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.324916  normal  0.46012 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1011  SirA-like  39.13 
 
 		 75 aa  54.7  0.0000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0688  SirA family protein  40.58 
 
 		 75 aa  54.7  0.0000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2558  SirA family protein  41.56 
 
 		 80 aa  54.3  0.0000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.488236 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2187  SirA family protein  42.03 
 
 		 76 aa  54.3  0.0000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0108315  hitchhiker  0.000000214154 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2557  hypothetical protein  42.03 
 
 		 76 aa  54.3  0.0000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  decreased coverage  0.00791893  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2500  SirA family protein  36.84 
 
 		 213 aa  53.9  0.0000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2088  hypothetical protein  38.96 
 
 		 76 aa  53.1  0.000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0107447  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1860  SirA family protein  32.43 
 
 		 78 aa  52.4  0.000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000771633  normal  0.0684437 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1959  redox protein regulator of disulfide bond formation-like  38.57 
 
 		 103 aa  52.8  0.000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0000373287  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0026  SirA family protein  35.62 
 
 		 78 aa  52.4  0.000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000175689  normal  0.0503522 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3088  SirA-like  44.23 
 
 		 75 aa  52  0.000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0669  SirA family protein  37.84 
 
 		 78 aa  51.6  0.000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1672  SirA family protein  33.78 
 
 		 76 aa  52  0.000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0038  SirA family protein  33.33 
 
 		 78 aa  51.2  0.000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  unclonable  0.00000000000000689982  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2399  SirA-like  39.13 
 
 		 74 aa  51.2  0.000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.433209  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0962  SirA family protein  37.5 
 
 		 92 aa  50.8  0.000006  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.3564  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1366  SirA family protein  38.57 
 
 		 70 aa  50.4  0.000007  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1310  SirA family protein  38.57 
 
 		 70 aa  50.8  0.000007  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0565  SirA family protein  37.33 
 
 		 189 aa  50.4  0.000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000944688  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1138  SirA family protein  34.29 
 
 		 77 aa  50.4  0.000009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0574042  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1694  SirA family protein  40.3 
 
 		 75 aa  50.4  0.000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.304124  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3777  SirA family protein  41.67 
 
 		 60 aa  49.7  0.00001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1134  hypothetical protein  33.78 
 
 		 75 aa  50.1  0.00001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00450728 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1937  SirA family protein  45 
 
 		 76 aa  49.7  0.00001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.559837  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0119  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  37.14 
 
 		 813 aa  49.7  0.00001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2894  SirA family protein  34.78 
 
 		 75 aa  48.9  0.00002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0643  SirA family protein  37.14 
 
 		 70 aa  49.7  0.00002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0861  SirA-like  36.23 
 
 		 75 aa  48.9  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0436  SirA-like  31.88 
 
 		 75 aa  49.3  0.00002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0093  SirA-like protein  38.36 
 
 		 82 aa  49.3  0.00002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0811  SirA-like protein  37.68 
 
 		 75 aa  49.3  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0842772 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0330  SirA family protein  35.21 
 
 		 80 aa  48.9  0.00002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02400  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  33.33 
 
 		 831 aa  48.5  0.00003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0365  hypothetical protein  35.14 
 
 		 75 aa  48.1  0.00004  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0810  hypothetical protein  43.4 
 
 		 75 aa  48.1  0.00004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.566586 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1644  SirA family protein  41.89 
 
 		 100 aa  48.1  0.00004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0588  hypothetical protein  38.03 
 
 		 78 aa  48.1  0.00004  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.456844  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>