258 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_3059 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008254  Meso_3059  SirA-like  100 
 
 		 76 aa  160  7e-39  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.282994  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3601  SirA family protein  61.43 
 
 		 74 aa  99.4  1e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2570  SirA family protein  64.71 
 
 		 78 aa  98.6  3e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0845145  normal  0.388571 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3894  SirA family protein  60.87 
 
 		 74 aa  97.1  7e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.401469  hitchhiker  0.00420681 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4059  hypothetical protein  61.76 
 
 		 90 aa  95.1  3e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0904  SirA family protein  56.52 
 
 		 78 aa  86.3  1e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.849606  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2034  hypothetical protein  56.52 
 
 		 85 aa  85.1  3e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.358481  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0330  SirA family protein  45.83 
 
 		 80 aa  75.1  0.0000000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2558  SirA family protein  49.28 
 
 		 80 aa  74.3  0.0000000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.488236 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0717  SirA family protein  50 
 
 		 102 aa  72.8  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.178055  normal  0.908547 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1937  SirA family protein  48.53 
 
 		 76 aa  70.9  0.000000000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.559837  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2132  hypothetical protein  46.48 
 
 		 75 aa  67  0.00000000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  hitchhiker  0.00495785  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1672  SirA family protein  47.76 
 
 		 76 aa  67.4  0.00000000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3493  SirA-like  44.59 
 
 		 94 aa  67  0.00000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.73146  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0807  SirA family protein  46.48 
 
 		 101 aa  67  0.00000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.720013  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0831  SirA family protein  45.83 
 
 		 93 aa  66.6  0.0000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.378872  normal  0.616604 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0794  SirA family protein  44.12 
 
 		 76 aa  66.2  0.0000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000819157  normal  0.19401 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2217  hypothetical protein  45.59 
 
 		 76 aa  65.5  0.0000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.403117  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1085  SirA family protein  49.25 
 
 		 77 aa  65.9  0.0000000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0631  SirA family protein  45.59 
 
 		 76 aa  65.9  0.0000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.161479 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3614  SirA family protein  50.85 
 
 		 76 aa  63.5  0.0000000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000103575 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2187  SirA family protein  43.66 
 
 		 76 aa  62.8  0.000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0108315  hitchhiker  0.000000214154 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3088  SirA-like  43.28 
 
 		 75 aa  63.2  0.000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0574  hypothetical protein  43.28 
 
 		 75 aa  63.2  0.000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000789219  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2557  hypothetical protein  43.66 
 
 		 76 aa  62.8  0.000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  decreased coverage  0.00791893  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7291  SirA family protein  46.58 
 
 		 87 aa  63.5  0.000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1254  hypothetical protein  36.62 
 
 		 77 aa  62.4  0.000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0090  SirA family protein  46.38 
 
 		 85 aa  62.8  0.000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0719339  normal  0.137098 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2339  SirA family protein  38.81 
 
 		 75 aa  62.4  0.000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0889916  normal  0.318145 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1011  SirA-like  41.79 
 
 		 75 aa  61.6  0.000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2429  SirA-like  45.71 
 
 		 91 aa  61.6  0.000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5996  SirA family protein  44.93 
 
 		 89 aa  61.2  0.000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00696256 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3746  SirA family protein  43.28 
 
 		 74 aa  61.2  0.000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00371656  unclonable  0.000000591857 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2088  hypothetical protein  41.18 
 
 		 76 aa  61.2  0.000000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0107447  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5387  SirA family protein  48.33 
 
 		 89 aa  60.1  0.000000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.895582  normal  0.53519 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0903  SirA family protein  43.06 
 
 		 94 aa  60.1  0.00000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0179319  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1134  hypothetical protein  49.21 
 
 		 75 aa  59.7  0.00000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00450728 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1593  SirA family protein  48.28 
 
 		 78 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.433427  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4578  SirA-like protein  43.28 
 
 		 75 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.408362  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1412  SirA family protein  43.28 
 
 		 75 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.960057 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1881  SirA family protein  43.28 
 
 		 75 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.045708 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2791  SirA family protein  42.65 
 
 		 76 aa  60.1  0.00000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.281845  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0952  SirA-like  43.28 
 
 		 75 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.872302  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0863  SirA family protein  44.93 
 
 		 88 aa  59.7  0.00000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.252783  normal  0.310522 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1434  SirA family protein  43.28 
 
 		 75 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1353  SirA family protein  43.28 
 
 		 75 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.563442  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1298  SirA family protein  41.79 
 
 		 75 aa  58.9  0.00000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1458  SirA-like  42.65 
 
 		 78 aa  59.3  0.00000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.000274297  normal  0.357093 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1314  SirA family protein  43.28 
 
 		 75 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4174  SirA family protein  42.03 
 
 		 85 aa  59.3  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.197617  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3170  SirA family protein  41.79 
 
 		 77 aa  58.9  0.00000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.206236 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0940  hypothetical protein  36.62 
 
 		 75 aa  58.5  0.00000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000000596514  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1873  SirA-like  36.99 
 
 		 82 aa  58.2  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.265759  normal  0.477358 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2384  SirA family protein  45.31 
 
 		 75 aa  57.8  0.00000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.21335  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2898  SirA family protein  45.31 
 
 		 75 aa  57.8  0.00000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2377  SirA-like  41.79 
 
 		 75 aa  57.4  0.00000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0972982  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2894  SirA family protein  38.03 
 
 		 75 aa  57  0.00000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3129  SirA-like  43.66 
 
 		 80 aa  57  0.00000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.445608  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0939  hypothetical protein  35.21 
 
 		 75 aa  56.6  0.0000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000269274  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0734  hypothetical protein  46.43 
 
 		 76 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4368  SirA family protein  41.18 
 
 		 82 aa  56.2  0.0000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1684  hypothetical protein  46.43 
 
 		 76 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.109756  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6347  hypothetical protein  41.79 
 
 		 71 aa  56.6  0.0000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.341476  normal  0.150375 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0920  hypothetical protein  46.43 
 
 		 76 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1662  hypothetical protein  46.43 
 
 		 76 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0398143  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1839  hypothetical protein  46.43 
 
 		 76 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2640  hypothetical protein  46.43 
 
 		 76 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0863392  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0093  SirA-like protein  45.9 
 
 		 82 aa  56.6  0.0000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1333  hypothetical protein  41.79 
 
 		 77 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0429  hypothetical protein  46.43 
 
 		 76 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0594568  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1028  SirA family protein  47.37 
 
 		 75 aa  56.2  0.0000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.399081  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1453  hypothetical protein  46.43 
 
 		 76 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0019  sulfur transfer protein SirA  35.29 
 
 		 81 aa  55.8  0.0000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0826  SirA family protein  41.79 
 
 		 75 aa  55.8  0.0000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.24854 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2214  SirA family protein  43.75 
 
 		 75 aa  56.2  0.0000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.160562 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0861  SirA-like  41.79 
 
 		 75 aa  55.5  0.0000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0975  SirA-like protein  41.18 
 
 		 101 aa  55.8  0.0000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.369067  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0033  hypothetical protein  37.31 
 
 		 78 aa  55.8  0.0000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00000671264  normal  0.064173 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0561  SirA family protein  36.62 
 
 		 75 aa  56.2  0.0000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00147914  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0756  SirA family protein  41.79 
 
 		 75 aa  55.8  0.0000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0477358 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0811  SirA-like protein  41.79 
 
 		 75 aa  55.8  0.0000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0842772 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2801  SirA family protein  41.79 
 
 		 77 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.205489 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1989  SirA family protein  49.06 
 
 		 75 aa  55.8  0.0000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000867317 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0017  sulfur transfer protein SirA  35.29 
 
 		 81 aa  55.5  0.0000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0103959 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0810  hypothetical protein  41.79 
 
 		 75 aa  55.5  0.0000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.566586 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0018  sulfur transfer protein SirA  35.29 
 
 		 81 aa  55.5  0.0000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0017  sulfur transfer protein SirA  35.29 
 
 		 81 aa  55.5  0.0000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000123371 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0011  sulfur transfer protein SirA  35.29 
 
 		 81 aa  55.1  0.0000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.119018  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2500  SirA family protein  35.71 
 
 		 213 aa  55.1  0.0000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0013  sulfur transfer protein SirA  35.29 
 
 		 81 aa  54.7  0.0000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0017  sulfur transfer protein SirA  33.82 
 
 		 81 aa  54.3  0.0000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000196342 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0087  sulfur transfer protein SirA  40 
 
 		 81 aa  54.7  0.0000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.253958  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2932  SirA family protein  39.71 
 
 		 77 aa  54.3  0.0000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2399  SirA-like  44.44 
 
 		 74 aa  54.3  0.0000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.433209  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2819  SirA-like protein  36.62 
 
 		 83 aa  54.3  0.0000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0038  SirA family protein  30.88 
 
 		 78 aa  54.3  0.0000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  unclonable  0.00000000000000689982  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0020  sulfur transfer protein SirA  33.82 
 
 		 81 aa  53.9  0.0000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000878962 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0866  rhodanese domain-containing protein  39.29 
 
 		 186 aa  53.9  0.0000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1644  SirA family protein  45.95 
 
 		 100 aa  53.9  0.0000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2937  SirA-like  39.71 
 
 		 97 aa  53.9  0.0000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>