284 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_0903 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_0903  SirA family protein  100 
 
 		 94 aa  182  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0179319  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0863  SirA family protein  97.73 
 
 		 88 aa  167  3e-41  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.252783  normal  0.310522 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0831  SirA family protein  91.76 
 
 		 93 aa  148  2e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.378872  normal  0.616604 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5387  SirA family protein  70.42 
 
 		 89 aa  90.9  5e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.895582  normal  0.53519 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2429  SirA-like  61.97 
 
 		 91 aa  89.4  2e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2937  SirA-like  57.89 
 
 		 97 aa  86.3  1e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0975  SirA-like protein  57.97 
 
 		 101 aa  85.5  2e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.369067  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5996  SirA family protein  57.83 
 
 		 89 aa  84.3  4e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00696256 
 
 
-
 
NC_004310  BR2034  hypothetical protein  56.76 
 
 		 85 aa  83.6  9e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.358481  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3548  SirA family protein  60.27 
 
 		 100 aa  80.9  0.000000000000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.379024  normal  0.567232 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7291  SirA family protein  60.53 
 
 		 87 aa  80.5  0.000000000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4368  SirA family protein  74.55 
 
 		 82 aa  80.1  0.00000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3129  SirA-like  56.52 
 
 		 80 aa  78.2  0.00000000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.445608  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6347  hypothetical protein  54.41 
 
 		 71 aa  78.2  0.00000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.341476  normal  0.150375 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0904  SirA family protein  54.05 
 
 		 78 aa  77.4  0.00000000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.849606  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3688  SirA-like  56.34 
 
 		 80 aa  77  0.00000000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1873  SirA-like  50.68 
 
 		 82 aa  75.5  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.265759  normal  0.477358 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0978  SirA family protein  59.15 
 
 		 80 aa  74.3  0.0000000000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0114244 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4059  hypothetical protein  56.06 
 
 		 90 aa  74.3  0.0000000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0717  SirA family protein  47.56 
 
 		 102 aa  73.2  0.000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.178055  normal  0.908547 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0807  SirA family protein  48.72 
 
 		 101 aa  72.4  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.720013  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2132  hypothetical protein  52.86 
 
 		 75 aa  72  0.000000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  hitchhiker  0.00495785  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3601  SirA family protein  47.89 
 
 		 74 aa  70.9  0.000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3894  SirA family protein  48.57 
 
 		 74 aa  68.9  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.401469  hitchhiker  0.00420681 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3493  SirA-like  49.3 
 
 		 94 aa  68.9  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.73146  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2570  SirA family protein  44.59 
 
 		 78 aa  69.3  0.00000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0845145  normal  0.388571 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4174  SirA family protein  50.68 
 
 		 85 aa  66.2  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.197617  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3059  SirA-like  43.06 
 
 		 76 aa  60.1  0.00000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.282994  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0090  SirA family protein  44 
 
 		 85 aa  58.9  0.00000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0719339  normal  0.137098 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0794  SirA family protein  42.03 
 
 		 76 aa  59.3  0.00000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000819157  normal  0.19401 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2217  hypothetical protein  42.86 
 
 		 76 aa  58.2  0.00000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.403117  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1254  hypothetical protein  42.11 
 
 		 77 aa  58.2  0.00000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0631  SirA family protein  42.03 
 
 		 76 aa  57  0.00000009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.161479 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0330  SirA family protein  39.47 
 
 		 80 aa  57  0.00000009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2088  hypothetical protein  42.86 
 
 		 76 aa  56.2  0.0000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0107447  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2324  SirA family protein  35.53 
 
 		 77 aa  56.6  0.0000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0434291  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1458  SirA-like  42.86 
 
 		 78 aa  55.5  0.0000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.000274297  normal  0.357093 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1644  SirA family protein  45.24 
 
 		 100 aa  55.1  0.0000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1201  SirA family protein  44.29 
 
 		 92 aa  53.9  0.0000007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4069  SirA family protein  35.8 
 
 		 81 aa  53.9  0.0000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0756  SirA family protein  40.58 
 
 		 75 aa  53.5  0.0000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0477358 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2618  SirA-like protein  45.33 
 
 		 80 aa  53.5  0.0000009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0826  SirA family protein  40.58 
 
 		 75 aa  53.5  0.0000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.24854 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1011  SirA-like  39.13 
 
 		 75 aa  53.5  0.000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0093  SirA-like protein  47.62 
 
 		 82 aa  53.5  0.000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1860  SirA family protein  34.18 
 
 		 78 aa  53.5  0.000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000771633  normal  0.0684437 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2558  SirA family protein  41.67 
 
 		 80 aa  53.1  0.000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.488236 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0125  SirA family protein  35.44 
 
 		 78 aa  53.1  0.000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03319  cell developmental protein SirA  35.8 
 
 		 81 aa  52.4  0.000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0245  SirA family protein  35.8 
 
 		 81 aa  52.4  0.000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0246  sulfur transfer protein SirA  35.8 
 
 		 81 aa  52.4  0.000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2339  SirA family protein  40 
 
 		 75 aa  52.8  0.000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0889916  normal  0.318145 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0810  hypothetical protein  42.03 
 
 		 75 aa  52.8  0.000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.566586 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3088  SirA-like  37.68 
 
 		 75 aa  52.8  0.000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3852  sulfur transfer protein SirA  35.8 
 
 		 81 aa  52.4  0.000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3669  sulfur transfer protein SirA  35.8 
 
 		 81 aa  52.4  0.000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0033  hypothetical protein  38.57 
 
 		 78 aa  52.8  0.000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00000671264  normal  0.064173 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03272  hypothetical protein  35.8 
 
 		 81 aa  52.4  0.000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3952  sulfur transfer protein SirA  35.8 
 
 		 81 aa  52.4  0.000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4790  sulfur transfer protein SirA  35.8 
 
 		 81 aa  52.4  0.000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3746  SirA family protein  34.78 
 
 		 74 aa  52.8  0.000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00371656  unclonable  0.000000591857 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0225  regulator of information in SirA family protein  35.9 
 
 		 78 aa  52  0.000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0861  SirA-like  42.03 
 
 		 75 aa  51.6  0.000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0962  SirA family protein  38.57 
 
 		 92 aa  51.6  0.000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.3564  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1959  redox protein regulator of disulfide bond formation-like  37.14 
 
 		 103 aa  51.6  0.000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0000373287  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1085  SirA family protein  39.13 
 
 		 77 aa  51.2  0.000004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2968  sulfur transfer protein SirA  37.33 
 
 		 83 aa  51.6  0.000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0282279  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1718  SirA family protein  37.68 
 
 		 81 aa  51.2  0.000005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0109  hypothetical protein  35.44 
 
 		 77 aa  50.8  0.000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1548  SirA family protein  36.76 
 
 		 80 aa  50.8  0.000006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.0325283 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4504  hypothetical protein  36.76 
 
 		 76 aa  50.8  0.000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000117975 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0110  hypothetical protein  35.44 
 
 		 77 aa  50.8  0.000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0105  hypothetical protein  35.44 
 
 		 77 aa  50.8  0.000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0026  SirA family protein  32.91 
 
 		 78 aa  50.8  0.000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000175689  normal  0.0503522 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0110  hypothetical protein  35.44 
 
 		 77 aa  50.8  0.000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0108  hypothetical protein  36.23 
 
 		 77 aa  50.4  0.000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0113  hypothetical protein  36.23 
 
 		 77 aa  50.4  0.000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4506  rhodanese domain protein  29.87 
 
 		 186 aa  50.4  0.000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000693639 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0112  hypothetical protein  36.23 
 
 		 77 aa  50.4  0.000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0021  sulfur transfer protein SirA  32.5 
 
 		 81 aa  50.4  0.000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.628095  hitchhiker  0.000000017124 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3882  SirA family protein  35.8 
 
 		 81 aa  50.4  0.000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0674  hypothetical protein  35.29 
 
 		 76 aa  50.4  0.000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.384362  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0019  sulfur transfer protein SirA  32.5 
 
 		 81 aa  50.1  0.000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04046  sirA protein  32.53 
 
 		 86 aa  50.4  0.000009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3754  sulfur transfer protein SirA  34.57 
 
 		 81 aa  50.1  0.000009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0029  redox protein regulator of disulfide bond formation  33.75 
 
 		 99 aa  50.4  0.000009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0748983  normal  0.0110056 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0013  sulfur transfer protein SirA  32.5 
 
 		 81 aa  50.4  0.000009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000182945 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0013  sulfur transfer protein SirA  32.5 
 
 		 81 aa  50.4  0.000009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0557081 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1672  SirA family protein  37.68 
 
 		 76 aa  50.4  0.000009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2098  SirA family protein  38.24 
 
 		 80 aa  49.7  0.00001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2572  SirA family protein  38.24 
 
 		 80 aa  49.7  0.00001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.410608  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0570  sulfur transfer protein SirA  33.75 
 
 		 84 aa  50.1  0.00001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0866  rhodanese domain-containing protein  29.17 
 
 		 186 aa  50.1  0.00001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0232  sulfur transfer protein SirA  33.75 
 
 		 84 aa  50.1  0.00001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3986  sulfur transfer protein SirA  33.75 
 
 		 84 aa  50.1  0.00001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1436  SirA family protein  37.68 
 
 		 81 aa  50.1  0.00001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.324916  normal  0.46012 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1134  hypothetical protein  39.13 
 
 		 75 aa  49.7  0.00001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00450728 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2399  SirA-like  47.17 
 
 		 74 aa  49.7  0.00001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.433209  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0830  rhodanese domain protein  30.56 
 
 		 186 aa  49.7  0.00001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00233764  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0811  SirA-like protein  39.73 
 
 		 75 aa  49.7  0.00001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0842772 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>